Différence entre la lampe et le test de PCR

Le différence clé Entre la lampe et le test de PCR est que La lampe est effectuée à température constante (60-65⁰C) pour produire des copies de l'ADN par amplification, tandis que la PCR est réalisée en utilisant une série de changements de température pour produire des copies de l'ADN par amplification.

La lampe et la PCR sont les deux in vitro Techniques d'amplification utilisées pour produire des milliers de copies d'ADN. La quantité d'ADN produite dans la lampe est beaucoup plus élevée que la quantité produite dans les techniques de PCR telles que RT-PCR. Lamp est une technique plus récente par rapport à la technique PCR. Mais il est techniquement simple et facile pour un scientifique formé de jouer dans des conditions de laboratoire. Cela en fait une technique potentiellement utile pour la détection de Covid-19. Cependant, RT-PCR est le test standard actuel pour Covid-19. Ces techniques, bien que bien connues des chercheurs et des cliniciens ayant une formation en amplification ADN, peuvent toujours être relativement inconnus d'une communauté plus large.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que le test de lampe
3. Qu'est-ce que le test PCR
4. Similitudes entre la lampe et le test de PCR
5. Comparaison côte à côte - Test de lampe contre PCR sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que le test de lampe?

Amplification isotherme médiée par la boucle (Lampe) Pour les tests Covid-19, commencez par une collection d'échantillons du nez ou de la gorge à l'aide d'un tampon. Les échantillons peuvent également être prélevés à l'aide d'autres méthodes telles que le mucus à partir de toux dure. Comme la technique de PCR telle que RT-PCR, l'ARN viral dans l'échantillon est d'abord converti en ADN, ce qui lui permet d'être copié. La réaction de lampe est effectuée à température constante (60-65⁰C).

L'amplification de l'ADN viral incorporant la technologie et les réactifs de la lampe peut être détecté lorsque le mélange réactionnel est devenu nuageux en raison de la production de «pyrophosphate de magnésium». Cette nébulosité permet un diagnostic facile de Covid-19 par des scientifiques et des cliniciens. La précision des résultats des tests peut être améliorée en utilisant des colorants fluorescents spéciaux ou des colorants à changement de couleur dans le mélange réactionnel. Ces colorants interagissent avec l'ADN viral, et l'intensité de la lumière ou du changement de couleur peut être mesurée pour donner le nombre de molécules d'ARN virales approximativement dans l'échantillon initialement dans l'échantillon.

Qu'est-ce que le test PCR?

La PCR est une technique scientifique très courante qui a été largement utilisée dans la recherche et la médecine depuis 20-30 ans pour détecter l'ADN. Les tests de PCR sont utilisés directement pour détecter un antigène en détectant l'ARN viral. Généralement, l'ARN viral est présent dans le corps avant de détecter les anticorps ou d'obtenir les symptômes de la maladie. Par conséquent, un test de PCR peut dire si quelqu'un a ou non le virus. Actuellement, la PCR est le test standard pour détecter Covid-19. Il existe différents types de techniques de PCR telles que la PCR en temps réel, la PCR imbriquée, la PCR multiplex, la PCR à démarrage à chaud et la PCR à longue portée, etc. La PCR utilise une série de changements de température pour produire des copies de l'ADN par amplification.

RT-PCR est une version spéciale de la technique PCR. Il est utilisé lorsque l'ARN est détecté. Il est maintenant utilisé pour tester Covid-19. RT-PCR est une technique assez sensible et fiable. Dans RT-PCR, une fois un échantillon prélevé, les produits chimiques sont utilisés pour éliminer les protéines, les graisses et d'autres molécules indésirables, laissant l'ARN derrière. Les enzymes du kit de test convertissent d'abord l'ARN en ADN, qui amplifie ensuite l'ADN viral afin de détecter le virus. Les colorants fluorescents sont généralement utilisés pour se lier à l'ADN amplifié et produire de la lumière. Cela peut être lu par la machine pour produire le résultat du test.

Quelles sont les similitudes entre la lampe et le test de PCR?

• Ce sont des techniques d'amplifications.
• Les deux produisent de l'ADN copié.
• Ce sont des techniques très sensibles et fiables que la technique immunitaire comme la détection des anticorps.
• Ils sont tous deux utilisés pour les tests Covid-19.

Quelle est la différence entre la lampe et le test de PCR?

La principale différence entre les tests de lampe et de PCR est que, dans la lampe, l'amplification est obtenue en utilisant une température constante (60-65⁰C), dans la PCR, le cycle des températures est nécessaire. Plusieurs types de techniques de lampes sont actuellement disponibles. Mais les plus importants pour la détection de Covid-19 sont la technique isotherme médiée par la boucle de transcription inverse (RT-lamp) et l'amplification médiée par les transcrits (TMA). En outre, différents types de techniques de PCR sont également actuellement disponibles dans la pratique clinique pour le diagnostic de la maladie telles que la PCR en temps réel, la RT-PCR, la PCR imbriquée, la PCR multiplex, la PCR à démarrage à chaud, la PCR à longue portée, etc.

L'infographie ci-dessous répertorie les différences entre la lampe et le test de PCR sous forme tabulaire.

Résumé - Test de lampe vs PCR

L'amplification isotherme médiée par la boucle est un processus similaire aux tests de PCR tels que RT-PCR, mais il produit plus de copies d'ADN virales à une température constante. Le test de réaction en chaîne en polymérase est actuellement la forme de test le plus courante et la plus standard dans le monde pour le diagnostic de la maladie, comme le diagnostic de Covid-19. Il est considéré comme assez fiable. La PCR utilise une série de changements de température pour produire des copies de l'ADN par amplification. Ainsi, cela résume la différence entre la lampe et le test de PCR.

Référence:

1. Culbertson, Alix. «Quels sont les différents types de tests Covid-19 - et nous feront-nous sortir du verrouillage?”Sky News, Sky, 25 février. 2021, disponible ici.
2. «De PCR à la lampe: l'évolution des tests rapides dans la sécurité alimentaire.»3M Food Safety News, 27 mars. 2019, disponible ici.

Image gracieuseté:

1. «5065424» (CC0) via Pixabay
2. «Réaction en chaîne par polymérase» par Enzoklop - Propre travaux (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia