Différence entre le poisson et CGH

Le différence clé entre le poisson et le CGH est que Le poisson est une technique moléculaire qui détecte une séquence d'ADN spécifique sur un chromosome à l'aide de sondes marquées par fluorescence, tandis que CGH est une autre technique cytogénétique moléculaire qui détecte les altérations de l'ADN génomique.

L'analyse cytogénétique joue un rôle important dans la médecine lors de la détection d'anomalies chromosomiques telles que les aneuploïdes, les suppressions, les duplications et les réarrangements, etc. Les anomalies chromosomiques entraînent finalement des maladies génétiques telles que le cancer, l'infertilité, le syndrome de Down, le syndrome de Klinefelter, le syndrome de Turner, la leucémie, etc. Il existe différentes méthodes cytogénétiques moléculaires pour détecter les défauts et les maladies mentionnées ci-dessus. Parmi eux, les poissons (hybridation fluorescente in situ) et CGH (hybridation génomique comparative) sont deux puissantes techniques d'hybridation. Cependant, les deux méthodes ont des avantages et des inconvénients.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que le poisson 
3. Qu'est-ce que CGH
4. Similitudes entre le poisson et le CGH
5. Comparaison côte à côte - Fish vs CGH sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que le poisson?

Le poisson est une technique d'hybridation de l'acide nucléique réalisée sur une partie ou une section de tissu, dans tout le tissu ou les cellules. C'est une méthode basée sur la sonde. La technique dépend de la théorie de l'appariement de base complémentaire de Watson Crick, résultant en hybrides d'ADN - ADN ou hybrides d'ADN - ARN, qui peuvent ainsi détecter les gènes mutés ou peut identifier le gène d'intérêt. De plus, cette technique utilise des séquences d'ADN simple brin, des séquences d'ADN double brin, des séquences d'ARN simple brin ou un oligonucléotide synthétique préparé en utilisant la traduction de nick comme des sondes complémentaires aux séquences de gènes d'intérêt. En outre, la caractéristique la plus importante de cette technique est le marquage des sondes avec des colorants de fluorescence. Ainsi, les sondes se lient aux parties complémentaires du chromosome et facilitent la détection.

De plus, le poisson est une méthode très sensible et spécifique. Par conséquent, c'est une technique courante dans la recherche et le diagnostic des tumeurs malignes hématologiques et des tumeurs solides. Mais, le poisson montre une faible résolution. Il nécessite également une connaissance préalable de l'anomalie cible pour concevoir des séquences de sonde.

Figure 01: poisson

Il existe de nombreuses applications de poissons, principalement dans le diagnostic moléculaire des maladies infectieuses pour identifier la présence d'agents pathogènes et confirmer l'agent pathogène via des diagnostics moléculaires. De plus, le poisson est une technique couramment utilisée dans les domaines de la biologie du développement, du caryotypage et de l'analyse phylogénétique et de la cartographie physique des chromosomes.

Qu'est-ce que CGH?

L'hybridation génomique comparative (CGH) est une autre technique cytogénétique moléculaire basée sur l'ADN qui peut détecter les altérations des séquences d'ADN génomique. La méthode est une méthode avancée qui peut analyser les modifications du chromosome et des gènes pour détecter les changements ou les altérations des séquences d'ADN génomique. De plus, CGH nécessite l'isolement et la fragmentation de l'ADN à partir de l'échantillon expérimental et de l'échantillon de référence. Ensuite, les échantillons doivent être étiquetés à l'aide de deux colorants fluorescents différents (généralement rouge et vert). Plus tard, les deux échantillons sont mitigés et autorisés pour une hybridation compétitive. La dernière étape est l'analyse des échantillons pour les modifications de l'ADN telles que la duplication de gènes, la perte de gènes, etc. En particulier, il mesure les différences de nombre de copies d'ADN entre l'échantillon de test et l'échantillon de contrôle.

Figure 02: CGH

Une autre version de CGH est maintenant disponible; C'est une méthode plus avancée que le CGH normal. C'est une technique appelée CGH ou ACGH basée sur Array. ACGH permet une identification précise des suppressions de gènes ou de séquences dans plusieurs milliers de séquences dans une seule expérience.

Quelles sont les similitudes entre le poisson et le CGH?

• Fish et CGH sont deux techniques moléculaires.
• Le poisson et le CGH comptent sur l'hybridation de l'acide nucléique.
• De plus, les deux techniques ont besoin de sondes conçues pour détecter des cibles d'ADN spécifiques.
• Nous les utilisons pour le diagnostic pré-natal et post-natal des maladies génétiques.
• De plus, les poissons et le CGH sont des outils très puissants pour étudier les altérations génomiques.
• Ils utilisent des colorants fluorescents pour étiqueter les sondes.

Quelle est la différence entre le poisson et le CGH?

Le poisson est un in situ Procédure d'hybridation qui utilise des sondes fluorescentes pour détecter des séquences d'ADN spécifiques, tandis que CGH est une technique d'hybridation moléculaire qui détecte les altérations des séquences d'ADN génomique. Donc, c'est la principale différence entre le poisson et le CGH.

De plus, les poissons nécessitent une connaissance préalable de l'anomalie cible pour concevoir des séquences de sonde, tandis que CGH ne nécessite pas de connaissances antérieures. De plus, une autre différence entre le poisson et le CGH est que le poisson présente une résolution limitée tandis que ACGH montre une haute résolution.

L'infographie ci-dessous résume la différence entre le poisson et le CGH.

Résumé - Fish vs CGH

Le poisson et le CGH sont deux techniques cytogénétiques moléculaires qui facilitent la détection des séquences de gènes d'intérêt. Le poisson facilite la détection d'une séquence d'ADN spécifique sur un chromosome à l'aide de sondes marquées par fluorescence tandis que CGH facilite la détection des altérations de l'ADN génomique. Donc, c'est la principale différence entre le poisson et le CGH.

Référence:

1. «Fluorescence in situ Hybridation (FISH)» Nature News, Nature Publishing Group, disponible ici.
2. Hester, Susan D, et al. «Comparaison des technologies comparées d'hybridation génomique sur les plateformes de puces à ADN.»Journal of Biomolécular Techniques: JBT, The Association of Biomolecular Resource Facilities, APR. 2009, disponible ici.

Image gracieuseté:

1. «Multiplex Viewrna Fish Assay in Jurkat and Hela Celles» par Ryan Jeffs - Propre travaux (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. «CGH Schema» par Mbaudis (Talk) (Uploads) - Propre travaux (CC par 2.5) Via Commons Wikimedia