Différence entre la réparation d'excision de base et la réparation d'excision nucléotidique

Différence clé - Réparation d'excision de base vs réparation d'excision nucléotidique
 

L'ADN est fréquemment soumis à des dommages en raison de divers facteurs internes et externes. Cependant, les systèmes de réparation cellulaire sont immédiatement et constamment corriger les dommages avant de devenir des mutations ou avant d'être transférés en générations suivantes. Il existe trois types de systèmes de réparation d'excision dans les cellules: la réparation d'excision nucléotidique (NER), la réparation d'excision de base (BER) et la réparation de l'inadéquation de l'ADN (MMR) pour réparer. La principale différence entre la réparation d'excision de base et la réparation d'excision nucléotidique est que La réparation de l'excision de base est un système de réparation simple qui fonctionne dans les cellules pour réparer les dommages en un seul nucléotide causés de manière endogène alors que La réparation d'excision nucléotidique est un système de réparation complexe qui fonctionne dans les cellules pour réparer des régions relativement plus grandes et endommagées provoquées de manière exogène.

CONTENU
1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que la réparation d'excision de base
3. Qu'est-ce que la réparation d'excision nucléotidique
4. Comparaison côte à côte - Réparation d'excision de base vs réparation d'excision nucléotidique
5. Résumé

Qu'est-ce que la réparation d'excision de base?

La réparation d'excision de base est la version la plus simple du système de réparation d'ADN que les cellules ont. Il est utilisé pour réparer les dommages mineurs dans l'ADN. Les bases d'ADN sont modifiées en raison de la désamination ou de l'alkylation. Lorsqu'il y a des dommages de base, l'ADN glycosylase reconnaît et active le système de réparation d'excision de base et la récupére. Les étapes suivantes sont impliquées dans le système BER.

1. Reconnaissance et élimination d'une base incorrecte ou endommagée par une glycosylase d'ADN pour créer un site abasique (sites de perte de base -apiurinique ou sites apyrimidiniques).
2. Incision du site abasique par une endonucléase apurinique / apyrimidinique
3. Élimination du fragment de sucre restant par une lyase ou une phosphodiestérase
4. Remplissage d'écart par une ADN polymérase
5. Scellant du nick par une ligase ADN

Figure 01: voie de réparation d'excision de base

Qu'est-ce que la réparation d'excision nucléotidique?

La réparation d'excision nucléotidique (NER) est un important système de réparation d'excision d'ADN dans les cellules. Il est capable de réparer et de remplacer les régions endommagées jusqu'à 30 bases de longueur et elle est dirigée par le brin de modèle en bon état. Des dommages à l'ADN commun sont survenus en raison du rayonnement ultraviolet et NER protège l'ADN en réparant ces dommages immédiatement avant de devenir des mutations et de passer dans les générations futures ou de provoquer des maladies. NER offre spécifiquement une protection contre les mutations causées indirectement par des facteurs exogènes tels que les cancérogènes environnementaux et chimiques. NER est vu dans presque tous les organismes, et il reconnaît les dommages qui provoquent une distorsion importante dans l'hélice d'ADN.

Le processus NER implique l'action de nombreuses protéines telles que XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB, etc. et procède via plusieurs mécanismes de coupe et de pâte. Ces protéines sont essentielles pour l'achèvement du processus de réparation, et un défaut dans l'une des protéines NER est vital et peut provoquer des syndromes récessifs rares: Xeroderma pigmentosum (XP), le syndrome de Cockayne (CS) et la forme photosensible du trouble des cheveux frappeux trichothothystrophie (TTD).

Figure 02: Réparation d'excision nucléotidique

Quelle est la différence entre la réparation d'excision de base et la réparation d'excision nucléotidique?

Résumé - Réparation d'excision de base vs réparation d'excision nucléotidique

Ner et ber sont deux types de processus de réparation d'excision de l'ADN trouvés dans les cellules. BER est capable de réparer de petits dommages causés de manière endogène tandis que NER est capable de réparer les régions de dommages jusqu'à 30 de la longueur de la paire de bases causées principalement par de manière exogène. BER diffère du NER dans les types de substrats reconnus et dans l'événement de clivage initial. Le BER peut également reconnaître les dommages qui n'ont pas été causés par des distorsions significatives dans l'hélice d'ADN tandis que NER reconnaît des distorsions significatives de l'hélice d'ADN. C'est la différence entre la réparation d'excision de base et l'excision nucléotidique.

Image gracieuseté:
1. «ADN Repair Base Excersion en» par LadyOfhats - (Domaine public) via Commons Wikimedia
2. «Une représentation schématique de modèles pour la voie de réparation d'excision des nucléotides contrôlée par les protéines UVR» de Rihito Morita, Shuhei Nakane, Atsuhiro Shimada, Masao Inoue, Hitoshi Iino, Taisuke Wakamatsu, Kenji Fukui, Noriko Nakagawa, Ryoji Masui, et Seiki-Kuramisi CC par 1.0) via Commons Wikimedia

Les références:
1. Kim, Yun-Jeong et David M. Wilson. «Aperçu de la biochimie de réparation d'excision de base.”Pharmacologie moléculaire actuelle. U.S. Bibliothèque nationale de médecine, Jan. 2012. la toile. 14 mars. 2017.
2. Boer, Jan de et Jan H.J. Hoeijmakers. «Réparation d'excision nucléotidique et syndromes humains.”Carcinogenèse. Oxford University Press, 01 mars. 2000. la toile. 28 mars. 2017
3. Hoogstraten et al. «Détection polyvalente des dommages à l'ADN par la protéine de réparation d'excision nucléotidique du génome global XPC.»Journal of Cell Science. The Company of Biologists Ltd, 01 septembre. 2008. la toile. 28 mars. 2017