Différence entre RAPD et RFLP

Différence clé - RAPD vs rflp
 

Des marqueurs génétiques sont utilisés en biologie moléculaire pour identifier les variations génétiques entre les individus et les espèces. ADN polymorphe amplifié aléatoire (Rapd) et Polymorphisme de longueur de fragment de restriction (RFLP) sont deux marqueurs moléculaires importants systématiquement utilisés dans les laboratoires. RAPD est réalisé avec des amorces d'oligonucléotides courtes et arbitraires, et elle est basée sur l'amplification aléatoire des emplacements multiples à travers l'ADN de l'organisme de l'organisme.  Le RFLP est effectué avec une endonucléase de restriction spécifique, et il est basé sur le polymorphisme des fragments de restriction résultants et l'hybridation. La principale différence entre RAPL et RFLP est que RAPD est un type de technique de PCR effectuée sans la connaissance de la séquence antérieure alors que RFLP n'est pas impliqué dans la PCR et nécessite des connaissances de séquence antérieure pour effectuer la technique.

CONTENU
1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que RAPD
3. Qu'est-ce que RFLP
4. Comparaison côte à côte - RAPD vs rflp
5. Résumé

Qu'est-ce que RAPD?

RAPD est un marqueur moléculaire utile en biologie moléculaire. C'est une technique rapide et facile. RAPD peut être défini comme une méthode qui se traduit par des séquences d'ADN polymorphes en raison d'une amplification aléatoire de plusieurs emplacements du modèle d'ADN cible. RAPD utilise des amorces d'oligonucléotides courtes avec des séquences arbitraires pour l'amplification PCR. Les amorces sont synthétisées artificiellement sans la connaissance de la séquence antérieure. Par conséquent, il est considéré comme une technique facile et utile.

Les étapes majeures suivantes sont impliquées dans RAPD.

1. Extraction de l'ADN cible
2. Amplification des plusieurs emplacements de l'ADN cible à l'aide d'amorces choisies au hasard
3. Électrophorèse sur gel des produits de PCR amplifiés
4. Coloration au bromure d'éthidium et identification du polymorphisme

En raison de la variation du recuit d'amorce, différents fragments avec différentes longueurs sont générés pendant l'amplification. Par conséquent, les modèles de bandes sur les gels sont différents entre les individus et les espèces. Ainsi, RAPD permet la détection de la variation génétique entre les organismes dans l'identification et la différenciation.

RAPD est appliqué dans diverses études de biologie moléculaire telles que l'identification de la différence génétique entre les espèces étroitement apparentées, la cartographie des gènes, l'empreinte digitale de l'ADN, l'identification des maladies héréditaires, etc.

Figure 01: RAPD

Qu'est-ce que RFLP?

Les polymorphismes de longueur de fragment de restriction (RFLP) sont un marqueur moléculaire utilisé en biologie moléculaire pour l'identification de la variation génétique des séquences d'ADN homologues. C'est le premier marqueur génétique développé pour les empreintes digitales d'ADN. Tous les organismes produisent des profils d'ADN uniques lorsqu'ils sont limités avec des enzymes de restriction spécifiques. RFLP sert d'outil important pour produire des profils d'ADN uniques des individus et la détection de la variation génétique entre eux. Lorsque les échantillons d'ADN sont digérés avec des endonucléases de restriction spécifiques, il fournit différents profils d'ADN qui sont uniques à chaque individu. Par conséquent, le principal de cette méthode est la détection de la variation génétique entre les organismes en restreignant l'ADN homologue avec des enzymes de restriction spécifiques et l'analyse du polymorphisme de la longueur des fragments via l'électrophorèse sur gel et le transfert. Les motifs de transfert sont uniques à chaque organisme et caractérisent les génotypes spécifiques.

Les étapes suivantes sont impliquées avec RFLP.

1. Isolement d'une quantité suffisante d'ADN à partir d'échantillons
2. Fragmentation des échantillons d'ADN avec des endonucléases de restriction spécifiques en séquence courte
3. Séparation des fragments résultants avec différentes longueurs par électrophorèse sur gel d'agarose.
4. Transfert du profil de gel dans une membrane par Southern Blot
5. Hybridation de la membrane avec des sondes marquées et analyse du polymorphisme de longueur de fragment dans chaque profil

Le RFLP a diverses applications telles que le diagnostic des maladies de l'héritage, la cartographie du génome, l'identification criminelle dans les études médico-légales, les tests de paternité, etc.

Figure 02: génotypage RFLP

Quelle est la différence entre RAPD et RFLP?

Résumé - RAPD vs rflp

RAPD et RFLP sont des marqueurs importants utilisés en biologie moléculaire. Les deux méthodes sont capables de détecter la variation génétique entre les organismes. RAPD est réalisé en utilisant des amorces aléatoires. RFLP est effectué en utilisant des enzymes de restriction spécifiques. Les deux méthodes produisent des profils d'ADN uniques aux organismes individuels. RAPD est impliqué de manière comparable à quelques étapes que RFLP. Mais il produit des résultats moins fiables et reproductibles que RFLP. C'est la principale différence entre RAPD et RFLP.

Les références:
1. DOS, J. B., J. Nienhuis, P. Skroch, J. Tivang et m. K. Slocum. «Comparaison des marqueurs génétiques RAPD et RFLP dans la détermination de la similitude génétique entre Brassica oleracea L. génotypes." ÉTIQUETER. Génétique théorique et appliquée. Theortische und Angewandte Genetik. U.S. Bibliothèque nationale de médecine, MAR. 1994. la toile. 12 avril. 2017
2. Powell, Wayne, Michele Morgante, Chaz Andre, Michael Hanafey, Julie Vogel, Scott Tingey et Antoni Rafalski. «La comparaison de RFLP, RAPD, AFLP

Image gracieuseté:
1. «RFLP Genotyping» par (inconnu) - National Institutes of Health (Domain public) via Commons Wikimedia