Différence entre la parcimonie maximale et le maximum de vraisemblance

Le différence clé entre la parcimonie maximale et la probabilité maximale dépend de la méthode utilisée pour développer l'arbre phylogénétique. La parcimonie maximale se concentre sur la minimisation des états de caractère total pendant la construction d'arbre phylogénétique tandis que la probabilité maximale est une approche statistique pour attirer l'arbre phylogénétique en fonction de la probabilité entre les données génétiques.

La phylogénie est la nouvelle approche de la classification et de la nomenclature des organismes. La phylogénie repose sur des données génétiques et des relations évolutives. Les données génétiques sont le résultat du séquençage de l'ADN. En phylogénie, la classification des organismes a lieu en fonction de l'ancêtre commun. La parcimonie maximale et la probabilité maximale d'une relation phylogénétique augmentent la précision et la fiabilité d'un arbre phylogénétique.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que la parcimonie maximale 
3. Qu'est-ce que le maximum de vraisemblance
4. Similitudes entre la parcimonie maximale et le maximum de vraisemblance
5. Comparaison côte à côte - parcimonie maximale vs maximum de vraisemblance sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que la parcimonie maximale?

Dans la technique de la parcimonie maximale, la minimisation des changements totaux d'état de caractère a lieu pendant l'analyse phylogénétique. Phylogénétique est une branche de la biologie qui traite de l'étude des relations évolutives. Un arbre phylogénétique est un arbre qui montre les relations évolutives basées sur un ancêtre commun. Ainsi, lors du dessin d'un arbre phylogénétique en utilisant le concept de parcimonie maximale, la quantité d'évolution parallèle est minimisée. Par conséquent, la parcimonie maximale générera l'arbre beaucoup plus rapidement que les autres méthodes. C'est parce que seules les principales caractéristiques de distinction sont considérées en parcimonie maximale.

Figure 01: parcimonie maximale

Lors du dessin d'un arbre parcimonieux maximal, l'arbre est toujours l'arbre le plus court possible avec le nombre minimum de taxons. Cependant, la fiabilité d'un arbre parcimonieux maximal est très élevée. La cohérence statistique et la précision de la relation phylogénétique basée sur une parcimonie maximale varieront. De plus, il existe des algorithmes complexes qui analysent la parcimonie maximale d'une relation phylogénétique.

Qu'est-ce que le maximum de vraisemblance?

La probabilité maximale est l'une des méthodes statistiques les plus utilisées qui analyse les relations phylogénétiques. La méthode analysera la phylogénie en fonction du modèle de probabilité. De plus, cette méthode prend en considération la moyenne et la variance. Ainsi, en phylogénie, le maximum de probabilité est obtenu sur les données génétiques données d'un organisme particulier.

Figure 02: maximum de vraisemblance

Il existe à la fois des avantages et des inconvénients de l'utilisation de la méthode statistique du maximum de vraisemblance. La méthode est très appropriée lors de l'analyse d'un ensemble de données simple contenant des informations génétiques. Lorsque le degré de variance entre les données génétiques est plus faible, les scores du maximum de vraisemblance sont fiables. Les résultats générés par le maximum de vraisemblance confirment en outre les scores de parcimonie maximale d'une relation phylogénétique particulière. Par conséquent, l'analyse du maximum de vraisemblance agit comme un test confirmatif.

Par rapport aux avantages mentionnés ci-dessus, cette méthode est un processus lent et intense. De plus, en l'absence d'un seul ensemble de données, la sortie d'erreur est élevée. Ainsi, cela rend également la reproductibilité des résultats plus difficile par l'estimation du maximum de vraisemblance.

Quelles sont les similitudes entre la parcimonie maximale et le maximum de vraisemblance?

• La parcimonie maximale et la probabilité maximale sont deux approches qui jouent un rôle important dans la phylogénie.
• Les deux techniques décrivent la relation d'un organisme avec son ancêtre en fonction des données génétiques disponibles.
• Les arbres phylogénétiques peuvent être interprétés en utilisant à la fois une parcimonie maximale et une probabilité maximale.
• Dans les deux techniques, les données génétiques repose sur le séquençage d'ADN ou le séquençage d'ARN.
• Les deux méthodes sont importantes pour générer des arbres phylogénétiques.

Quelle est la différence entre la parcimonie maximale et le maximum de vraisemblance?

La parcimonie maximale et la probabilité maximale sont deux approches différentes pour interpréter un arbre phylogénétique. La parcimonie maximale croit en analysant quelques caractéristiques et en minimisant les changements de caractère de l'organisme à l'organisme. En revanche, la méthode du maximum de vraisemblance prend en considération la moyenne et la variance et obtient un maximum de vraisemblance sur les données génétiques données d'un organisme particulier. C'est donc la principale différence entre la parcimonie maximale et le maximum de vraisemblance.

De plus, la fiabilité de la parcimonie maximale à elle seule n'est pas suffisante pour dériver une conclusion. Mais, la méthode du maximum de vraisemblance agit comme un test confirmatif des résultats de la parcimonie maximale. Ainsi, les conclusions doivent être faites en utilisant à la fois une parcimonie maximale et un maximum de vraisemblance.

L'infographie ci-dessous résume la différence entre la parcimonie maximale et le maximum de vraisemblance.

Résumé - Parcimonie maximale vs probabilité maximale

La phylogénie joue un rôle important dans la dérivation des relations évolutives en construisant des arbres phylogénétiques. La parcimonie maximale est la technique de construction d'un arbre avec le nombre minimum de changement d'état de caractère. En revanche, la probabilité maximale d'un arbre phylogénétique repose sur l'utilisation de la similitude maximale entre les données génétiques. Les données pour les deux analyses proviennent des données de séquence d'ADN ou d'ARN. La fiabilité et la précision sont élevées lorsque la construction d'arbres a lieu en utilisant les deux techniques. Ainsi, cela résume la différence entre la parcimonie maximale et le maximum de vraisemblance.

Référence:

1. Elliott. «Concours entre la parcimonie et la probabilité." Académique OUP, Oxford University Press, 1er août. 2004, disponible ici.

Image gracieuseté:

1. «Arbre de parcimonie maximale de l'haplogroup B2B» par Taboada-Echalar P, Álvarez-Iglesias V, Heinz T, Vidal-Bralo L, Gómez-Carballa A, Catelli L, et al. (2013) L'héritage génétique de la période précoloniale des Boliviens contemporains. PLOS ONE 8 (3): E58980. doi: 10.1371 / Journal.pne.0058980 (CC par 2.5) Via Commons Wikimedia
2. «Tree maximum-likelihhood de Lactarius Blennius and Relativs» par l'utilisateur: Thkgk - Propre travaux (CC0) via Commons Wikimedia