Différence entre la protéomique et la métabolomique

Le différence clé entre la protéomique et la métabolomique est que La protéomique est l'étude de toutes les protéines d'un organisme tandis que la métabolomique est l'étude de tous les métabolites d'un organisme.

La génomique est l'étude de la composition génétique d'un organisme. La protéomique et la métabolomique sont deux sciences omiques liées à la génomique. Le protéome fait référence à toutes les protéines d'une cellule ou d'un organisme. Le métabolome, en revanche, fait référence à tous les métabolites d'un organisme. Ainsi, l'étude du protéome est la protéomique tandis que l'étude du métabolome est la métabolomique. La protéomique et la métabolomique sont importantes dans les diagnostics de la maladie et dans la caractérisation et le dépistage des organismes. De plus, les deux sont connectés dans de nombreux aspects de la biologie cellulaire, en particulier dans la signalisation cellulaire, la dégradation et la génération des protéines et la modification post-traductionnelle.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que la protéomique
3. Qu'est-ce que la métabolomique
4. Similitudes entre la protéomique et la métabolomique
5. Comparaison côte à côte - Protéomique vs métabolomique sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que la protéomique?

Le protéome est le complément total de protéines dans une cellule, un tissu ou un organisme. Par conséquent, la protéomique est l'étude du protéome d'un organisme. En protéomique, différentes caractéristiques des protéines sont analysées. Par conséquent, la protéomique se concentre principalement sur la structure, l'orientation, les fonctions, les interactions protéiques, les modifications, les applications et l'importance des protéines. C'est pourquoi de nombreux projets de recherche sont menés dans le domaine de la protéomique à l'heure actuelle.

Les premières études protéomiques ont été effectuées pour identifier la teneur en protéines dans Escherichia coli. La cartographie de la teneur totale en protéines a été effectuée en utilisant des gels bidimensionnels (2D). Après le succès de ce projet, les scientifiques ont évolué à caractériser la teneur totale en protéines chez les animaux tels que les cochons d'Inde et les souris. À l'heure actuelle, la cartographie des protéines humaines se fait en utilisant une électrophorèse sur gel 2D.

Il existe de nombreux avantages à étudier la protéomique car les protéines sont les molécules régissant la plupart des activités en raison de la propriété catalyseur des protéines. Ainsi, l'étude des protéines entières peut fournir des informations concernant l'état de santé d'un organisme. De plus, la protéomique a de nombreuses applications dans l'annotation du génome, l'identification et les diagnostics de la maladie, effectuant des études d'expression des protéines pendant l'expérimentation et les modifications des protéines et les études d'interaction, etc.

Figure 01: Protéomique

Il existe différentes techniques impliquées dans la protéomique, notamment l'extraction de la protéine totale, la séparation d'eux en utilisant l'électrophorèse sur gel 2D, le séquençage des protéines extraites en utilisant des méthodes telles que la méthode de séquençage d'Edmund ou la spectrométrie de masse et l'analyse des propriétés structurelles et fonctionnelles de la protéine en utilisant la protéine en utilisant outils logiciels et bioinformatiques sur ordinateur.

Qu'est-ce que la métabolomique?

La métabolomique est l'étude de tous les métabolites dans une cellule, un tissu ou un organisme. Il comprend l'identification et la quantification des métabolites cellulaires en utilisant différents outils d'analyse et statistique avancés. La métabolomique est une étude importante car elle révèle des informations concernant le métabolisme d'un organisme.

Figure 02: Métabolomique

Pour étudier les substrats et les produits des réactions métaboliques, la métabolomique utilise la spectrométrie de masse comme plate-forme analytique. La spectrométrie de masse entraîne des métabolites et leurs concentrations, reflétant l'état biochimique réel des cellules ou des tissus. Par conséquent, la métabolomique peut être considérée comme la meilleure représentation du phénotype moléculaire d'un organisme. En plus de cela, la métabolomique peut être considérée comme une extension de la protéomique car la plupart des métabolites sont générés en raison des activités des enzymes qui sont des protéines.

Quelles sont les similitudes entre la protéomique et la métabolomique?

• La protéomique et la métabolomique sont deux sciences omiques liées à la génomique.
• La métabolomique peut être considérée comme une extension de la protéomique.
• Le protéome et le métabolome sont étroitement liés à de nombreuses études.

Quelle est la différence entre la protéomique et la métabolomique?

La protéomique est l'étude à grande échelle des protéines, y compris leur structure et leur fonction, dans une cellule ou un organisme. Pendant ce temps, la métabolomique est l'étude des profils de métabolites dans une cellule, un tissu ou un organisme dans un ensemble donné de conditions. C'est donc la principale différence entre la protéomique et la métabolomique. En outre, la protéomique concerne principalement l'ensemble complet des protéines tandis que la métabolomique concerne principalement l'ensemble complet de métabolites, y compris une gamme diversifiée de petites molécules telles que les peptides, les glucides, les lipides, les nucléosides et les produits cataboliques de composés exogènes, etc. Par conséquent, c'est une autre différence entre la protéomique et la métabolomique.

L'infographie ci-dessous résume la différence entre la protéomique et la métabolomique.

Résumé - Protéomique vs métabolomique

Les organismes vivants peuvent être étudiés en utilisant leur génome, leurs protéines et leurs métabolites. La génomique, la protéomique et la métabolomique sont les trois domaines qui étudient la composition génétique, les protéines et les métabolites d'une cellule ou d'un organisme, respectivement. La protéomique est importante car il s'agit d'un reflet dynamique des deux gènes et de l'environnement. La métabolomique est très importante car elle reflète directement l'état actuel de la réaction biochimique des cellules ou le statut métabolique d'un organisme. Ainsi, cela résume la différence entre la protéomique et la métabolomique.

Référence:

1. P, Surat. «Comment le métabolome et le protéome sont-ils liés?”News, 26 février. 2019, disponible ici.
2. Horgan, Richard P et Louise C Kenny. «Sac Review« Omic »Technologies: génomique, transcriptomique, protéomique et métabolomique.»Obstetrics and Gynecology, John Wiley & Sons, Ltd (10.1111), 18 juillet 2011, disponible ici.

Image gracieuseté:

1. «Protéomics» par xxl7441 chez les wikibooks anglais - transférés à partir de EN.WikiBooks aux communes. (Domaine public) via Commons Wikimedia
2. «Schéma de métabolomique» par LMAPS (Talk) - J'ai créé ce travail entièrement par moi-même (CC By-SA 3.0) via Commons Wikimedia