Quelle est la différence entre le xylène cyanol et le bleu bromophénol
Le différence clé entre le xylène cyanol et le bleu bromophénol est que dans un gel d'agarose à 1%, le xylène cyanol migre plus lentement, tandis que le bleu bromophénol migre plus rapidement.
Le xylène cyanol et le bleu bromophénol sont importants comme les marqueurs de couleur qui peuvent être utilisés pour surveiller le processus d'électrophorèse sur gel d'agarose et d'électrophorèse sur gel de polyacrylamide.
CONTENU
1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que le xylène cyanol
3. Qu'est-ce que le bleu bromophénol
4. Xylène cyanol vs bleu bromophénol sous forme tabulaire
5. Résumé - xylène cyanol vs bromophénol bleu
Qu'est-ce que le xylène cyanol?
Le xylène cyanol est un marqueur de couleur électrophorétique ou un colorant de suivi. Il est utile pour surveiller le processus d'électrophorèse sur gel d'agarose et d'électrophorèse sur gel de polyacrylamide. Lorsque cette substance est mélangée avec l'échantillon, la concentration de cette substance devient généralement environ 0.005% à 0.03%. Certains synonymes que nous pouvons utiliser pour le xylène cyanol comprennent le bleu acide 147, le xylène cyanole, le xylène cyanol FF, le xylène cyanole FF, etc.
La formule chimique de ce composé est C25H27N2Nao6S2. La masse molaire du xylène cyanol est 538.61 g / mol. Cette substance peut migrer à un rythme d'environ 4 à 5 kilobases paires de fragments d'ADN dans des gels d'agarose à 1%. Cependant, cela dépend du tampon que nous utilisons. En règle générale, le cyanol de xylène sur le gel de polyacrylamide à 6% peut migrer à une vitesse d'environ 140 fragments d'ADN de paire de bases. D'un autre côté, il peut migrer dans une électrophorèse sur gel de polyacrylamide dénaturant à 20% à un rythme de 25 bases oligonucléotide.
Le nombre de donneurs de liaison hydrogène du xylène cyanol est de 2 m et le nombre d'accepteurs de liaisons hydrogène est 8. Le nombre de liaisons rotatifs de ce composé peut être donné comme 7. La complexité du xylène cyanol peut être décrite comme 1120 degrés. Il a un nombre de stéréocentres de liaison définis de 1.
Qu'est-ce que le bleu bromophénol?
Le bleu bromophénol est un indicateur de pH utile qui est utile comme marqueur de couleur électrophorétique et un colorant. Il a le nom chimique 3 ', 3 ”, 5', 5” -Tetrabromophénolsulfonphthalein, BPB. La formule chimique de ce composé est C19HdixBR4O5S. La masse molaire de ce composé est 669.96 g / mol. Il est inodore, et sa densité peut être donnée comme 2.2 g / ml. Son point de fusion est de 273 degrés Celsius, et son point d'ébullition est de 279 degrés Celsius. Nous pouvons le préparer en ajoutant lentement l'excès de brome à une solution chaude de phénolsulfonphthaléine dans l'acide acétique glaciaire.
Le bleu bromophénol est utile comme indicateur acide-base dans la plage entre pH 3.0 à 4.6. Il est capable de passer du jaune à pH 3.0 à pH 4.6. De plus, c'est une réaction réversible. Structurellement, le bleu bromophénol est similaire à la phénolphtaleine.
En outre, nous pouvons l'utiliser comme marqueur de couleur pour surveiller le processus d'électrophorèse sur gel d'agarose et d'électrophorèse sur gel de polyacrylamide. Cette substance peut porter une charge négative à un pH modéré, où elle peut migrer dans le même sens que l'ADN ou la protéine dans un gel. Le taux de migration peut varier en fonction de la densité de gel et de la composition du tampon. Cependant, dans un gel d'agarose à 1% typique dans un tampon TAE TAE ou un tampon TBE, cette substance migre au même rythme qu'un fragment d'ADN d'environ 300 paires de bases.
Quelle est la différence entre le xylène cyanol et le bleu bromophénol?
Le xylène cyanol et le bleu bromophénol sont des marqueurs de couleur importants. La principale différence entre le xylène cyanol et le bleu bromophénol est que dans le gel d'agarose à 1%, le xylène cyanol migre plus lentement, tandis que le bleu bromophénol migre plus rapidement.
Vous trouverez ci-dessous un résumé de la différence entre le xylène cyanol et le bleu bromophénol sous forme tabulaire pour une comparaison côte à côte.
Résumé - xylène cyanol vs bromophénol bleu
Le xylène cyanol et le bleu bromophénol sont importants car les marqueurs de couleur utilisés pour surveiller le processus d'électrophorèse sur gel d'agarose et d'électrophorèse sur gel de polyacrylamide. La principale différence entre le xylène cyanol et le bleu bromophénol est que dans le gel d'agarose à 1%, le xylène cyanol migre plus lentement tandis que le bleu bromophénol migre plus rapidement.
Référence:
1. «Xylène cyanole FF." Centre national d'information sur la biotechnologie. Base de données de composés PubChem, U.S. Bibliothèque nationale de médecine.
Image gracieuseté:
1. «Xylencyanol» par Kopiersperre - Propre travaux (domaine public) via Commons Wikimedia
2. «Bromophénol Blue» par Panoramix303 - Propre travaux (domaine public) via Commons Wikimedia
