Différence entre l'ADN génomique et l'isolement de l'ADN plasmidique

Le différence clé entre l'ADN génomique et l'isolement de l'ADN plasmidique est que le L'isolement génomique de l'ADN cible l'extraction de l'ADN génomique tandis que l'isolement de l'ADN plasmidique cible l'extraction de l'ADN plasmidique de la bactérie.

L'isolement de l'ADN est un processus chimique qui isolerait l'ADN de différentes espèces ou de différents échantillons. L'isolement de l'ADN est important dans les techniques de biologie moléculaire en aval, telles que l'électrophorèse sur gel, la réaction en chaîne en polymérase et les techniques de séquençage de l'ADN. Par conséquent, l'isolement de l'ADN est un processus chimique essentiel dans les études biologiques moléculaires. Sur la base du but de la recherche, il est parfois nécessaire d'isoler l'ADN génomique. De plus, certaines études se concentrent sur l'isolement de l'ADN plasmidique des bactéries. L'isolement de l'ADN génomique est le processus d'isolement de l'ADN génomique d'un échantillon procaryote ou eucaryote. Les étapes de l'isolement diffèrent en fonction du type de la cellule dans laquelle l'ADN est isolant. L'isolement de l'ADN plasmidique est le processus d'isolement de l'ADN plasmidique d'une cellule bactérienne. Par rapport à l'isolement de l'ADN génomique, le processus global est complexe dans l'isolement de l'ADN plasmidique.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que l'isolement de l'ADN génomique
3. Qu'est-ce que l'isolement de l'ADN plasmidique
4. Similitudes entre l'ADN génomique et l'isolement de l'ADN plasmidique
5. Comparaison côte à côte - ADN génomique vs isolation de l'ADN plasmidique sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que l'isolement de l'ADN génomique?

L'isolement de l'ADN génomique est le processus d'extraction de l'ADN génomique entier d'un organisme. Ce processus particulier implique trois événements principaux. Ce sont, la lyse cellulaire ou la lyse nucléaire, la dégradation des protéines ou la protéolyse et la précipitation de l'ADN génomique. L'étape de lyse peut différer en fonction du type de cellule. Dans les procaryotes, comme il y a une paroi cellulaire peptidoglycane, la première étape devrait être la dégradation de la paroi cellulaire. D'un autre côté, dans les eucaryotes, l'étape de lyse implique la rupture de la membrane plasmique et de la membrane nucléaire pour éliminer l'ADN à l'extérieur. En revanche, les étapes spéciales sont essentielles pour lyser la plante et les parois cellulaires fongiques.

Figure 01: Isolement de l'ADN génomique

Par conséquent, une fois l'étape de lyse terminée, l'ADN finira par arriver au surnageant. Simultanément, la dégradation des protéines se déroule également dans la solution en raison de l'ajout de protéinase K. La prochaine étape consiste à séparer l'ADN génomique et les protéines dégradées les unes des autres. Par conséquent, les protéines dégradées se séparent par des précipitations permettant à l'ADN génomique de rester dans le surnageant. Après précipitation des protéines, l'ADN génomique peut être précipité et remis en suspension dans un tampon approprié jusqu'à ce qu'il nécessite pour l'expérience.

L'ADN génomique, qui est l'ADN linéaire, contient toutes les informations génétiques d'un organisme. En d'autres termes, le génome est le matériel d'hérédité d'un organisme vivant qui est responsable de toutes les activités structurelles et fonctionnelles de la cellule. Il se compose à la fois de séquences d'ADN codantes et non codantes. Lors de l'isolement de l'ADN génomique, il comprend l'ensemble du génome de l'organisme.

Qu'est-ce que l'isolement de l'ADN plasmidique?

L'isolement de l'ADN plasmidique est un processus spécial et plus compliqué d'isolement de l'ADN. Les plasmides sont l'ADN extrachromosomal présent dans la plupart des cellules bactériennes. Ce sont l'ADN circulaire dormant qui soutient les bactéries pour survivre dans des conditions environnementales difficiles. L'ADN plasmidique se compose de gènes résistants spéciaux qui offrent des avantages supplémentaires aux bactéries telles que la résistance aux antibiotiques, les propriétés de la virulence et les propriétés toxiques.

