Quelle est la différence entre les lignes et les sinus

Le Différence clé entre les lignes et les sinus Est-ce que les lignes (longs éléments nucléaires entrecoupés) sont un type de rétrotransposons plus longs non LTR tandis que les sinus (éléments nucléaires entrecoupés) sont un type de rétrotransposons non LTR beaucoup plus courts.

Les rétrotransposons non LTR ne contiennent pas de répétitions terminales longues (LTR). Cependant, ils contiennent des gènes pour la transcriptase inverse, la protéine de liaison à l'ARN, la nucléase et le domaine Ribonucléase H. Les rétrotransposons non LTR ont de courtes répétitions. Ces répétitions ont un ordre de bases inversé les uns à côté des autres. En dehors de cela, les rétrotransposons non LTR ont également des répétitions directes trouvées dans les transposons LRT.  Les rétrotransposons non-LTR se disent en deux catégories en tant que lignes et sinus.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Quelles sont les lignes 
3. Que sont les sinus
4. Similitudes - Lignes vs SINES
5. Lignes vs sinus sous forme tabulaire
6. Résumé

Quelles sont les lignes?

Les lignes (longs éléments nucléaires entrecoupés) sont des rétrotransposons non LTR plus longs. Ils sont répandus dans les génomes des eucaryotes. Ils compensent généralement 21.1% du génome humain. Chaque ligne est d'environ 7000 paires de bases longues. Les lignes peuvent transcrire en ARNm et se traduire en une protéine qui peut fonctionner comme une enzyme de transcriptase inverse. Cette transcriptase inverse produit des copies d'ADN des lignes RNA. Ces copies d'ADN peuvent être intégrées dans le génome d'un nouveau site.

Figure 01: lignes et sinus

Le génome humain n'a qu'une seule ligne abondante appelée ligne 1. L'élément de ligne 1 est d'environ 6000 paires de bases longues. Il y a environ 100 000 éléments tronqués de ligne 1 dans le génome humain. Une mutation aléatoire peut se produire en lignes. En raison de mutations aléatoires, les lignes peuvent dégénérer. Ils ne sont plus transcrits ou traduits. De plus, les lignes sont regroupées en cinq groupes principaux tels que L1, RTE, R2, I et Jockey. Ces cinq groupes subdivisent davantage en 28 autres clades.

Les lignes sont normalement propagées par un mécanisme appelé mécanisme de transcription inverse amorcé cible (TPRT). L'insertion de lignes provoque des maladies humaines comme l'hémophilie A, le cancer, les troubles mendéliens, etc. L'hypométhylation des lignes déclenche également certains types de cancer.

Que sont les sinus?

Les sinus (les éléments nucléaires courts entrecoupés) sont un type de rétrotransposons non LTR beaucoup plus courts. Ils ont environ 100 à 700 paires de bases de longueur. Les sinus sont également des éléments d'ADN qui s'amplifient dans les génomes eucaryotes par des intermédiaires d'ARN. Les sinus représentent environ 13% du génome des mammifères.  Les régions internes des sinus proviennent de l'ARNt. Il reste hautement conservé. Ils sont souvent présents dans de nombreuses espèces de vertébrés et d'invertébrés. La variation du nombre de copies et les mutations des sinus peuvent être incorporées pour construire la classification des espèces basée sur la phylogénie.

Les SINES peuvent être regroupés en trois types principaux: les core-sines, V-Sines et Amnsines. L'élément ALU est le sinus le plus commun chez les primates. De plus, il y a plus de 50 maladies humaines associées à l'insertion de sinus. Lorsqu'ils insérent à l'intérieur ou à proximité d'exons, ils peuvent provoquer une épissage inapproprié ou modifier le cadre de lecture. Cela conduit à des phénotypes de maladie tels que le cancer du sein, le cancer du côlon, la leucémie, l'hémophilie, la fibrose kystique, le cancer du côlon, la maladie de Dent, la neurofibromatose, etc.

Quelles sont les similitudes entre les lignes et les sinus?

• Lignes et SINES sont deux types de rétrotransposons non LTR.
• Les deux n'ont pas de régions terminales longues (LTR).
• Les deux ne sont principalement trouvés que chez les eucaryotes.
• Ils sont tous deux non autoniques.

Quelle est la différence entre les lignes et les sinus?

Les lignes sont des rétrotransposons non LTR plus longs, tandis que les sinus sont des rétrotransposons non LTR beaucoup plus courts. Donc, c'est la principale différence entre les lignes et les sinus. De plus, les lignes code pour l'enzyme de transcriptase inverse, tandis que Sine ne code pas pour l'enzyme de transcriptase inverse. Ainsi, c'est une autre différence entre les lignes et les sinus.

Plus de différences entre les lignes et les singes sont répertoriées ci-dessous sous forme tabulaire pour une comparaison côte à côte.

Résumé - Lignes vs SINES

Les rétrotransposons se trouvent principalement dans toutes les eucaryotes mais absents dans les procaryotes. Environ 37% du génome humain contient des rétrotransposons. Les rétrotransposons sont principalement deux types: les rétrotransposons LTR et non LTR. Les rétrotransposons non LTR ne contiennent pas de répétitions terminales longues (LTR), qui sont présentes dans les rétrotransposons LTR. Les rétrotransposons non LTR sont divisés en deux catégories: les lignes et les sinus. Les lignes sont des rétrotransposons non LTR plus longs, tandis que les sinus sont des rétrotransposons non LTR beaucoup plus courts. Ainsi, c'est le résumé de la différence entre les lignes et les sinus.

Référence:

1. «Retrotransposon.«Un aperçu | Sujets ScienceDirect.
2. Hancks, Dustin C., et haig h. Kazazien. «Rôles pour les insertions rétrotransposons dans les maladies humaines.»Mobile ADN, Biomed Central, 6 mai 2016.

Image gracieuseté:

1. «Line1s and Sines» par Mariuswalter - Propre travaux (CC By-SA 4.0) via Commons Wikimedia