Il est important d'avoir une connaissance générale de la composition et de la structure de l'ADN afin de comprendre la différence entre l'ADN en amont et en aval. L'ADN est composé de chaînes polynucléotidiques. Les nucléotides sont les éléments constitutifs qui créent des chaînes de polynucléotides et chaque nucléotide est fabriqué à partir de trois composants: un sucre à cinq carbones, une base azotée et un groupe de phosphate. Un groupe de phosphate et un groupe OH sont attachés à un carbone de 5 'en position et à une position de 3' en carbone de la molécule de sucre dans un nucléotide, respectivement. Les nucléotides sont réunis par des liaisons phosphodiester formées entre le groupe phosphate 5 'd'un nucléotide et un groupe OH 3' du nucléotide adjacent. Si une chaîne polynucléotide a un groupe phosphate 5 'libre, il est attribué comme l'extrémité 5'; S'il a un groupe gratuit de 3 'OH, il est attribué comme une extrémité 3'. Par conséquent, les brins d'ADN ont généralement des extrémités de 5 'et 3' en fonction des positions finales des chaînes polynucléotidiques. L'ADN existe également sous forme de forme double brin. Deux brins sont antiparallèles les uns aux autres. Par conséquent, l'ADN a deux brins qui coulent vers 5 'à 3' direction et 3 'à 5' Direction. L'ADN en amont et en aval est référé en référence à la transcription et à la synthèse de 5 'à 3' brin d'ARNm. Si l'ADN est considéré vers l'extrémité des 5. Si l'ADN est considéré vers l'extrémité 3 'à partir du brin de codage du site d'initiation de la transcription est connu sous le nom d'ADN en aval. C'est la principale différence entre l'ADN en amont et en aval.
CONTENU
1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que l'ADN en amont
3. Qu'est-ce que l'ADN en aval
4. Comparaison côte à côte - ADN en amont vs en aval
5. Résumé
Un gène est une hérédité d'unité structurelle et fonctionnelle qui est située sur l'ADN d'un organisme. Il est stocké avec des instructions pour construire une protéine. Le gène a une région spécifique d'une molécule d'ADN. En cas de besoin, il transcrit et se traduit par une protéine via la synthèse d'un brin d'ARNm. Normalement, un brin de codage du gène passe de 5 'à 3' direction. Lorsqu'il est transcrit, il produit un brin d'ARNm dans la même direction 5 'à 3'. Pendant la transcription, le brin antisens de 3 'à 5' est servi comme brin de matrice et initie la synthèse de l'ARNm. Il y a un site d'initiation de transcription dans le gène. En ce qui concerne le site d'initiation de la transcription, la région d'ADN vers l'extrémité 5 'du brin de codage est connue sous le nom d'ADN en amont. Un promoteur du gène est normalement situé dans la région en amont de l'ADN. Dans les gènes eucaryotes, il y a des boîtes Tata, des éléments proximaux promoteurs et des amplificateurs dans la zone en amont du gène. La région en amont du gène est référée avec des nombres négatifs. L'ADN en amont d'un gène est de la plus haute importance pour la transcription.
Le site d'initiation de la transcription est connu comme +1 point d'un gène. La région d'ADN de +1 point vers l'extrémité 3 'du brin de codage est connue sous le nom d'ADN en aval. En d'autres termes, en aval du gène provient du site d'initiation de la transcription vers l'extrémité 5 'du brin de modèle. Par conséquent, l'ADN en aval d'une région de gène comprend l'unité transcriptionnelle et d'autres séquences telles que la séquence de terminateurs. Le promoteur peut influencer la séquence en aval d'un gène. La partie en aval d'un gène est référée avec des nombres positifs. L'ADN en aval d'un gène est la région réelle qui donne le produit protéique.
Figure 01: ADN en amont et en aval
ADN en aval en amont vs en aval | |
La région d'ADN vers l'extrémité 5 'de la séquence codante du site d'initiation de la transcription est connue sous le nom d'ADN en amont. | La région d'ADN vers l'extrémité 3 'du brin de codage du site d'initiation de la transcription est connue sous le nom d'ADN en aval. |
Éléments | |
Les promoteurs et les amplificateurs sont situés sur l'ADN en amont | L'unité de transcription et les séquences Terminator sont situées dans l'ADN en aval. |
Numérotage | |
Les nucléotides dans la région en amont sont référés avec des nombres négatifs | Les nucléotides sont référés avec des nombres positifs. |
Fonction | |
Cette région contient des éléments nécessaires pour réguler et initier la transcription | Cette région contient des instructions pour produire une protéine et terminer la transcription |
Il est facile d'identifier en amont et en aval d'un brin d'ARN. En ce qui concerne le site de référence, la région vers l'extrémité 5 'du brin d'ARN est connue sous le nom d'ARN en amont alors que la région vers l'extrémité 3' est connue sous le nom d'ARN en aval. Cependant, dans l'ADN, il y a deux volets qui fonctionnent dans les deux directions 5 «à 3» et 3 «à 5». Par conséquent, la différence entre l'ADN en amont et en aval est compliquée. Par conséquent, il est différencié en référence à la transcription d'un gène. Du site d'initiation de la transcription vers l'extrémité des 5 du brin de sens, la région de l'ADN est connue sous le nom d'ADN en amont alors que du site d'initiation de la transcription vers l'extrémité 3 'du brin de sens est connu sous le nom d'ADN en aval. C'est la différence entre en amont et en aval de l'ADN.
Les références:
1. Rhee, Amy C., Benjamin H. Somerlot, Neeta Parimi et Jonatha M. Gott. «Rôles distincts pour les séquences en amont et en aval des sites physiques.»ARN. Cold Spring Harbor Laboratory Press, sept. 2009. la toile. 18 mars. 2017
Image gracieuseté:
1. Barbosa, Cristina, Isabel Peixeiro et Luísa Romão. «Régulation de l'expression des gènes par les cadres de lecture ouverts en amont et les maladies humaines.”PLOS Genetics. Bibliothèque publique des sciences, n.d. la toile. 18 mars. 2017.