Figure 02: Isolement de l'ADN plasmidique

L'isolement de l'ADN plasmidique implique également trois processus principaux; lyse cellulaire, protéinolyse et précipitation de l'ADN. Bien que le mécanisme biochimique de l'isolement soit similaire à celui de l'isolement génomique de l'ADN, le processus est plus complexe qu'il. Le processus de lyse cellulaire est le processus le plus important de cette procédure. Plus important encore, l'ADN génomique et l'ADN plasmidique ne doivent pas être mélangés les uns avec les autres. Par conséquent, un processus de lyse beaucoup plus doux intègre dans la procédure d'isolement de l'ADN plasmidique. Par conséquent, dans la plupart des procédures d'isolement de l'ADN plasmidique, utilisent le détergent; dodécyl sulfate de sodium pour la lyse cellulaire.

Quelles sont les similitudes entre l'ADN génomique et l'isolement de l'ADN plasmidique?

• L'isolement génomique de l'ADN et de l'ADN plasmidique se concentre sur l'extraction de l'ADN d'un organisme.
• En outre, les deux suivent le même processus global qui comprend la lyse cellulaire, la dégradation des protéines et les précipitations de l'ADN.
• De plus, l'ADN résultant des deux processus est important pour les processus en aval.
• De plus, les deux processus d'isolement incluent les étapes pour purifier et stocker l'ADN dans des conditions de stockage spécifiées.
• En outre, la protéinase K est utilisée dans les deux méthodes pour dégrader les protéines.

Quelle est la différence entre l'ADN génomique et l'isolement de l'ADN plasmidique?

L'isolement génomique de l'ADN se concentre sur l'extraction de l'ADN génomique entier de l'organisme cible tandis que l'isolement de l'ADN plasmidique se concentre sur l'isolement uniquement de l'ADN plasmidique des espèces bactériennes particulières. Par conséquent, c'est la principale différence entre l'ADN génomique et l'isolement de l'ADN plasmidique. De plus, une autre différence entre l'ADN génomique et l'isolement de l'ADN plasmidique est dans la procédure. L'isolement de l'ADN génomique est une procédure moins complexe par rapport à l'isolement de l'ADN plasmidique. Par conséquent, lors de l'isolement de l'ADN plasmidique, il est nécessaire de prendre des précautions pour empêcher le mélange de l'ADN génomique et plasmidique.

L'infoggraohic ci-dessous fournit plus de détails sur la différence entre l'ADN génomique et l'isolement de l'ADN plasmidique.

Résumé - ADN génomique vs isolation de l'ADN plasmidique

L'isolement de l'ADN est un processus important dans les techniques de biologie moléculaire. Il existe deux types d'ADN à savoir l'ADN génomique et l'ADN plasmidique (ADN extra-chromosomal). Sur la base de l'exigence, certaines procédures effectuées pour isoler l'ADN génomique tandis que certaines procédures se concentrent sur l'isolement uniquement de l'ADN plasmidique des bactéries. Par conséquent, les étapes impliquées dans les deux processus diffèrent légèrement les unes des autres. Cependant, le processus global est le même dans les deux isolations. L'ADN isolé des deux processus a une immense utilisation dans des processus en aval tels que le clonage, l'électrophorèse sur gel et les réactions en chaîne par polymérase. À la fin du protocole d'isolement de l'ADN génomique, l'ensemble de l'ADN génomique de l'organisme peut être isolé comme produit final tandis qu'à la fin du protocole d'isolement de l'ADN plasmidique, l'ADN plasmidique de la bactérie respective peut être isolé comme produit final. Par conséquent, c'est la différence entre l'ADN génomique et l'isolement de l'ADN plasmidique.

Référence:

1.«Extraction d'ADN à partir des bactéries." Extraction d'ADN à partir de bactéries. Disponible ici 

Image gracieuseté:

1.«Extraction d'ADN» par Joo Nath - Propre travaux, (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia 
2.«Miniprep plasmide» par Retama - propre travail, (CC By-SA 4.0) via Commons Wikimedia