Différence entre le motif et le domaine

Le différence clé entre le motif et le domaine est que le Le motif n'est pas indépendamment stable tandis que le domaine est stable indépendamment.

Les protéines sont des macromolécules biologiques importantes présentes dans notre corps. D'un autre côté, le code génétique d'un gène décidera de la séquence d'acides aminés d'une protéine. De plus, les protéines ont des structures primaires, secondaires et tertiaires. La structure primaire est la séquence d'acides aminés de la chaîne polypeptidique. Lorsque les chaînes polypeptidiques se replient les unes avec les autres, il forme la structure secondaire de la protéine. Les hélices alpha, les draps bêta et les structures super-secondaires appartiennent aux structures secondaires. Certains groupes d'éléments super-secondaires sont appelés motifs protéiques. La structure tertiaire d'une protéine se réfère à sa structure tridimensionnelle qui décide de la fonction de la protéine. Le domaine est une section pliée d'une molécule protéique, qui est globulaire et a une fonction discrète. C'est la structure fonctionnelle et tridimensionnelle fondamentale de la protéine.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que le motif
3. Qu'est-ce que le domaine
4. Similitudes entre le motif et le domaine
5. Comparaison côte à côte - Motif vs domaine sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que le motif?

Le motif est un certain regroupement des éléments super secondaires de protéines telles que les hélices alpha et les structures bêta. Ce sont une sorte de schémas présents dans différentes protéines. Les motifs décrivent les motifs de pliage des éléments structurels secondaires et de leurs interactions. Ces modèles de pliage se stabilisent par des liens similaires qui sont présents dans les structures tertiaires. Cependant, ils ne sont pas aussi complexes que les structures tertiaires.

Figure 01: Motif

Ce sont des combinaisons simples de structures secondaires de protéines. Le motif n'est pas stable par lui-même. De plus, les motifs expliquent la structure d'une protéine mais ne prédisent pas la fonction d'une protéine. Des exemples de motifs de protéines sont un motif bêta-alpha-bêta, un motif de clé grec, un baril bêta, un motif de médiation bêta, etc.

Qu'est-ce que le domaine?

Le domaine est une unité fondamentale, fonctionnelle et tridimensionnelle d'une protéine. Il remplit une fonction particulière. Une seule protéine peut avoir plusieurs domaines distincts. Chaque domaine est une unité indépendante. C'est une structure globulaire. Il est responsable d'une fonction ou d'une interaction spécifique. Les domaines peuvent être utilisés pour émettre l'hypothèse de la fonction d'une protéine non caractérisée. Lors de l'analyse d'une protéine, il est essentiel de prendre en compte car les domaines sont les unités fonctionnelles de la protéine.

Figure 02: Trois domaines différents de la pyruvate kinase

Les domaines sont des structures très stables et compactes. Ils peuvent être facilement distingués des autres régions. La pyruvate kinase a trois domaines de distinction comme le montre la figure 02. La longueur du domaine peut varier et la longueur moyenne est de 100 acides aminés. Chaque domaine contient un noyau hydrophobe construit à partir d'unités structurelles secondaires. Plusieurs domaines font collectivement la structure tertiaire d'une protéine.

Quelles sont les similitudes entre le motif et le domaine?

• Le motif et le domaine sont des unités présents dans les molécules de protéines elles-mêmes.
• Ils sont utiles lors de la classification des familles de protéines.

Quelle est la différence entre le motif et le domaine?

Le motif est un certain regroupement des éléments super secondaires de protéines telles que les hélices alpha et les structures bêta tandis que le domaine est l'unité fonctionnelle d'une protéine. De plus, le motif est une structure secondaire tandis que le domaine est responsable de la structure tertiaire de la protéine. De plus, le domaine est une unité indépendante, contrairement à un motif. De plus, le domaine représente la fonction d'une protéine tandis que le motif n'est pas. Ce sont les principales différences entre le motif et le domaine. L'infographie ci-dessous présente la différence entre le motif et le domaine sous forme tabulaire.

Résumé - Motif vs domaine

Le motif est une disposition des structures secondaires de la molécule protéique. Il n'est généralement pas stable en soi, contrairement à un domaine. Le domaine est une structure stable indépendamment d'une protéine. Par conséquent, cela peut faire partie ou une molécule de protéine entière. C'est une unité fonctionnelle fondamentale en trois dimensions de la protéine. De plus, il a une fonction, et c'est une unité indépendante. Le motif peut faire partie du domaine. Mais le domaine ne peut pas faire partie d'un motif. C'est la différence entre le motif et le domaine.

Référence:

1.«Domaine protéique.»Wikipedia, Wikimedia Foundation, 31 juillet 2018. Disponible ici

Image gracieuseté:

1.«Motif clé de la protéine de toxine anthrax» par Natelewisderivative Work (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2.«Pyruvate kinase Protein Domains» par Thomas Splettstoesser - Propre travaux, (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia