Différence entre la sonde et l'amorce
Différence clé - sonde vs amorce
La sonde moléculaire est un petit fragment d'ADN ou d'ARN qui reconnaît les séquences complémentaires dans l'ADN ou l'ARN et permet d'identifier la séquence cible. L'amorce est un petit étirement d'ADN ou d'ARN qui sert de point de départ pour la synthèse de l'ADN. Les amorces et les sondes s'hybride avec les nucléotides complémentaires de l'ADN de matrice ou de l'ADN cible. Cependant, la principale différence entre la sonde et l'amorce est que Les amorces sont nécessaires pour la réplication de l'ADN tandis que les sondes sont nécessaires pour la détection de séquences spécifiques dans l'ADN de l'échantillon.
CONTENU
1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que la sonde
3. Qu'est-ce que l'amorce
4. Comparaison côte à côte - sonde vs amorce
5. Résumé
Qu'est-ce qu'une sonde?
La sonde est un petit fragment d'ADN ou d'ARN utilisé pour détecter l'ADN ou l'ARN cible dans l'échantillon par hybridation moléculaire. Ils sont également connus sous le nom marqueurs moléculaires. La longueur de la sonde peut varier (100 à 1000 bases) et les nucléotides de sonde sont complémentaires de la partie de la séquence cible. Pour la facilité de détection, les sondes sont marquées avec des isotopes radioactifs ou avec des colorants ou des anticorps fluorescents. Les sondes se lient aux bases complémentaires de la séquence cible et révèlent la présence de l'ADN ou de l'ARN cible dans l'échantillon. Il existe deux méthodes principales de sondage d'étiquetage: Étiquetage des fins et traduction de Nick. Les sondes sont classées en différents types, notamment des sondes d'ADN, des sondes d'ARN, des sondes d'ADNc et des sondes d'oligonucléotides synthétiques, et elles sont préparées en utilisant différentes techniques.
Les sondes sont des outils importants dans de nombreux domaines microbiens et moléculaires tels que la virologie, la pathologie médico-légale, les tests de paternité, l'empreinte digitale de l'ADN, la détection des maladies génétiques, le RFLP, la cytogénétique moléculaire, in situ hybridation, etc.
Figure 01: sonde marquée par fluorescence utilisée dans le poisson pour la détection des agents pathogènes
Qu'est-ce qu'un apprêt?
L'amorce est un court fragment d'ADN ou d'ARN qui sert d'initiateur à la synthèse de l'ADN. L'enzyme de l'ADN polymérase ajoute des nucléotides au groupe 3 'OH de la séquence d'amorce et synthétise le nouveau brin complémentaire à l'ADN de matrice. Les amorces sont des fragments très courts d'une longueur de 18 à 20 nucléotides. Ils sont synthétisés chimiquement en laboratoire pour in vitro Amplification de l'ADN (PCR). Les amorces peuvent avoir n'importe quelle séquence de nucléotides car ils sont conçus par l'utilisateur. Ils sont synthétisés pour correspondre aux bases complémentaires de l'ADN de matrice. Par conséquent, il peut avoir n'importe quelle séquence de nucléotides. Les amorces sont de la plus haute importance pour la réplication de l'ADN car l'ADN polymérase ne peut pas synthétiser un nouvel ADN sans morceau d'ADN préexistant. Lors de la conception des amorces pour la PCR, les choses doivent être prises en compte:
- Les amorces doivent contenir les nucléotides complémentaires à l'extrémité flanquante de l'ADN qui veut amplifier.
- Les amorces devraient avoir une température de fusion entre 55 et 65 0C
- Le contenu G et C doit être compris entre 50 et 60%.
Deux amorces sont utilisées dans PCR comme avant et arrière pour reproduire les deux brins de l'ADN de l'échantillon. Les amorces sont couramment utilisées pour effectuer un séquençage de PCR et d'ADN.
Figure 02: recuit d'amorce en PCR
Quelle est la différence entre la sonde et l'amorce?
Sonde vs amorce | |
| La sonde est un petit fragment d'ADN / ARN utilisé pour détecter la présence de la séquence cible dans un échantillon par hybridation moléculaire. | L'amorce est un petit étirement d'ADN ou d'ARN qui sert de point de départ pour la réplication de l'ADN. |
| Fonction | |
| Cela détecte la présence d'une séquence spécifique dans l'échantillon d'ADN ou d'ARN. | Cela agit comme un point de départ pour la synthèse de l'ADN. |
| Longueur | |
| La longueur peut être dans la plage de 100 à 1000 bases | La longueur est généralement d'environ 18 à 20 bases |
| Liaison avec une séquence complémentaire | |
| La sonde hybride avec les bases complémentaires de la séquence cible | L'amorce recuit avec les bases complémentaires des brins d'ADN. |
| Étiquetage | |
| Les sondes sont étiquetées pour faciliter la détection | Les amorces ne sont généralement pas étiquetées |
| Utilisation dans PCR | |
| Les sondes ne sont pas utilisées dans PCR | Les amorces sont utilisées en PCR |
Résumé - sonde vs amorce
La sonde est un petit fragment de séquence d'ADN ou d'ARN qui peut être hybridé avec des nucléotides complémentaires pour détecter une séquence cible dans l'échantillon. Les sondes sont marquées radioactivement, immunologiquement ou fluorescence pour voir la présence de séquence cible. L'amorce est un très petit fragment d'ADN ou d'ARN qui agit comme le point de départ pour in vitro Amplification ADN. L'ADN polymérase identifie l'amorce de groupe 3 'OH et initie la construction de nouveaux brins complémentaires du modèle. Les sondes et les amorces fonctionnent de manière similaire en hybridant avec des nucléotides complémentaires. Ainsi, la différence clé entre la sonde et l'amorce est leur fonction principale.
Référence:
1.»Primer (biologie moléculaire)." Wikipédia. Fondation Wikimedia, 02 février. 2017. la toile. 01 mars. 2017.
2.”Sonde d'hybridation." Wikipédia. Fondation Wikimedia, 30 décembre. 2016. la toile. 01 mars. 2017
3.»Primer (biologie moléculaire).»Primer (biologie moléculaire) - sujets de science. N.p., n.d. la toile. 01 mars. 2017
Image gracieuseté:
1. «Fish pour l'identification des agents pathogènes bactériens» par pepetps togopic ivan akira magnus mansketimothy w. Ford - (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. «Primers Revcomp Melted2» par Richard Wheeler (Zephyris) - Propre travaux (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
