Différence entre CD et ORF
Le différence clé Entre CDS et ORF est que Le CDS est que la séquence nucléotidique réelle d'un gène qui se traduit par une protéine tandis que l'ORF est un étirement de séquence d'ADN qui commence par le site d'initiation de la traduction (codon de démarrage) et se termine par un site de terminaison de traduction (Stop Codon).
Un gène a une séquence de codage (CDS). Il se compose d'exons totaux du gène et d'un codon de départ et d'un codon d'arrêt. C'est la partie réelle du gène qui traduit et produit la protéine. Le cadre de lecture ouvert ou ORF est une séquence nucléotidique située entre un codon de démarrage et un codon d'arrêt. Il n'y a pas de codon d'arrêt à l'intérieur d'un ORF interrompant le code génétique qui se traduit par une protéine. Dans les procaryotes, les CD et l'ORF d'un gène sont les mêmes.
CONTENU
1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que les CD
3. Qu'est-ce que ORF
4. Similitudes entre CD et ORF
5. Comparaison côte à côte - CDS vs ORF sous forme tabulaire
6. Résumé
Qu'est-ce que les CD?
CDS ou séquence codante est la partie du gène qui se traduit réellement par une protéine. Il comprend des exons et deux codons connus sous le nom de codon AUG et Stop Codon. CDS ne contient pas deux régions non traduites: 5 'UTR et 3 ”UTR. De plus, les introns ne sont pas inclus dans les CD.
Figure 01: séquence de codage
Par rapport à l'ensemble du génome d'un individu, les séquences de codage sont une petite fraction. La séquence de codage se compose de la séquence nucléotidique nécessaire pour faire la séquence d'acides aminés de la protéine. Par conséquent, les CD sont des exons concentrés qui peuvent être divisés en triplets ou codons nucléotidiques. Les codons donnent naissance à des acides aminés.
Qu'est-ce qu'un ORF?
Le cadre de lecture ouvert ou ORF est l'étirement continu d'une séquence nucléotidique qui commence par un codon de démarrage et se termine par un codon d'arrêt. En termes simples, ORF fait référence à la région de la séquence nucléotidique située entre les codons de démarrage et d'arrêt. Entre les deux, il n'y a pas de codon d'arrêt interrompant l'ORF. La séquence nucléotidique entre le codon de démarrage et d'arrêt code pour les acides aminés. Généralement, le codon de démarrage est ATG tandis que les codons d'arrêt sont TAG, TAA et TGA. ORF donne une protéine fonctionnelle lorsqu'elle est transcrite et traduite. Par conséquent, ORF comprend un codon de départ, plusieurs codons dans la région du milieu et un codon d'arrêt. Fait intéressant, ORF a une longueur qui peut être divisée par trois.
Figure 02: Crame de lecture ouverte
Dans les procaryotes, car il n'y a pas d'introns, ORF est la séquence codante d'un gène qui transcrit directement dans l'ARNm. Par conséquent, CDS et PRF sont les mêmes dans les procaryotes. Lors de la recherche de gènes dans les procaryotes, il est facile de détecter un ORF et de trouver un gène dans les procaryotes. Dans les eucaryotes, car il y a des introns, ORF est la séquence de codon qui se forme après traitement ou épissage d'ARN. L'ORF est un élément de preuve qui aide la prédiction des gènes car l'ORF est susceptible de faire partie d'un gène.
Quelles sont les similitudes entre les CD et l'ORF?
- Dans les procaryotes, les CD et l'ORF sont les mêmes.
- Les deux ont un codon de démarrage et un codon d'arrêt.
- Ils ont un certain nombre de nucléotides qui peuvent être divisés par trois.
- Une fois qu'ils ont traduit, ils produisent des séquences d'acides aminés.
Quelle est la différence entre les CD et l'ORF?
Le CDS est la partie réelle du gène qui se traduit par une protéine tandis que l'ORF est l'étirement de l'ADN entre un codon de démarrage et un codon d'arrêt. Donc, c'est la principale différence entre les CD et l'ORF. De plus, le CDS ne contient pas d'introns, mais ORF peut contenir des introns. CDS transcrit complètement dans une séquence d'ARNm complète tandis que l'ORF peut faire partie de la séquence d'ARNm. Ainsi, c'est une autre différence entre les CD et l'ORF.
En dessous de l'infographie tabule côte à côte les différences entre les CD et l'ORF.
Résumé - CDS vs ORF
Les CD et l'ORF sont deux parties importantes d'un gène. CDS fait référence à la région réelle de l'ADN qui se traduit par une protéine. ORF est une séquence d'ADN qui commence par le codon de démarrage «ATG» et se termine par l'un des trois codons de terminaison (TAA, TAG ou TGA). ORF peut faire partie de l'ARNm complet d'un gène. Cependant, la séquence de codage d'un gène transcrit pour terminer la séquence d'ARNm. Tous les CDS sont ORFS. Mais tous les ORF ne sont pas CDSS. Ainsi, cela résume la différence entre les CD et l'ORF.
Référence:
1. "Cadre de lecture ouvert.»Wikipedia, Wikimedia Foundation, 27 novembre. 2020, disponible ici.
Image gracieuseté:
1. «Région de codage dans l'ADN» par Pragpats - Propre travaux (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia
2. «Sampleorf» par Luongdl - Propre travaux (domaine public) via Commons Wikimedia
