Différence entre CRISPR et CRISPR CAS9

Le différence clé entre CRISPR et CRISPR CAS9 est que CRISPR (récompense régulièrement une répétition palindromique courte entre intervenue) est un mécanisme de défense immunitaire procaryote naturel, tandis que CRISPR CAS9 est une nucléase Cas9 guidée par l'ARN qui fait partie du système immunitaire adaptatif CRISPR.

CRISPR est un système immunitaire de défense antiviral trouvé dans les bactéries et les archées. C'est une famille de séquences d'ADN trouvées dans le génome bactérien. Il se compose de séquences d'espaceur dérivées de fragments d'ADN de bactériophages qui les avaient précédemment infectés. Dans les infections virales ultérieures, les bactéries utilisent ces séquences pour détruire l'ADN viral. Les séquences CRISPR ont de courtes répétitions palindromiques et des séquences d'espaceur. De plus, les séquences d'espaceur de répétition CRISPR ont souvent des gènes associés qui code pour les protéines CAS. Cas9 est une endonucléase guidée par l'ARN. Avec les séquences CRISPR, la protéine Cas9 agit comme un système immunitaire adaptatif dans les bactéries contre les bactériophages.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que CRISPR 
3. Qu'est-ce que CRISPR CAS9
4. Similitudes entre CRISPR et CRISPR CAS9
5. Comparaison côte à côte - CRISPR VS CRISPR CAS9 sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que CRISPR?

Crispr représente Répéties palindromiques courtes régulièrement entreposées régulièrement. C'est un groupe de séquences d'ADN trouvées dans le génome bactérien. Il fonctionne comme un mécanisme de défense naturel dans les bactéries, et il a d'abord été identifié dans E. coli. Dans les bactéries, il agit comme une protection immunitaire adaptative, en particulier contre les bactériophages. Par conséquent, c'est un mécanisme spécifique à la séquence.

Figure 01: CRISPR

Le système CRISPR contient plusieurs séquences de répétition d'ADN à segment court. Ces répétitions sont palindromiques, ayant la même séquence de base lors de la lecture de 5 'à 3' tandis que l'autre donne la même séquence lors de la lecture de 3 'à 5'.  De plus, les répétitions sont identiques. Ils sont situés entre de courtes séquences d'ADN «entre espaceur» qui ne sont pas identiques. Mais ces séquences d'ADN d'espaceur sont similaires ou correspondantes à l'ADN de bactériophage étranger. Les gènes associés à CRISPR sont connus sous le nom de gènes associés à CRISPR ou de gènes CAS. Les gènes CAS code pour les protéines CAS qui sont des hélicases ou des nucléases. Les hélicases déroulent l'ADN tandis que les nucléases coupent l'ADN. Dans l'ensemble, lorsque l'on considère le CRISPR, il s'agit d'un système immunitaire de bactéries qui fonctionne contre les bactériophages (bactéries infectant les virus).

Qu'est-ce que CRISPR CAS9?

CAS9 ou CRISPR Associated Protein 9 est une endonucléase bactérienne guidée par l'ARN. Par conséquent, c'est une enzyme qui reconnaît et coupe l'ADN cible (en particulier l'ADN de bactériophage) complémentaire de l'ARN guide. Il effectue un clivage spécifique au brin. La protéine Cas9 est codée par un gène associé CRISPR. CRISPR CAS9 est le système de nucléase CRISPR-CAS9 guidé par l'ARN qui peut être utilisé comme une plate-forme de ciblage et d'édition d'ADN à ADN pour l'ARN pour l'édition du génome, la perturbation transcriptionnelle, la modulation épigénétique et l'imagerie du génome. Ce système CRISPR CAS9 est très populaire dans les systèmes d'édition du génome actuels.

Figure 02: CRISPR CAS9

À l'heure actuelle, le système CRISPR / CAS9 est utilisé pour modifier ou modifier le génome des mammifères par répression de transcription ou activation. Les cellules de mammifères peuvent répondre aux ruptures d'ADN médiatisées CRISPR / CAS9 en adoptant un mécanisme de réparation. Cela peut être fait en utilisant la méthode d'adhésion à l'extrémité non homologue (NHEJ) ou une réparation dirigée par l'homologie (HDR). Ces deux mécanismes de réparation ont lieu en introduisant des pauses à double brin. Il en résulte une modification des gènes des mammifères. NHEJ peut conduire à l'ablation des mutations génétiques et peut être utilisée pour créer une perte d'effets de fonction. HDR peut être utilisé pour introduire des mutations ponctuelles spécifiques ou introduire des segments d'ADN de longueur variable. À l'heure actuelle, le système CRISPR / CAS est utilisé dans les domaines des applications thérapeutiques, biomédicales, agricoles et de recherche.

Quelles sont les similitudes entre CRISPR et CRISPR CAS9?

• Cas9 fait partie du système CRISPR CAS.
• Crisper Cas9 System est un système immunitaire que l'on trouve naturellement dans les bactéries.

Quelle est la différence entre CRISPR et CRISPR CAS9?

CRISPR est un groupe de séquences d'ADN trouvées dans le génome bactérien qui fonctionne comme un système de défense naturel contre les bactériophages. Il se compose de répétitions palindromiques courtes régulièrement inter-aies, d'espaceurs et de gènes associés. En revanche, Cas9 est une protéine 9 associée à CRISPR, qui est une enzyme d'endonucléase guidée par l'ARN. Il reconnaît et clive à DNA double brins de virus. En fait, cela fait partie du système de défense CRISPR. C'est donc la principale différence entre CRISPR et CRISPR CAS9.

Résumé - CRISPR VS CRISPR CAS9

Le système CRISPR CAS est un système de défense microbienne. CRISPR est un groupe de séquences d'ADN composées de répétitions courtes palindromiques, de séquences d'espaceur et de gènes associés. Cas9 est une protéine CAS qui est une endonucléase guidée par l'ARN. La protéine CRISPR et CAS9 fabrique un système immunitaire qui fonctionne contre les infections aux bactériophages chez les bactéries. La protéine CAS9 est capable de cliver l'ADN viral étranger et de les perturber. CRRNA guide CAS9 pour reconnaître l'ADN viral. Par conséquent, le système CRISPR CAS9 est un système immunitaire naturel trouvé dans les bactéries contre les virus. Ainsi, c'est le résumé de la différence entre CRISPR et CRISPR CAS9.

Référence:

1. Jiang, Fuguo. «Structures et mécanismes CRISPR-CAS9." Revues annuelles, Disponible ici.

Image gracieuseté:

1. «4qyz.”Par Boghog - Propre travaux (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia
2. «GRNA-CAS9» 'par Marius Walter - Propre travaux (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia