Différence entre électrophorèse sur gel et page SDS

Différence clé - Page d'électrophorèse sur gel vs SDS
 

L'électrophorèse sur gel est une technique qui sépare les macromolécules dans un champ électrique. C'est une méthode courante en biologie moléculaire pour séparer l'ADN, l'ARN et les protéines des mélanges en fonction de leurs tailles moléculaires. La page SDS est un type d'électrophorèse sur gel qui est utilisée pour séparer les protéines d'un mélange de protéines en fonction de leurs tailles. L'électrophorèse sur gel est un terme utilisé pour se référer à la technique normale appliquée pour l'ADN, l'ARN et la séparation des protéines alors que La page SDS est un type d'électrophorèse sur gel. C'est la principale différence entre l'électrophorèse sur gel et la page SDS.

CONTENU
1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que l'électrophorèse sur gel
3. Qu'est-ce que la page SDS
4. Comparaison côte à côte - Page d'électrophorèse sur gel vs SDS
5. Résumé

Qu'est-ce que l'électrophorèse sur gel?

L'électrophorèse sur gel est une technique courante utilisée dans les laboratoires pour séparer les molécules chargées telles que l'ADN, l'ARN, les protéines, etc. de leurs mélanges. Un gel est utilisé dans l'électrophorèse sur gel. Il agit comme un tamis moléculaire. Il existe deux types de gels utilisés dans l'électrophorèse sur gel, à savoir l'agarose et le polyacrylamide. La sélection d'une préparation de gel et de gel est des facteurs importants à prendre en compte dans les électrophorèses de gel, car la taille des pores du gel doit être soigneusement manipulée pour une bonne séparation des molécules par électrophorèse sur gel. L'électrophorèse sur gel a un champ électrique relié à deux extrémités du gel. Une extrémité du gel montre une charge positive tandis que l'autre extrémité est chargée négativement.

L'ADN et l'ARN sont des molécules chargées négativement. Une fois qu'ils sont chargés dans le gel à partir de l'extrémité négative du gel et appliqués au champ électrique, ils migrent à travers les pores de gel vers l'extrémité chargée positivement du gel. La vitesse de la migration dépend de la charge et de la taille de la molécule. Les plus petites molécules migrent facilement à travers les pores de gel que les plus grandes molécules. Par conséquent, les plus petites molécules parcourent une longue distance à travers le gel et les plus grandes molécules parcourent une courte distance. Pour observer le déplacement des molécules sur le gel, des types spéciaux de colorants sont utilisés. Le champ électrique est appliqué pour une certaine période de temps et arrêté pour éviter la perte de molécules et pour garder les molécules à leurs positions parcourues. Différentes bandes peuvent être observées dans le gel. Ces bandes représentent les molécules de différentes tailles. Par conséquent, l'électrophorèse sur gel est utile pour différencier les molécules en fonction de leurs tailles.

L'électrophorèse sur gel est incorporée dans diverses techniques en tant que technique préparative en biologie moléculaire telle que la PCR, le RFLP, le clonage, le séquençage de l'ADN, le Southern Blot, la cartographie du génome, etc.

Figure 01: électrophorèse sur gel d'agarose

Qu'est-ce que la page SDS?

Électrophorèse sur gel de polyacrylamide de dodécyl sulfate de sodium (Page SDS) est un type d'électrophorèse sur gel utilisée pour séparer les protéines. Lorsque l'électrophorèse sur gel est utilisée pour séparer les protéines, des traitements spéciaux sont nécessaires car les protéines ne sont pas chargées négativement comme l'ADN et l'ARN et ne migrent pas vers l'extrémité positive ou l'extrémité négative. Par conséquent, les protéines sont dénaturées et recouvertes d'une charge négative avant l'électrophorèse sur gel. Cela se fait à l'aide d'un détergent appelé dodécyl sulfate de sodium (SDS). L'électrophorèse sur gel qui utilise SDS et un gel de polyacrylamide pour le support est connu sous le nom de page SDS. Cette technique est couramment utilisée en biochimie, génétique, en médecine légale et biologie moléculaire.

Pendant la page SDS, les protéines sont mélangées avec SDS. SDS déploie les protéines en forme linéaire et les recouvre d'une charge négative proportionnelle à leur masse moléculaire. En raison de la charge négative, les molécules de protéines migrent vers l'extrémité de charge positive du gel et se sépare en fonction de leurs masses moléculaires. Dans la page SDS, le polyacrylamide est utilisé comme support solide du gel. La séparation réelle des protéines dépend principalement des propriétés du gel. Par conséquent, la préparation du gel de polyacrylamide doit être soigneusement effectuée et des concentrations correctes de polyacrylamide doivent être utilisées. Les gels de polyacrylamide présentent une haute résolution que les gels d'agarose. Par conséquent, la page SDS est considérée comme une technique à haute résolution pour la séparation des protéines.

La page SDS est un type d'électrophorèse sur gel dénaturant. Il a une limitation majeure de l'analyse des protéines. Puisque SDS dénatur les protéines avant la séparation, elle ne permet pas la détection de l'activité enzymatique, les interactions de liaison aux protéines, les cofacteurs protéiques, etc.

Figure 02: page SDS

Quelle est la différence entre l'électrophorèse sur gel et la page SDS?

Résumé - Page d'électrophorèse sur gel vs SDS

L'électrophorèse sur gel est une technique courante utilisée pour la séparation et l'analyse de l'ADN, de l'ARN et des protéines en fonction de leur taille et de leur charge. Il existe deux principaux types d'électrophorèse sur gel à savoir l'électrophorèse sur gel d'agarose et l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide. Les gels d'agarose sont utilisés principalement pour la séparation de l'acide nucléique; Lorsque une résolution plus élevée est nécessaire, des gels de polyacrylamide sont utilisés. La page SDS est un type d'électrophorèse sur gel couramment utilisée pour séparer les mélanges complexes de protéines. Il est considéré comme une technique de séparation des protéines à haute résolution. C'est la différence entre l'électrophorèse sur gel et la page SDS.

Les références:
1. Nowakowski, Andrew B., William J. Wobig et David H. Pédale. «SDS-PAGE natif: séparation électrophorétique à haute résolution des protéines avec rétention des propriétés natives, y compris les ions métalliques liés. www.NCBI.NLM.NIH.gouvernement. N.p., Mai 2014. la toile. 7 avril. 2017
2. Stellwagen, Nancy C. «L'électrophorèse de l'ADN dans les gels d'agarose, les gels de polyacrylamide et en solution libre.”Électrophorèse. U.S. Bibliothèque nationale de médecine, juin 2009. la toile. 07 avril. 2017

Image gracieuseté:
1. «GelelektrophoResEApparaturat» (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. «Électrophorèse sur gel d'agarose ADN» par School of Natural Resources d'Ann Arbor - DNA Lab (CC par 2.0) via Commons Wikimedia