Différence entre le gradient de saccharose et l'ultracentrifugation du coussin de saccharose

Différence entre le gradient de saccharose et l'ultracentrifugation du coussin de saccharose

Le différence clé entre le gradient de saccharose et l'ultracentrifugation du coussin de saccharose est que Dans l'ultracentrifugation du gradient de saccharose, un gradient de saccharose continu est utilisé, tandis que dans le coussin de saccharose ultracentrifugation, un gradient de saccharose discontinu est utilisé.

Le gradient de saccharose et l'ultracentrifugation du coussin de saccharose sont deux types similaires de techniques utilisées pour séparer les types spécifiques de macromolécules. Dans les deux techniques, un gradient de densité de saccharose est utilisé. Mais dans l'ultracentrifugation du gradient de saccharose, un gradient de densité continu est utilisé tandis que, dans le coussin de saccharose ultracentrifugation, un gradient de densité discontinu est utilisé.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que l'ultracentrifugation du gradient de saccharose
3. Qu'est-ce que l'ultracentrifugation du coussin de saccharose
4. Similitudes entre le gradient de saccharose et l'ultracentrifugation du coussin du saccharose
5. Comparaison côte à côte - gradient de saccharose vs ultracentrifugation du coussin de saccharose sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que l'ultracentrifugation du gradient de saccharose?

L'ultracentrifugation du gradient de saccharose est une technique qui peut être utilisée pour fractionner les macromolécules telles que l'ADN, l'ARN et les protéines. Il y a plusieurs étapes dans cette technique. Ce sont la préparation du gradient de saccharose, la centrifugation, la séparation et l'élution. La préparation du gradient est l'étape clé de cette technique. Dans cette technique, l'échantillon contenant des macromolécules de taille différente est superposé à la surface d'une colonne de gradient de saccharose. Lors de la centrifugation, des macromolécules de différentes tailles sédiments à travers la colonne de gradient de saccharose à des taux différents. La sédimentation dépend de plusieurs facteurs, notamment la force de centrifugation, la forme de taille et la densité des macromolécules, la densité et la viscosité du gradient. À la fin de la centrifugation, les macromolécules sont spatialement séparées par densité. Des macromolécules plus grandes (macromolécules à haute densité) sédiments vers le fond. Des plus légers (macromolécules à basse densité) restent au sommet du gradient. Par conséquent, les molécules se séparent en différentes bandes. Alors les bandes doivent être séparées et la purification de la macromolécule spécifique du saccharose doit être effectuée.

Figure 01: Ultracentrifugation du gradient de saccharose

Du côté de l'application, cette méthode est largement utilisée pour le fractionnement des molécules d'ADN. L'ultracentrifugation du gradient de saccharose est couramment utilisée pour caractériser la taille et la composition du complexe protéique. De plus, cette technique est utilisée pour la purification partielle de l'ARNm.

Qu'est-ce que l'ultracentrifugation du coussin de saccharose?

Le coussin de saccharose ultracentrifugation est une autre technique qui permet le fractionnement des macromolécules. Contrairement à l'ultracentrifugation de gradient de densité de saccharose, l'ultracentrifugation du coussin de saccharose utilise un gradient de densité discontinu. La concentration de saccharose augmente de haut en bas en étapes discrètes. Dans cette technique, la séparation est réalisée en plaçant l'extrait clarifié au-dessus d'un petit volume d'une solution de saccharose dans un tube à centrifugeuse, le soi-disant coussin de saccharose. Cela permet une meilleure séparation dans la centrifugation à grande vitesse. Lorsque les molécules se séparent comme une bande entre le coussin de saccharose, la bande blanche peut être collectée et purifiée. De plus, les impuretés peuvent être supprimées en utilisant la méthode du coussin de saccharose. La méthode du coussin de saccharose permet de remplir 60 à 70% du tube de l'échantillon. Par conséquent, la méthode du coussin de saccharose permet de traiter un plus grand volume d'échantillon.

Quelles sont les similitudes entre le gradient de saccharose et l'ultracentrifugation du coussin de saccharose?

  • Le gradient de saccharose et l'ultracentrifugation du coussin de saccharose sont deux techniques utilisées pour séparer un mélange de macromolécules.
  • Dans les deux méthodes, un gradient de saccharose est utilisé.
  • La centrifugation est une étape dans les deux méthodes.
  • Les molécules sédimentaires comme une bande ou une zone dans chaque méthode.

Quelle est la différence entre le gradient de saccharose et l'ultracentrifugation du coussin de saccharose?

Le gradient de saccharose ultracentrifugation est une technique qui utilise un gradient de saccharose continu dans le tube à centrifugeuse tandis que l'ultracentrifugation du coussin de saccharose est une technique qui utilise un gradient de saccharose discontinu. Ainsi, c'est la principale différence entre le gradient de saccharose et l'ultracentrifugation du coussin de saccharose.

De plus, l'ultracentrifugation du coussin de saccharose permet de traiter un plus grand volume de l'échantil.

Ci-dessous, l'infographie tabule plus de différences entre le gradient de saccharose et l'ultracentrifugation du coussin de saccharose.

Résumé - Gradient de saccharose vs ultracentrifugation du coussin de saccharose

Ultracentrifugation du gradient de saccharose sépare les macromolécules à l'aide d'un gradient de saccharose continu. En revanche, l'ultracentrifugation du coussin de saccharose utilise un gradient de saccharose discontinu afin de séparer le type spécifique de particules dans un mélange. C'est donc la principale différence entre le gradient de saccharose et l'ultracentrifugation du coussin de saccharose. La méthode du coussin de saccharose permet la collecte de particules morphologiquement intactes car elle ne provoque pas de stress mécanique, contrairement à l'ultracentrifugation du gradient de saccharose, qui écrase les molécules au fond du tube. De plus, l'ultracentrifugation du coussin de saccharose permet de traiter un plus grand volume de l'échantillon que l'ultracentrifugation du gradient de saccharose.

Référence:

1. Dijkstra, Jeanne et Cees P. de Jager. «Centrifugation de la densité.”SpringerLink, Springer, Berlin, Heidelberg, 1 janvier. 1998, disponible ici.

Image gracieuseté:

1. «Gradient de densité» - MLW3559 à Anglais WikiBooks. - Transféré de EN.WikiBooks aux communes. (CC BY-SA 2.5) Via Commons Wikimedia