Différence entre le séquençage du génome entier et le séquençage de l'exome

Le différence clé entre le séquençage du génome entier et le séquençage de l'exome est que le séquence de séquençage du génome entier tout le génome d'un organisme tandis que l'exome séquençait les séquences uniquement l'exome ou les gènes codant pour les protéines d'un organisme.

Le séquençage est une technique qui détermine l'ordre précis des nucléotides dans une molécule d'ADN particulière. Il reflète simplement l'ordre correct des quatre bases; adénine (a), guanine (g), cytosine (c) et thymine (t) dans un fragment d'ADN. Il existe plusieurs méthodes de séquençage telles que le séquençage Sanger, le séquençage de nouvelle génération, etc. De plus, soit le génome complet d'un organisme (séquençage du génome entier), soit seuls les gènes codant pour les protéines dans le génome (séquençage de l'exome) peuvent subir un séquençage.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que le séquençage du génome entier
3. Qu'est-ce que le séquençage de l'exome
4. Similitudes entre le séquençage du génome entier et le séquençage de l'exome
5. Comparaison côte à côte - séquençage du génome entier vs séquençage de l'exome sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que le séquençage du génome entier?

Le génome humain contient près de trois milliards de paires de bases d'ADN. Le séquençage du génome entier est une méthode qui séquence le génome complet d'un organisme. Par conséquent, dans le séquençage du génome entier, la considération concerne toute la collection de molécules d'ADN, y compris les exomes, les introns, les espaces intergéniques, etc. De plus, l'ensemble des séquences de séquençage du génome non seulement le génome qui réside à l'intérieur du noyau mais aussi l'ADN mitochondrial.

Figure 01: Séquençage du génome entier

Lors de la préparation de ce séquençage, la première étape consiste à extraire tout l'ADN. Ensuite, l'ADN extrait subit la procédure de séquençage à l'aide d'une méthode de séquençage appropriée. En analysant les séquences résultantes, en utilisant un outil de bioinformatique, nous pouvons découvrir les maladies rares, le cancer, les maladies infectieuses, etc.

Qu'est-ce que le séquençage de l'exome?

L'exome fait partie du génome qui contient environ 1.5% du génome, et c'est la collection d'exons. Les exons sont les séquences qui se transcrivent en ARNm puis au produit protéique final. Par conséquent, les séquences de séquençage de l'exome l'ensemble des séquences de codage des protéines dans le génome. Le séquençage de l'exome révèle les troubles génétiques car la plupart des troubles génétiques surviennent en raison des mutations des gènes codant pour les protéines. Par conséquent, les processus diagnostiques des troubles génétiques utilisent fréquemment le séquençage de l'exome comme méthode pour diagnostiquer la maladie. De plus, en comparant l'application de séquençage du génome entier pour les tests génétiques, le séquençage de l'exome prend moins de temps à utiliser et est moins coûteux.

Figure 02: séquençage d'exome

Dans le séquençage de l'exome, il est d'abord nécessaire de sélectionner uniquement les séquences codantes de protéines de l'ADN total. Notez que les humains ont environ 180000 séquences codant pour les protéines. Ensuite, l'exome est séquencée à l'aide d'une méthode de séquençage à haut débit.

Quelles sont les similitudes entre le séquençage du génome entier et le séquençage de l'exome?

• Le séquençage du génome entier et le séquençage de l'exome sont deux applications du séquençage.
• Les deux méthodes sont utiles pour déterminer l'ordre correct de la séquence nucléotidique dans les deux méthodes.
• De plus, la bioinformatique aide les deux techniques à analyser les données.

Quelle est la différence entre le séquençage du génome entier et le séquençage de l'exome?

Séquences de séquençage du génome entier L'ADN entier du génome d'un organisme, tandis que les séquences de séquençage de l'exome ne font que les séquences codantes des protéines du génome. Par conséquent, c'est la différence fondamentale entre le séquençage du génome entier et le séquençage de l'exome. De plus, bien que les deux méthodes soient largement utilisées pour déterminer l'ordre correct de la séquence nucléotidique, le séquençage du génome entier est coûteux et prend du temps que le séquençage de l'exome.

L'infographie ci-dessous tabule la différence entre le séquençage du génome entier et le séquençage de l'exome.

Résumé - Séquençage du génome entier vs séquençage de l'exome

Le séquençage révèle l'ordre précis des bases dans un fragment d'ADN et il peut être soit un séquençage du génome entier, soit un séquençage d'exome. Ici, l'ensemble du séquençage du génome séquentie le génome complet d'un organisme tandis que les séquences de séquençage de l'exome ne font que les séquences codant pour les protéines dans le génome. Compte tenu de leurs applications, l'ensemble du séquençage du génome est utile pour analyser les aberrations génétiques telles que les variations de nucléotides, les suppressions, les insertions, etc. dans son génome entier tandis que le séquençage de l'exome est utile pour détecter les maladies génétiques. Par conséquent, c'est la différence entre le séquençage du génome entier et le séquençage de l'exome.

Référence:

1.«Génome entier vs. Séquençage d'exome entier vs. Panneaux de séquençage ciblés.”Healio, Slack Incorporated. Disponible ici  
2.«Quel sont le séquençage de l'exome entier et le séquençage du génome entier? - Référence de la maison génétique - NIH."U.S. Bibliothèque nationale de médecine, National Institutes of Health. Disponible ici  

Image gracieuseté:

1.«Séquençage de fusil de chasse entier en génome contre séquençage hiérarchique de fusil de chasse» par Commins, J., Toft, c., Tarifs, m. UN. - «Méthodes de biologie informatique et leur application à la génomique comparative des bactéries symbiotiques endocellulaires d'insectes.»(CC BY-SA 2.5) Via Commons Wikimedia  
2.«Film de travail de séquençage de l'exome 1a» par Sarahkusala - propre travail, (CC par 3.0) via Commons Wikimedia