Différence entre shRNA et siRNA

shRNA vs siRNA

Pendant le processus d'interférence de l'ARN (ARNi), l'expression d'un gène cible est renversée avec une spécificité élevée et une sélectivité. L'ARNi est un processus naturel, et il implique un petit ARN interférant (siRNA) et de l'ARN en épingle à cheveux courte (shRNA) et ShRNA bifonctionnel. Actuellement, l'ARNi est largement utilisé comme outil de thérapie par cancer personnalisée. Les applications de l'ARNi se font essentiellement avec les molécules de shRNA à double brin synthétisées chimiquement. Bien que ces deux molécules aient des résultats fonctionnels similaires, ils diffèrent dans leur structure; Ainsi, les mécanismes moléculaires d'action, les voies d'ARN et les effets hors cible de ces deux molécules diffèrent également.

shRNA

Le shRNA est une séquence de petite molécule d'ARN qui fait un virage en épingle à cheveux serrée qui peut être utilisée pour faire taire une expression de gène cible pendant l'ARNi. L'expression de shRNA est obtenue par un vecteur, qui peut être un virus ou une bactérie ou par la livraison de plasmides. Ils sont synthétisés dans le noyau des cellules et transportés vers le cytoplasme pour d'autres processus. Ces molécules ont des voies de maturation similaires de miARN; Ainsi, la synthèse du miARN a fourni les bases de la compréhension de la synthèse shRNA. ARN polymérase II ou III peut transcrire le shRNA par l'ARN polymérase II ou les promoteurs III. L'avantage de l'utilisation des shRNA est qu'ils ont un taux de dégradation et de chiffre d'affaires relativement bas. L'inconvénient est qu'il a besoin d'un vecteur d'expression, qui peut entraîner certains problèmes de sécurité.

siRNA

Les siRNA sont des molécules d'ARN à double brin composées de 20 à 25 paires de bases de longueur. Ceux-ci sont utilisés pour la suppression des gènes en faisant taire tout gène avec une séquence nucléotidique complémentaire dans la voie d'ARNi. Le knockdown du gène par transfection de siRNA est souvent infructueux en raison de l'effet transitoire; surtout dans les cellules divisées rapidement et la suppression ne dure pas plus longtemps. Pour surmonter ce problème, le siRNA est modifié en introduisant une structure en épingle à cheveux courte. Cette molécule modifiée alors connue sous le nom de shRNA. ShRNA doit être converti en siRNA par un dicer afin de procéder à sa fonction normale.

Quelle est la différence entre shRNA et siRNA?

• Contrairement à la siRNA, ShRNA a une structure en épingle à cheveux supplémentaire. ShRNA est une version modifiée de siRNA.

• ShRNA nécessite un vecteur d'expression, alors que l'ARNsi ne.

• Le shRNA peut être utilisé pour le knockdown à long terme tandis que l'ARNsi ne peut être utilisé que pour le knockdown à court terme des gènes.

• Contrairement à la suppression des gènes de siRNA, la suppression de ShRNA est durable et si elle est insérée via un vecteur viral approprié, il peut produire des effets de silençage des gènes permanents.

• Dicer est nécessaire pour convertir le shRNA en molécule siRNA afin d'exécuter ses fonctions normales.