Différence entre la sérine et la tyrosine recombinase

Le différence clé entre la sérine et la tyrosine recombinase est que dans sérine recombinase, la sérine est l'acide aminé nucléophile utilisé par l'enzyme pour attaquer l'ADN pendant la recombinaison spécifique au site, Pendant que dans la tyrosine recombinase, la tyrosine est l'acide aminé nucléophile utilisé par l'enzyme pour attaquer l'ADN pendant la recombinaison spécifique au site.

La recombinaison spécifique au site (recombinaison conservatrice spécifique au site) est un type de technique de recombinaison génétique où l'échange de brins d'ADN se déroule entre les segments ayant un certain degré d'homologie de séquence. Les recombinases spécifiques au site régulent le processus de recombinaison spécifique au site. Ces enzymes sont regroupées en deux familles en tant que famille de la sérine recombinase et famille de la tyrosine recombinase. Les noms proviennent des résidus d'acides aminés nucléophiles conservés présents dans les deux classes ci-dessus de recombinases qui sont utilisées pour attaquer l'ADN et qui lui est lié de manière covalente pendant l'échange de brin dans la recombinaison spécifique au site.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que la sérine recombinase
3. Qu'est-ce que la Tyrosine Recombinase
4. Similitudes entre la sérine et la tyrosine recombinase
5. Comparaison côte à côte - sérine vs recombinase de tyrosine sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que la sérine recombinase?

Dans la méthode de recombinaison spécifique au site, deux séquences d'ADN courtes («sites cibles») sont coupées à des points spécifiques dans les deux brins, et les extrémités de coupe sont rejoints à de nouveaux partenaires. Les technologies de recombinaison spécifiques au site sont des outils génomiques en génie génétique qui dépendent des enzymes de recombinase pour remplacer la section cible de l'ADN. De nombreux systèmes de recombinaison spécifiques au site se sont avérés effectuer ces réarrangements d'ADN à différentes fins. Mais toutes ces enzymes de recombinase appartiennent à deux familles. La recombinase de la sérine est l'une d'entre elles. Ils peuvent médier jusqu'à trois types de réarrangements d'ADN: intégration, excision et inversion.

Figure 01: sérine recombinase

Les recombinases spécifiques au site comme la sérine recombinase effectuent un réarrangement d'ADN en reconnaissant et en se liant à une courte séquence d'ADN (site cible), au cours de laquelle ils clivent la squelette d'ADN. Plus tard, l'échange de deux hélices d'ADN se produit et se réjouit des brins d'ADN a lieu. Dans la sérine recombinase, la sérine est l'acide aminé qui est utilisé par l'enzyme pour attaquer l'ADN pendant la recombinaison spécifique au site. Pendant le clivage de l'ADN, la liaison protéine-ADN est formée via une réaction de transestérification. La liaison phosphodiester est remplacée par la liaison de phosphosérine entre le groupe 5'phosphate au site de clivage et le groupe hydroxyle d'un résidu de sérine conservé. La nouvelle obligation stocke l'énergie qui dépense de l'ADN clivage sur le site cible. Cette énergie est ensuite utilisée pour rejoindre l'ADN au groupe hydroxyle désoxyribose correspondant sur l'autre site. Des exemples de recombinases de sérine sont les résolvases / invertases de sérine et les intégrases de sérine.

Qu'est-ce que la Tyrosine Recombinase?

La recombinase de tyrosine est l'autre classe enzymatique qui régule la recombinaison conservatrice du site spécifique. Comme décrit précédemment, la tyrosine recombinase effectue également un réarrangement de l'ADN de la même manière en reconnaissant et en se liant à une séquence d'ADN courte (site cible), où ils clivent. Plus tard, l'échange de deux hélices d'ADN et la rejoignage des brins d'ADN ont lieu.

Figure 02: Recombinase de la tyrosine

Mais dans la recombinase de la tyrosine, la tyrosine est l'acide aminé qui est utilisé par l'enzyme pour attaquer l'ADN pendant la recombinaison spécifique au site. La caractéristique commune de cette classe est un résidu de tyrosine nucléophile conservé attaquant le phosphate d'ADN scissile pour former une liaison de 3'-phosphotyrosine. Les recombinases de tyrosine (A1) et les intégrases de la tyrosine (A2) sont les groupes d'enzymes proéminents dans la famille des enzymes de la recombinase de la tyrosine.

Quelles sont les similitudes entre la sérine et la tyrosine recombinase?

• Ils sont une classe d'enzymes de recombinase.
• Les deux régulent la recombinaison spécifique au site.
• Ce sont des protéines.
• La réaction chimique de base est la même pour les deux.
• Les deux catalyser les réactions de transestérification.

Quelle est la différence entre la sérine et la tyrosine recombinase?

Dans la sérine recombinase, la sérine est l'acide aminé nucléophile qui est utilisé par l'enzyme pour attaquer l'ADN pendant la recombinaison spécifique au site. D'un autre côté, dans la tyrosine recombinase, la tyrosine est l'acide aminé nucléophile qui est utilisé par l'enzyme pour attaquer l'ADN pendant la recombinaison spécifique au site. C'est donc la principale différence entre la sérine et la tyrosine recombinase. La caractéristique commune de la sérine recombinase est qu'elle forme une liaison phosphosérine avec l'ADN, tandis que la tyrosine recombinase forme une liaison de phosphotyrosine avec l'ADN pendant le processus de recombinaison spécifique au site.

L'infographie ci-dessous répertorie les différences entre la sérine et la tyrosine recombinase sous forme tabulaire.

Résumé - sérine vs tyrosine recombinase

La recombinaison peut se produire entre des molécules similaires d'ADN comme dans les homologues recombinaison ou molécules différentes comme dans la recombinaison non-homologues. La recombinaison spécifique au site est un type de recombinaison génétique dans laquelle l'échange de brins d'ADN se déroule entre les segments ayant au moins un certain degré d'homologie de séquence. Il est catalysé par les recombinases. La plupart des recombinases sont regroupées en deux familles: la sérine recombinase et la tyrosine recombinase. La sérine recombinase utilise la sérine comme acide aminé nucléophile pour attaquer l'ADN pendant le processus de recombinaison spécifique au site. La tyrosine recombinase utilise la tyrosine comme acide aminé nucléophile pour attaquer l'ADN pendant le processus de recombinaison spécifique au site. Par conséquent, c'est la principale différence entre la sérine et la tyrosine recombinase.

Référence:

1. «Recombination spécifique au site.»Wikipedia, Wikimedia Foundation, 30 déc. 2020, disponible ici.
2. Grindley, Nigel D.F. «Mécanismes de recombinaison spécifique au site.»Avis annuels, disponibles ici.

Image gracieuseté:

1. «Surot» par Juergen Bode - Propre travaux (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia

2. «STSWAP» par Juergen Bode - Propre travaux (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia