Quelle est la différence entre MLVA et MLST

Le différence clé Entre MLVA et MLST est que MLVA utilise le polymorphisme des séquences d'ADN répétées en tandem pour caractériser les espèces microbiennes, tandis que MLST utilise le polymorphisme des séquences d'ADN des fragments internes de plusieurs gènes d'entretien ménager pour caractériser les espèces microbiennes.

Le typage microbien est normalement utilisé pour déterminer la source et les routes des infections. Il confirme ou exclut les épidémies. Le typage microbien retrace également la transmission croisée des agents pathogènes associés aux soins de santé et reconnaît les souches virulentes. De plus, le typage microbien évalue l'efficacité des mesures témoins des espèces microbiennes pathogènes. MLVA et MLST sont deux techniques biologiques moléculaires utilisées dans le typage microbien.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que MLVA 
3. Qu'est-ce que MLST
4. Similitudes - MLVA et MLST
5. Mlva vs mlst sous forme tabulaire
6. Résumé - MLVA VS MLST

Qu'est-ce que MLVA?

Analyse VNTR plusieurs loci (MLVA) est une méthode biologique moléculaire qui utilise le polymorphisme des séquences d'ADN répétées en tandem pour caractériser les espèces microbiennes. C'est une méthode utilisée pour l'analyse génétique de particuliers d'espèces microbiennes.

Au cours de la première étape de MLVA, chaque locus VNTR ciblé est amplifié par PCR avec des amorces spécifiques à la région flanquantes. Ensuite, les fragments obtenus sont séparés par électrophorèse sur un séquenceur capillaire. Le génotypage de chaque locus et les résultats compilés à partir de chaque échantillon permettent de caractériser un micro-organisme dont l'espèce est connue. Il permet également d'identifier les sous-espèces par le biais de typage des allèles et de comparaison avec les bases de données MLVA.

Figure 01: MLVA

Cette méthode MLVA est plus sélective que la méthode MLST. De plus, la méthode MLVA ne nécessite pas de pas de séquençage d'ADN. Ainsi, il permet de différencier les sous-espèces étroites ou les espèces clonales.

Qu'est-ce que MLST?

Typage de séquence multilocus (MLST) est une technique qui utilise le polymorphisme des séquences d'ADN des fragments internes de plusieurs gènes d'entretien ménager pour caractériser les espèces microbiennes. MLST est une technique en analyse génétique pour le typage de plusieurs loci.

Figure 02: MLST

Il s'agit d'un type de frappe de séquençage utilisé comme technique de référence pour distinguer différentes souches d'espèces microbiennes. Cette méthode est basée sur le séquençage des gènes ménagères. Les gènes d'entretien ménager codent normalement les protéines essentielles des agents microbiens tels qu'une bactérie. Ces séquences de gènes d'entretien ménager ont la particularité de présenter un polymorphisme stable au fil du temps. Par conséquent, les différences de séquences de gènes d'entretien ménager sont suffisantes pour distinguer les souches les unes des autres. De plus, le premier schéma MLST à développer était Neisseria Meningitidis, l'agent causal de la méningite méningococcique et de la septicémie. Depuis son introduction, MLST a été utilisé non seulement pour les agents pathogènes humains mais aussi pour les agents pathogènes des plantes.

Quelles sont les similitudes entre MLVA et MLST?

• MLVA et MLST sont deux techniques biologiques moléculaires utilisées dans le typage microbien.
• Les deux techniques peuvent être utilisées pour l'analyse phylogénétique microbienne.
• Les deux techniques sont basées sur le polymorphisme génétique.
• Ils peuvent être utilisés pour la détection des maladies humaines provoquant des agents pathogènes microbiens.
• Les deux techniques doivent être effectuées par des biologistes moléculaires qualifiés.

Quelle est la différence entre MLVA et MLST?

MLVA est une technique qui utilise le polymorphisme des séquences d'ADN répétées en tandem pour caractériser les espèces microbiennes. Pendant ce temps, MLST est une technique qui utilise le polymorphisme des séquences d'ADN des fragments internes de plusieurs gènes d'entretien ménager pour caractériser les espèces microbiennes. Ainsi, c'est la principale différence entre MLVA et MLST. De plus, la méthode MLVA est plus sélective que la méthode MLST.

L'infographie ci-dessous présente les différences entre MLVA et MLST sous forme tabulaire pour une comparaison côte à côte.

Résumé - MLVA VS MLST

MLVA et MLST sont deux techniques biologiques moléculaires utilisées dans le typage microbien. MLVA utilise le polymorphisme des séquences d'ADN répétées en tandem pour caractériser les espèces microbiennes, tandis que MLST utilise le polymorphisme des séquences d'ADN des fragments internes de plusieurs gènes d'entretien ménager pour caractériser les espèces microbiennes. Donc, c'est la principale différence entre MLVA et MLST.

Référence:

1. «Analyse de répétition en tandem variable multiple de locus (MLVA).»Centers for Disease Control and Prevention, Centers for Disease Control and Prevention, 16 février. 2016.
2. «Typage de séquence multilocus.«Un aperçu | Sujets ScienceDirect.

Image gracieuseté:

1. «1993 48 Kameido Isolate Genotype» (CC0) via Picryl
2. «FMICB-04-00414-G001 (14424086445)» par des figures de phylogénie - FMICB-04-00414-G001 (CC par 2.0) via Commons Wikimedia