Quelle est la différence entre les éléments transposables de classe I et de classe II

Le Différence clé entre les éléments transposables de classe I et de classe II Est-ce que les éléments transposables de classe I sont des rétrotransposons, tandis que les éléments transposables de classe II sont des transposons d'ADN.

Un élément transposable est une séquence d'ADN qui peut changer sa position dans le génome. Parfois, il crée et inverse les mutations. Il peut également modifier l'identité génétique et la taille du génome de la cellule. Ce processus entraîne souvent la duplication du même matériel génétique. L'élément transposable a été découvert pour la première fois par Barbara McClintock, et elle a remporté le prix Nobel pour sa découverte en 1983. Les éléments transposables peuvent être classés en deux classes en fonction de leur mécanisme de transposition: des éléments transposables de classe I et de classe II.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Quels sont les éléments transposables de classe I
3. Quels sont les éléments transposables de classe II
4. Similitudes - Éléments transposables de classe I et de classe II
5. Classe I vs Éléments transposables de classe II sous forme tabulaire
6. Résumé

Quels sont les éléments transposables de classe I?

Les éléments transposables de classe I sont des rétrotransposons. Retrotransposon est un type de composant génétique qui copie et se colle dans différents emplacements génomiques en convertissant l'ARN en ADN par un processus appelé transcription inverse. Ce processus est catalysé par l'enzyme de transcriptase inverse. Retrotransposon utilise normalement un intermédiaire de transposition d'ARN. Les éléments transposables de classe I sont généralement copiés en deux étapes. Tout d'abord, ils sont transcrits de l'ADN à l'ARN. Ensuite, l'ARN produit est ensuite transcrit inverse à l'ADN. Plus tard, cet ADN copié est inséré dans le génome à une nouvelle position. Les caractéristiques des rétrotransposons sont très similaires au rétrovirus tels que le VIH.

Figure 01: élément transposable de classe I

Les rétrotransposons peuvent être divisés en trois types.

1. Rétrotransposons avec des répétitions à long terme (LTR), qui code pour la transcriptase inverse,
2. Les rétrotransposons avec de longs éléments nucléaires entrecoupés (ligne) qui codent pour la transcriptase inverse mais manquent de LTR et sont transcrits par l'ARN polymérase II,
3. Les rétrotransposons avec de courts éléments nucléaires entrecoupés (sinus) qui ne codent pas pour la transcriptase inverse et sont transcrits par l'ARN polymérase III.

De plus, en raison d'un mécanisme similaire avec les rétrotransposons, le rétrovirus peut également être considéré comme des éléments transposables.

Quels sont les éléments transposables de classe II?

Les éléments transposables de classe II sont des transposons d'ADN. Les éléments transposables de classe II ont un mécanisme de transposition coupé et coller qui n'implique pas un intermédiaire d'ARN. La transposition est catalysée par plusieurs enzymes transposases. Ces enzymes peuvent se lier spécifiquement ou non spécifiquement à l'ADN. La transposase fait une coupe échelonnée au site cible de l'ADN qui produit des extrémités collantes. Ensuite, ceux-ci découpent des transposons d'ADN en ligates dans d'autres sites cibles.

Figure 02: Éléments transposables de classe II

Habituellement, l'ADN polymérase comble les lacunes résultantes des extrémités collantes et l'ADN ligase ferme le squelette du sucre-phosphate.  De plus, cette transposition entraîne une duplication du site cible. Les sites d'insertion des transposons d'ADN peuvent être identifiés par des répétitions courtes et directes suivies de répétitions inversées. Mais tous les transposons d'ADN ne présentent pas un mécanisme de transposition de coupe et de pâte. Par exemple, certains transposons montrent une transposition réplicative dans laquelle les transposons se reproduisent sur un nouveau site cible.

Similitudes entre les éléments transposables de classe I et de classe II

1. Les éléments transposables de classe I et de classe II sont des éléments de génétique mobile ou des gènes de saut.
2. Les deux peuvent changer leur position dans le génome.
3. Ils sont composés de séquences d'ADN.
4. Ce sont des éléments génétiques égoïstes.
5. Ils sont très importants dans la fonction génomique et l'évolution.

Différence entre les éléments transposables de classe I et de classe II

Les éléments transposables de classe I sont des rétrotransposons, tandis que les éléments transposables de classe II sont des transposons d'ADN. C'est donc la principale différence entre les éléments transposables de classe I et de classe II. De plus, les éléments transposables de classe I utilisent des intermédiaires d'ARN dans le mécanisme de transposition. D'un autre côté, les éléments transposables de classe II utilisent des intermédiaires d'ADN dans le mécanisme de transposition.

L'infographie suivante compile les différences entre les éléments transposables de classe I et la classe II sous forme tabulaire pour une comparaison côte à côte.

Résumé - Éléments transposables de classe I vs Classe II

Les éléments transposables sont appelés éléments génétiques mobiles ou saut. Ce sont des séquences d'ADN. Les éléments transposables sont classés en deux classes en fonction de leur mécanisme de transposition en tant qu'éléments transposables de classe I et de classe II. Les éléments transposables de classe I sont des rétrotransposons, tandis que les éléments transposables de classe II sont des transposons d'ADN. Ainsi, c'est la principale différence entre les éléments transposables de classe I et de classe II.

Référence:

1. «9.6: Classes d'éléments transposables.”Biology LibreTexts, LibreTexts.
2. Wessler, Susan R. «Éléments transposables et évolution des génomes eucaryotes.»PNAS, Académie nationale des sciences.

Image gracieuseté:

1. «Retrotransposons» de Mariuswalter - Propre travaux (CC By-SA 4.0) via Commons Wikimedia
2. «Éléments transposables (2)» par Arvid Ågren et Andrew G. Clark - (CC par 2.5) Via Commons Wikimedia