Le différence clé entre les sondes radioactives et non radioactives est que Les sondes radioactives sont des séquences d'ADN ou d'ARN simple brin qui sont marquées avec des isotopes radioactifs tandis que les sondes non radioactives sont des séquences d'ADN ou d'ARN à brin unique qui sont marquées avec une étiquette chimique ou une étiquette fluorescente.
L'hybridation de l'acide nucléique est une technique importante en biologie moléculaire, en particulier dans le diagnostic microbien. Il aide à identifier ou à détecter une séquence d'acide nucléique particulière. Dans cette technique, les acides nucléiques sont fixés à une surface solide et hybrides avec une sonde. Une sonde est un fragment d'ADN ou d'ARN qui est complémentaire à une séquence d'intérêt. Si la séquence cible est présente dans l'échantillon, la sonde s'hybridera avec elle et la rendra détectable. Il existe deux types de sondes comme sondes radioactives et non radioactives. Par conséquent, nous pouvons étiqueter les sondes avec une étiquette radioactive ou une balise fluorescente.
1. Aperçu et différence clé
2. Que sont les sondes radioactives
3. Que sont les sondes non radioactives
4. Similitudes entre les sondes radioactives et non radioactives
5. Comparaison côte à côte - Radioactive vs sondes non radioactives sous forme tabulaire
6. Résumé
Les sondes radioactives sont les fragments d'ADN ou d'ARN simple brin avec une balise radioactive. Les radio-isotopes sont utilisés pour préparer des sondes radioactives. Radio-isotopes 32P, 33P et 35S sont couramment utilisés dans l'étiquetage des sondes. De plus, radio-isotopes 3Main 1251 sont également utilisés dans une moindre mesure dans l'étiquetage des sondes. Mais ils sont utilisés pour des applications spécifiques. Parmi différents radio-isotopes, 32P est l'isotope le plus couramment utilisé pour étiqueter les sondes radioactives.
Les sondes radioactives offrent un degré de fiabilité et de spécificité plus élevé. Par conséquent, ils fournissent une sensibilité maximale et permettent une quantification précise des séquences cibles. Cependant, il existe plusieurs inconvénients associés aux sondes radioactives. Ils ont de courtes demi-vies. De plus, ils sont dangereux et la production, l'utilisation et l'élimination sont problématiques lors de la manipulation. De plus, la préparation de sonde radioactive est un processus coûteux. Par conséquent, en raison des problèmes de sécurité et du coût, les sondes radioactives ne sont pas utilisées comme sondes non radioactives de nos jours.
Les sondes non radioactives sont le deuxième type de sondes qui sont étiquetées chimiquement. La digoxigénine est une sonde non radioactive, qui est un marqueur basé sur des anticorps. Les sondes de digoxigénine sont spécifiques et sensibles. La biotine est une autre étiquette utilisée dans la préparation de sonde non radioactive. Les systèmes de biotine / streptavidine et digoxigénine / détection d'anticorps sont les sondes non radioactives les plus couramment utilisées en hybridation. De plus, le système de peroxydase de raifort est un autre système de sonde non radioactif. Une fois que ces sondes non radioactives sont hybrides avec les séquences cibles, elles peuvent être détectées via l'autoradiographie ou d'autres techniques d'imagerie.
Figure 01: Hybridation avec des sondes non radioactives
Les sondes non radioactives sont utilisées plus souvent dans l'hybridation d'acide nucléique que les sondes radioactives. En effet, les sondes non radioactives ne sont pas associées à des matières dangereuses. De plus, les méthodes de détection non radioactives nécessitent des temps d'exposition plus courts pour détecter le signal d'hybridation. Cependant, les étapes impliquées dans l'hybridation de l'ADN avec des sondes non radioactives sont généralement fastidieuses et prennent du temps. De plus, les solutions disponibles dans le commerce sont coûteuses.
Les sondes radioactives sont les séquences d'ADN ou d'ARN simple brin marquées avec des isotopes radioactifs, tandis que les sondes non radioactives sont les séquences d'ADN ou d'ARN à brin simple étiquetées avec une étiquette chimique. C'est donc la principale différence entre les sondes radioactives et non radioactives. De plus, les isotopes radioactifs sont dangereux. Par conséquent, les sondes radioactives sont considérablement dangereuses, tandis que les sondes non radioactives ne sont pas dangereuses.
De plus, une autre différence entre les sondes radioactives et non radioactives est leurs inconvénients. Les demi-vies courtes et les dangers associés à leur production, leur utilisation et leur élimination sont les inconvénients de l'utilisation de sondes radioactives. D'un autre côté, les étapes impliquées dans l'hybridation de l'ADN avec des sondes non radioactives sont généralement fastidieuses et prennent du temps.
L'infographie ci-dessous montre plus de comparaisons liées à la différence entre les sondes radioactives et non radioactives.
Une sonde est un fragment d'ADN ou d'ARN qui contient une séquence nucléotidique qui est complémentaire à la séquence d'intérêt. Afin de détecter la séquence cible, les sondes peuvent être étiquetées radioactivement, fluorescence ou chimiquement. Les sondes se lient avec des séquences complémentaires dans l'échantillon. Les sondes radioactives sont étiquetées avec des isotopes radioactifs tandis que les sondes non radioactives sont marquées avec de la biotine, de la digoxigénine ou de la peroxydase de raifort. Ainsi, c'est la principale différence entre les sondes radioactives et non radioactives.
1. «Sonde d'hybridation». En.Wikipédia.Org, 2020, disponible ici.
1. «Résultats de l'hybridation in situ des sondes chromosomiques X et Y BAC» par Joanne H. Hsu, Hui Zeng, Kalistyn H. Lemke, aris a. Polyzos, jlying f. Weier, Mei Wang, Anna R. Lawin-O'Brien, Heinz-ulrich G. Weier et Benjamin O'Brien - Joanne H. Hsu et al. «Répéties d'ADN spécifiques au chromosome: identification rapide dans le silico et validation à l'aide d'une hybridation in situ par fluorescence» Int. J. Mol. SCI. 2013, 14 (1), 57-71; doi: 10.3390 / IJMS14010057 (CC par 3.0) via Commons Wikimedia