Différence entre le fragment de klenow et l'ADN polymérase 1

Le différence clé entre le fragment de klenow et l'ADN polymérase 1 est que Le fragment de klenow est une grande partie de l'ADN polymérase 1 qui n'a pas de 5 'à 3' exonucléase d'activité tandis que l'ADN polymérase est une enzyme de E. coli qui a les trois domaines, y compris l'activité d'exonucléase de 5 'à 3'.

L'ADN polymérase est l'une des principales enzymes impliquées dans la réplication de l'ADN dans les organismes vivants. Il existe différentes formes d'enzyme de l'ADN polymérase que l'on trouve dans les eucaryotes et les procaryotes en fonction de la taille et de la forme. L'ADN polymérase 1, 2 et 3 ne se trouve que dans les organismes procaryotes, et ils jouent des rôles différents dans la réplication de l'ADN. L'ADN polymérase 1 a trois domaines avec 5 'à 3' polymérase, une activité d'exonucléase de 3 'à 5' et une activité d'exonucléase de 5 'à 3'. Le fragment de klenow est un produit protéolytique de l'ADN polymérase 1. Il possède des activités d'exonucléase de 5 à 3 'et 3 à 5'.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que le fragment Klenow 
3. Qu'est-ce que l'ADN polymérase 1
4. Similitudes entre le fragment de klenow et l'ADN polymérase 1
5. Comparaison côte à côte - Fragment Klenow vs ADN polymérase 1 sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que le fragment Klenow?

Le fragment de klenow est une grande partie de l'ADN polymérase 1. Contrairement à l'ADN polymérase 1, l'activité d'exonucléase de 5 à 3 'n'est pas observée dans le fragment de Klenow car il n'a pas le domaine d'exonucléase de 5 à 3'. Les fragments de klenow sont produits en digérant l'ADN polymérase 1 avec une protéase appelée subtilisine, qui est une enzyme de digestion des protéines. Dans certaines applications, l'activité d'exonucléase de 3 à 5 'du fragment de Klenow devient indésirable. Il peut être supprimé en introduisant une mutation dans le gène qui code le fragment Klenow. L'enzyme résultante qui n'a que l'activité de polymérase de 5 'à 3' est connue sous le nom de fragment exo-klenow. Morphologiquement, le fragment de Klenow ressemble à la main droite humaine. Il a un domaine d'exonucléase N-terminal 3'-5 'et le domaine polymérase C-terminal séparé par environ 30 a.

Figure 01: Fragment Klenow et ADN polymérase 1

Le fragment de klenow est un outil important dans les techniques biologiques moléculaires. Les fragments de klenow ont plusieurs utilisations. Ils sont extrêmement importants dans le clonage émoussé afin de produire des fragments émoussés. Les fragments de klenow peuvent éliminer 3 'surplombs ou remplir 5' surplombs pour former des extrémités émoussées. De plus, des fragments de klenow sont utilisés pour synthétiser l'ADN double brin à des brins simples. De plus, ils sont utilisés pour préparer des sondes marquées radioactivement en utilisant l'activité d'ADN polymérase à 5'to 3 '.

Qu'est-ce que l'ADN polymérase 1?

L'ADN polymérase 1 (Pol 1) est une enzyme trouvée dans les procaryotes qui est nécessaire pour la réplication de l'ADN bactérien. C'est le premier type d'ADN polymérase découverte par Arthur Kornberg en 1956. Pol 1 est la polymérase la plus abondante dans E. coli. Il est codé par le gène Pola et composé de 928 acides aminés. Il se compose de trois domaines. Les trois domaines remplissent des fonctions distinctes. Deux domaines effectuent une activité d'exonucléase de 5 'à 3' et une activité d'exonucléase de 3 'à 5'. En raison de cette activité possédée par Pol 1, il est populaire comme enzyme de réparation d'ADN plutôt que comme une enzyme de réplication de l'ADN. Le troisième domaine a la capacité de catalyser plusieurs polymérisations (5 'à 3') avant la libération de l'ADN de la matrice et de connexion des fragments d'Okazaki en remplissant un nouvel ADN et en supprimant les amorces d'ARN.

Figure 02: ADN polymérase

Pol 1 isolé de E coli a été largement utilisé dans les applications moléculaires. Cependant, une fois la Taq polymérase découverte, elle a remplacé le E coli Pol 1 dans la technologie PCR. La Taq polymérase est en quelque sorte une ADN polymérase thermostable qui appartient à POL 1.

Quelles sont les similitudes entre le fragment de klenow et l'ADN polymérase 1?

• Le fragment de klenow est une grande partie de l'ADN polymérase 1.
• Ils ont l'activité de l'ADN polymérase de 5'to 3 'et de l'ADN et l'activité d'exonucléase 3'to 5' qui médie la relecture.
• Ils sont utilisés à plusieurs fins.

Quelle est la différence entre le fragment de klenow et l'ADN polymérase 1?

La principale différence entre le fragment de klenow et l'ADN polymérase 1 est que le fragment de klenow n'a pas de 5 à 3 à 3 '. Par conséquent, le fragment de klenow a deux domaines, tandis que l'ADN polymérase 1 a les trois domaines.

L'infographie ci-dessous montre plus de détails sur la différence entre le fragment de klenow et l'ADN polymérase 1.

Résumé - Fragment Klenow vs ADN polymérase 1

L'ADN polymérase 1 est une enzyme de E. coli qui a trois domaines comme un domaine de polymérisation de 5 'à 3', un domaine d'exonucléase de 3 'à 5' et un domaine d'exonucléase de 5 'à 3'. Le fragment de klenow est une grande partie de l'ADN polymérase. Il n'a pas un domaine d'ADN polymérase 1, qui est le domaine d'exonucléase de 5 'à 3'. La principale différence entre le fragment de klenow et l'ADN polymérase 1 est que les fragments de klenow n'ont pas de domaine d'exonucléase de 5 'à 3' tandis que l'ADN polymérase 1 a 5 'à 3'.

Référence:

1. «ADN polymérase I - Un aperçu | Sujets scientifiques ». ScienceDirect.Com, 2020, disponible ici.
2. "Fragment Klenow". En.Wikipédia.Org, 2020, disponible ici.

Image gracieuseté:

1. «PolymeReasedomains» par (inconnu) "Molecule of the Month", mars 2000 - Protein Data Bank, (Domain public) via Commons Wikimedia
2. «ADN polymérase» von yikrazuul - eigenes werk (cc by-sa 3.0) via Commons Wikimedia