Différence entre DNTP et DDNTP

Le différence clé entre dntp et ddntp est que DNTP ou les désoxyribonucléotides sont les éléments constitutifs de l'ADN et ont un 3ʹ-OH Groupe sur la structure du sucre pentose tandis que DDNTP ou Didésoxynucléoside Les triphosphates sont des nucléotides qui manquent 3ʹ-GROUPE OH et ils sont utilisés dans la technique de séquençage de l'ADN de Sanger Didésoxy pour produire différentes séquences d'ADN de longueur.

DNTP et DDNTP sont des nucléotides. DNTP fait référence aux nucléotides désoxyribose. Ce sont les éléments constitutifs de l'ADN. Les DNTP sont utilisés pour synthétiser l'ADN. Le DNTP, en revanche, fait référence aux triphosphates didésoxynucléosides. Ils sont utilisés dans le séquençage de Sanger pour terminer la synthèse de l'ADN à différentes longueurs. Ils manquent de groupe OH à 3ʹ position. Un hydrogène est présent en position 3ʹ au lieu du groupe OH. Par conséquent, les DDNTP sont incapables de former une liaison phosphodiester avec le nucléotide suivant. DNTP est capable de réaliser la synthèse de l'ADN, tandis que le DDNTP est capable de terminer la polymérisation de l'ADN.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que DNTP 
3. Qu'est-ce que DDNTP
4. Similitudes entre DNTP et DDNTP
5. Comparaison côte à côte - dntp vs ddntp sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que DNTP?

DNTP signifie désoxyribose nucléotide ou désoxyribonucléotide. C'est le bloc de construction de l'ADN. Il existe quatre types de DNTP. Ce sont DATP, DTTP, DCTP et DGTP. Ils sont nommés selon les bases azotées de la purine ou de la pyrimidine: adénine (A), guanine (G), thymine (T) et cytosine (C).

Figure 01: DNTP

L'adénine et la guanine sont des bases de purine tandis que la thymine et la cytosine sont des bases de pyrimidine. Le sucre pentose du DNTP est désoxyribose. Il y a aussi un groupe de phosphate. Par conséquent, le DNTP est composé de trois composants: une base azotée, du sucre désoxyribose et un groupe phosphate. Ces DNTP se combinent entre eux via des liaisons phosphodiester. Dans les DNTP, il y a un groupe OH attaché à la position 3ʹ de sucre pentose qui est nécessaire pour former un lien avec le groupe phosphate attaché au carbone 5ʹ du sucre du nucléotide suivant. Puisque tous les DNTP ont ce groupe 3ʹ -OH, ils sont capables de synthétiser et d'étendre les brins d'ADN. Par conséquent, le DNTP agit comme l'unité répétitive de base de l'ADN et de la matière chimique des gènes. La synthèse de l'ADN se déroule toujours de 5ʹ à 3ʹ.

Qu'est-ce que DDNTP?

Le séquençage de Sanger est une méthode de séquençage d'ADN de première génération développée par Frederick Sanger et ses collèges en 1977. Il est également connu sous le nom de séquençage de terminaison de chaîne ou de séquençage de didésoxy, car le principe de base de cette méthode est la terminaison de la chaîne en utilisant des triphosphates de didésoxynucléoside (DDNTP). DDNTPS sont des nucléotides utilisés dans le séquençage Sanger. Le séquençage Sanger est basé sur l'incorporation sélective des DDNTP et la terminaison de la synthèse de l'ADN pendant le in vitro Réplication de l'ADN. La spécialité des DDNTP est qu'ils manquent de groupe 3ʹ-OH sur le sucre pentose pour poursuivre la formation de liais. Par conséquent, une fois qu'un DDNTP est attaché au brin étendu, l'allongement de la chaîne cesse et se termine à partir de ce point. Les DDNTP agissent comme des inhibiteurs allongés de la chaîne de l'ADN polymérase pendant la méthode de séquençage Sanger.

Figure 02: ddntp

Il y a quatre DDNTPS: DDATP, DDCTP, DDGTP et DDTTP utilisés dans le séquençage Sanger. Ces nucléotides arrêtent le processus de réplication de l'ADN lorsqu'ils sont incorporés dans le brin croissant de l'ADN. En conséquence, le séquençage de Sanger produit des longueurs variables d'ADN court. L'électrophorèse de gel capillaire est utilisée pour organiser ces brins d'ADN courts par leurs tailles sur un gel. Les DDNTP sont étiquetés par radio ou fluorescence avec différentes couleurs pour la facilité d'analyse de la séquence d'ADN. En analysant le gel, la séquence nucléotidique du brin d'ADN inconnu peut être déterminée.

Quelles sont les similitudes entre DNTP et DDNTP?

• DNTP et DDNTP sont utilisés dans le séquençage Sanger.
• Il existe quatre types de DNTP et DDNTP.
• Ils sont composés de trois composants: une base azotée, des groupes de sucre désoxyribose et de phosphate.

Quelle est la différence entre DNTP et DDNTP?

Le DNTP est l'un des quatre types de désoxyribonucléotides qui sont des éléments constitutifs d'ADN. DDNTP est l'un des quatre types de triphosphates didésoxyribonucléosides utilisés dans la technique de séquençage Sanger. DNTP a un groupe 3ʹ-OH sur le sucre pentose tandis que DDNTP manque de 3ʹ-OH sur le sucre pentose. Ainsi, c'est la principale différence entre DNTP et DDNTP. De plus, les DNTP effectuent une polymérisation de l'ADN tandis que les DDNTP terminent la polymérisation de l'ADN. Par conséquent, c'est une autre différence majeure entre DNTP et DDNTP.

L'infographie ci-dessous répertorie les différences entre DNTP et DDNTP sous forme tabulaire.

Résumé - DNTP vs ddntp

Les DNTP normaux sont des éléments constitutifs de l'ADN tandis que les DDNTP sont des nucléotides utilisés dans la technique de séquençage Sanger. DNTP a 3ʹ-oh tandis que DDNTP n'a pas 3ʹ-oh. Ainsi, c'est la principale différence entre DNTP et DDNTP. De plus, DNTP peut synthétiser un brin d'ADN tandis que le DDNTP peut terminer la polymérisation de l'ADN. Par conséquent, les DDNTP sont utilisés dans le séquençage Sanger afin de produire différents brins d'ADN avec des longueurs variables. Pendant le séquençage Sanger, DNTP et DDNTP sont inclus.

Référence:

1. «Didésoxynucléotide.»Wikipedia, Wikimedia Foundation, 12 juillet 2020, disponible ici.
2. «Structure et fonction de l'ADN.”Lumen, disponible ici.

Image gracieuseté:

1. «Desoxyribonucléotides» par bionet - Personnel de travail (CC0) via Commons Wikimedia

2. «Dideoxy termination de l'allongement de l'ADN en» par Michał Sobkowski - propre travail (CC par 3.0) via Commons Wikimedia