Différence entre les introns du groupe I et du groupe II

Le différence clé entre les introns du groupe I et du groupe II Dans les introns du groupe I, la réaction d'épissage est initiée par un cofacteur de guanosine, tandis que dans les introns du groupe II, la réaction d'épissage est initiée par l'adénosine interne.

Le pré-ARNm est la transcription principale qui a à la fois des introns et des exons. Le pré-ARNm doit se convertir en ARNm avant la traduction. L'épissage d'ARN ou l'épissage pré-ARNm est l'une de ces modifications post-transcriptionnelles. Dans l'épissage d'ARN, les introns sont retirés de la molécule pré-ARNm et les exons sont réunis ensemble. Les introns du groupe I et du groupe II sont des introns d'auto-épliaison. Ils épissent de la molécule pré-ARNm sans l'aide d'une autre enzyme. Par conséquent, ce sont des enzymes ARN ou des ribozymes qui catalysent leur propre épissage à partir de pré-ARNm. De plus, ils ont la capacité de fonctionner comme des éléments mobiles. Pendant l'épissage, une série de réactions trans-estérification a lieu pour acciser l'intron et ligature les exons. Ces ribozymes sont présents dans les trois domaines, y compris les bactéries, les archées et les eucaryotes.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Que sont les introns du groupe I
3. Que sont les introns du groupe II
4. Similitudes entre les introns du groupe I et du groupe II
5. Comparaison côte à côte - introns du groupe I vs Groupe II sous forme tabulaire
6. Résumé

Que sont les introns du groupe I?

Les introns du groupe I sont un type de ribozymes d'auto-épliaison trouvés dans les bactéries, les bactériophages et les eucaryotes (génomes organellaires et nucléaires). Ils se trouvent dans les gènes essentiels. Ils sont capables de catalyser leur propre épissage à partir de la molécule pré-ARNm. Les introns du groupe I peuvent avoir quelques centaines à trois mille nucléotides. De plus, ils présentent peu de similitude de séquence entre les organismes.

Figure 01: introns du groupe I

Les structures secondaires sont hautement conservées dans quatre régions courtes. Il y a deux étapes de réaction de transestérification de l'épissage. Les introns du groupe I initient le mécanisme d'épissage par l'attaque nucléophile de l'hydroxyle 3 'd'un cofacteur de guanosine sur le site d'épissage 5p.

Que sont les introns du groupe II?

Les introns du groupe II sont un type d'introns d'auto-épliaison trouvés dans les organismes appartenant aux trois domaines. Ce sont des ribozymes qui catalysent leurs propres réactions d'épissage de pré-ARNm. Ils se trouvent dans l'ARNr, l'ARNt et les gènes codant pour les protéines. Mais ils ne se trouvent pas dans les génomes nucléaires, contrairement aux introns du groupe I.

Figure 02: introns du groupe II

Les introns du groupe II catalysent l'épissage via deux étapes de transestérification similaires aux introns du groupe I. Ces enzymes déclenchent la réaction d'épissage par l'attaque nucléophile de 2 'OH du site de la branche Adénosine sur la jonction d'épissage de 5'. Pendant les réactions d'épissage, les introns du groupe II forment une structure de type lariat. De plus, l'épissage d'intron a lieu en l'absence de GTP.

Quelles sont les similitudes entre les introns du groupe I et du groupe II?

• Les introns du groupe I et du groupe II sont deux types d'enzymes d'ARN, des ribozymes qui catalysent leur propre épissage par différents mécanismes.
• Ce sont de gros ribozymes.
• Les deux se trouvent dans les trois domaines.
• Ce sont des éléments mobiles.
• De plus, ils se trouvent dans l'ARNr, l'ARNt et les gènes codant pour les protéines.
• Les deux enzymes utilisent comme outils en biotechnologie et en médecine moléculaire pour les systèmes ciblés de knock-out gène, de livraison de gènes ou de thérapie génique.

Quelle est la différence entre les introns du groupe I et du groupe II?

Les introns du groupe I sont des ribozymes trouvés dans les bactéries, les bactériophages et les génomes organellaires et nucléaires eucaryotes. Les introns du groupe II sont des ribozymes trouvés dans les bactéries, les archées et les organites eucaryotes. Moreover, the group I introns initiate splicing reaction by the nucleophilic attack of the 3' hydroxyl of a guanosine cofactor at the 5P splice site while group II introns initiate splicing reaction by the nucleophilic attack of the 2' OH of the branch site adenosine on the 5 'Splice Junction. C'est donc la principale différence entre les introns du groupe I et du groupe II.

De plus, les introns du groupe II forment une structure de type lariat pendant l'épissage tandis que les introns du groupe I ne se forment pas. Ainsi, c'est une autre différence significative entre les introns du groupe I et du groupe II. En outre, les introns du groupe I se trouvent dans les génomes nucléaires eucaryotes tandis que les introns du groupe II ne se trouvent pas dans les génomes nucléaires eucaryotes.

L'infographie ci-dessous répertorie les différences entre les introns du groupe I et du groupe II sous forme tabulaire pour une comparaison côte à côte.

Résumé - Groupe I vs Introns du groupe II

Les introns du groupe I et II sont de gros ribozymes qui catalysent une réaction de transestérification pour épisser les introns de la transcription primaire. Ils se trouvent dans les trois domaines. Ce sont tous les deux des éléments génétiques mobiles. De plus, ils sont utilisés comme outils en biotechnologie et en médecine moléculaire. Cependant, le groupe I introns déclenche une réaction d'épissage par l'attaque nucléophile du 3 'OH d'un cofacteur de guanosine sur le site d'épissage 5p. Mais, les introns du groupe II déclenchent une réaction d'épissage par l'attaque nucléophile du 2 'OH de l'adénosine du site de la branche sur la jonction d'épissage de 5'. De plus, les introns du groupe II forment une structure de type lariat pendant l'épissage tandis que les introns du groupe I ne forment pas une structure de type lariat. Ainsi, c'est le résumé de la différence entre les introns du groupe I et du groupe II.

Référence:

1. Bonen, J. Vogel, et al. «Évolution des introns du groupe II.”ADN mobile, Biomed Central, 1 janvier. 1970, disponible ici.
2. Tourasse, Nicolas J et Anne-Brit Kolstø. «Enquête sur les introns du groupe I et du groupe II dans 29 génomes séquencés du groupe Bacillus cereus: aperçu de leur propagation et de leur évolution.»Nucleic Acids Research, Oxford University Press, août. 2008, disponible ici.

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