Différence entre l'extraction de l'ADN végétal et animal

Le différence clé entre l'extraction de l'ADN végétal et animal est que Dans l'extraction de l'ADN végétal, il est nécessaire de briser la paroi cellulaire en broyant le tissu dans de la glace sec ou de l'azote liquide afin de libérer le contenu cellulaire lors de l'extraction de l'ADN animal, il n'est pas nécessaire d'effectuer cette étape puisque les cellules animales n'ont pas une paroi cellulaire.

L'ADN génomique est le matériel génétique des cellules végétales et animales. L'ADN génomique est unique à chaque plante ou animal individuel. L'extraction d'ADN de l'ADN de bonne qualité est la condition préalable à la recherche moléculaire. L'ADN des organismes est extrait pour l'identification, le diagnostic des maladies, la détection de gènes et de séquences spécifiques, des objectifs médico-légaux, des tests de paternité, un séquençage du génome et le développement de médicaments, etc. La méthode d'extraction d'ADN varie en fonction du type de cellules - qu'il s'agisse d'une cellule animale ou d'une cellule végétale.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que l'extraction de l'ADN végétal
3. Qu'est-ce que l'extraction de l'ADN animal
4. Similitudes entre l'extraction de l'ADN végétal et animal
5. Comparaison côte à côte - Extraction végétale vs ADN animal sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que l'extraction de l'ADN végétal?

L'ADN dans les cellules végétales est extrait pour diverses études moléculaires. Il est nécessaire d'extraire l'ADN génomique intact et pur. Par conséquent, il existe différents types de protocoles d'extraction d'ADN qui sont différents des protocoles d'extraction d'ADN des cellules animales. En effet.

L'extraction se fait généralement en broyant les tissus végétaux dans de la glace sèche ou de l'azote liquide à l'aide d'un mortier et d'un pilon. Ensuite, les membranes cellulaires sont perturbées et le contenu cellulaire est retiré dans un tampon d'extraction. Cela se fait généralement à l'aide d'un détergent; SDS (sodium dodécyl sulfate) ou tampon CTAB (bromure de cétyltriméthylammonium). L'ADN libéré est protégé des nucléases endogènes à l'aide d'un agent chélatant tel que l'EDTA. De plus, les protéines sont séparées de l'ADN en utilisant du chloroforme ou du phénol.

Figure 01: Extraction de l'ADN végétal

Les plantes synthétisent les polysaccharides et les polyphénols, y compris les flavonoïdes et autres métabolites secondaires. Ces composés interfèrent avec l'extraction de l'ADN génomique pur. Par conséquent, la plupart des protocoles d'extraction de l'ADN végétal impliquent une autre étape, comme la technique du gradient de densité de chlorure de césium pour éliminer ces composés.

La plupart des protocoles d'extraction d'ADN recommandent d'utiliser des échantillons de feuilles fraîches pour l'extraction d'ADN. Certaines méthodes n'incluent pas les produits chimiques dangereux tels que l'azote liquide et le phénol. Le protocole CTAB (cétyl triméthylammonium bromure) est un protocole d'extraction de l'ADN végétal populaire qui facilite l'extraction de l'ADN génomique végétal de haute qualité.  Il s'agit d'une méthode simple, sûre, fiable et rentable pour l'extraction de l'ADN des plantes. La plupart des autres méthodes sont des versions modifiées de la méthode CTAB.

Qu'est-ce que l'extraction de l'ADN animal?

L'extraction de l'ADN animal est l'extraction de l'ADN génomique des cellules animales pour l'analyse moléculaire. Contrairement à l'extraction de l'ADN végétal, la dégradation de la paroi cellulaire n'est pas nécessaire pour les cellules animales car elles manquent d'une paroi cellulaire. Les cellules sanguines sont le type de cellules animales les plus courantes qui sont utilisées à diverses fins.

Figure 02: Extraction d'ADN

La méthode phénol-chloroforme est l'un des meilleurs choix pour les cellules sanguines. Le rendement et la qualité de l'ADN sont élevés lors de l'extraction de l'ADN de cette méthode. Il s'agit d'un protocole d'extraction d'ADN liquide-liquide, et cette méthode sépare les molécules d'ADN sur la base de leur solubilité dans des solutions non miscibles. Le phénol, le chloroforme et l'alcool isoamylique sont les trois principaux ingrédients de cette méthode.

Quelles sont les similitudes entre l'extraction de l'ADN végétal et animal?

• Pendant l'extraction de l'ADN végétal et animal, les membranes cellulaires doivent être perturbées.
• L'ADN doit être protégé des nucléases endogènes.
• De plus, le cisaillement de l'ADN doit être empêché.
• Des kits commerciaux sont disponibles pour l'extraction de l'ADN végétal et de l'ADN animal.
• La plupart des méthodes d'extraction de l'ADN végétal et animale nécessitent une modification et une normalisation continues.

Quelle est la différence entre l'extraction de l'ADN végétal et animal?

La principale différence entre l'extraction de l'ADN végétal et animal est que l'extraction de l'ADN végétal nécessite le broyage du tissu végétal dans la glace sec ou l'azote liquide afin de briser la paroi cellulaire tandis que l'extraction de l'ADN animal ne nécessite pas cette étape car les cellules animales n'ont pas de paroi cellulaire. La méthode CTAB est l'une des meilleures méthodes pour l'extraction de l'ADN végétal tandis que la méthode phénol-chloroforme est l'une des meilleures méthodes pour l'extraction de l'ADN animal.

Ci-dessous infographie tabule les différences entre l'extraction de l'ADN végétal et animal.

Résumé - Extraction de l'ADN de la plante vs

Différentes méthodes sont disponibles pour l'extraction de l'ADN à partir de différents types de cellules. Par conséquent, les protocoles d'extraction de l'ADN végétal diffèrent des protocoles d'extraction de l'ADN des cellules animales. L'extraction de l'ADN végétal nécessite la perturbation de la paroi cellulaire, de la membrane cellulaire et de la membrane nucléaire tandis que l'extraction de l'ADN animal nécessite la dégradation de la membrane cellulaire et de la membrane nucléaire. Plus important encore, l'extraction de l'ADN des cellules animales ne nécessite pas la perturbation des parois cellulaires en broyant de la glace sèche ou de l'azote liquide. Ainsi, c'est la principale différence entre l'extraction de l'ADN végétal et animal.

Référence:

1. «Extraction d'ADN au chloroforme au phénol: bases, préparation de produits chimiques et protocole.»Genetic Education, 10 janvier. 2020, disponible ici.
2. Aljanabi, L. Oubliez, et al. «Extraction de l'ADN génomique de haute qualité à partir de différents ordres de plantes appliquant une méthode basée sur CTAB modifiée.”Bulletin du National Research Center, Springeropen, 1er janvier. 1999, disponible ici.

Image gracieuseté:

1. "Laboratoire de science. Extraction d'ADN d'une banane »par Manolacamboni - propre travail (CC par 4.0) via Commons Wikimedia
2. «Figure 17 01 02» par CNX OpenStax - (CC par 4.0) via Commons Wikimedia