Quelle est la différence entre ZFN Talen et Crispr

Le différence clé Entre ZFN Talen et Crispr est que ZFN est une technique d'édition de gènes d'origine humaine basée sur des nucléases de doigt de zinc composées d'un domaine de doigt du zinc et d'un domaine d'endonucléase FOK1. Pendant ce temps, Talen est une technique d'édition de gènes artificielle basée sur des protéines de fusion composées d'une protéine de conte bactérienne et d'une endonucléase FOK1, et CRISPR est un mécanisme de défense bactérienne à base d'ARN naturel qui est entraîné par deux types d'ARN et de protéines CAS associées.

Les outils d'édition de gènes sont basés sur les nucléases d'ingénierie composées de domaines de liaison spécifiques à la séquence et des modules de clivage d'ADN non spécifiques. ZFN, Talen et Crispr sont trois types de techniques d'édition de gènes. Zen et Talen sont des systèmes artificiels, tandis que CRISPR est un système naturel survenant chez les bactéries. Les trois systèmes reconnaissent les séquences et clivent de l'ADN cible. Les nucléases de doigt en zinc sont composées d'un domaine de doigt du zinc et d'une endonucléase FOK1. Les talens sont composés d'une protéine de conte bactérienne et d'une endonucléase FOK1. CRISPR est composé de deux ARN (ARNr trans-activant et d'un seul ARN guide).

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que ZFN 
3. Qu'est-ce que Talen  
4. Qu'est-ce que CRISPR
5. Similitudes - Talen ZFN et CRISPR
6. Zfn vs talen vs crispr sous forme tabulaire
7. Résumé - ZFN vs talen vs crispr

Qu'est-ce que ZFN?

ZFN est un outil d'édition de gènes basé sur les nucléases à doigt du zinc. Les nucléases de doigt en zinc sont des nucléases chimériques composées de domaines de liaison à l'ADN spécifiques à la séquence et des domaines de clivage d'ADN non spécifiques à partir de l'endonucléase de restriction FOKI. Il s'agit d'une technologie d'édition du génome artificielle qui permet une large gamme de modifications des gènes en induisant des ruptures à double brin dans l'ADN.

Figure 01: ZFN

ZFN est un outil important lors de l'introduction d'altérations ciblées des plantes et de plusieurs espèces de cultures. Il permet l'incorporation de traits précieux dans les plantes. De plus, ZFN a un potentiel thérapeutique car il est capable d'effectuer une modification génétique précise pour éliminer efficacement les symptômes.

Qu'est-ce que Talen?

Les nucléases de type activateur de transcription (Talen) sont un outil d'édition de gène basé sur des nucléases chimériques similaires à ZFN. C'est aussi une technologie d'édition génomique d'origine humaine. Talen induit la modification des gènes en induisant des ruptures de double brin dans l'ADN. Les talens sont composés de domaines de liaison à l'ADN spécifiques à la séquence fusionnés à un module de clivage d'ADN non spécifique. Par conséquent, il a des domaines de clivage Foki et des domaines de liaison à l'ADN dérivés de protéines de conte.

Figure 02: Talen

Les protéines de conte se produisent naturellement dans le genre bactérien Xanthomonas. Ces protéines contiennent des domaines de liaison à l'ADN composés d'une série de 33 à 35 domaines de répétition d'acides aminés. L'un des principaux avantages du talent sur ZFN est que la spécificité de liaison du domaine de liaison à l'ADN peut être modifiée dans le talent en apportant des modifications à 33-34 répétitions d'acides aminés.

Qu'est-ce que CRISPR?

Crispr représente Répéties palindromiques courtes entre les réglementations et les répétitions palindromiques. Il s'agit d'un mécanisme de défense naturel basé sur l'ARN exécuté dans les bactéries. En fait, c'est un mécanisme d'édition de génome utilisé en particulier contre les virus. Un virus ou un envahisseur étranger peut activer ce système en bactéries. CRISPR travaille avec la protéine associée à CRISPR (CAS9).

CRISPR se compose de deux ARN: CRRNA trans-activant et un seul guide ARN. Par conséquent, la reconnaissance de CRISPR dépend de ces deux ARN. Lorsque l'ADN viral entre dans une cellule bactérienne, le locus CRISPR produit de l'ARN guide, qui escorte les protéines CAS pour atteindre et se lier avec l'ADN viral et cliver à un endroit spécifique. Une fois l'ADN viral clivé, il devient inactif en raison du silence de l'ADN pathogène. Par conséquent, le système CRISPR capture, clive et inactive les virus à l'aide de protéines CAS.

Figure 03: CRISPR / CAS9

CRISPR / CAS9 est utilisé comme système d'édition de génome. C'est une technologie récente. Cette technologie est très simple, efficace et rentable par rapport aux autres techniques d'édition du génome. Par rapport à ZFN et Talen, le système CRISPR / CAS9 est un outil efficace pour induire des altérations du génome ciblées.

Quelles sont les similitudes entre ZFN Talen et CRISPR?

• ZFN, Talen et Crispr sont des techniques d'édition de gènes.
• Les trois outils seront des techniques prometteuses pour corriger les causes génétiques derrière de nombreuses maladies.
• Cependant, ils montrent des contraintes dans le ciblage, la spécificité imparfaite et le ciblage des gènes.
• Les trois systèmes peuvent induire des pauses à double brin.

Quelle est la différence entre ZFN Talen et Crispr?

ZFN est une technique d'édition de gènes basée sur les nucléases du doigt de zinc tandis que le talen est une technique d'édition de gènes basée sur des protéines de fusion composées d'une protéine de conte bactérienne et d'une endonucléase FOK1, et CRISPR est un mécanisme de défense bactérienne à base d'ARN naturel qui est entraîné par deux types d'ARN et protéines CAS associées. Donc, c'est la principale différence entre ZFN Talen et CRISPR.

L'infographie ci-dessous répertorie les différences entre le talent ZFN et CRISPR sous forme tabulaire pour une comparaison côte à côte.

Résumé - ZFN vs talen vs crispr

ZFN, Talen et CRISPR sont des technologies d'édition de gènes. CRISPR est la technologie récente qui montre une meilleure efficacité, faisabilité et application clinique à plusieurs rôles. ZFN et Talen sont tous deux des outils artificiels artificiels, tandis que CRISPR est un mécanisme de défense des bactéries. ZFN et Talen sont des nucléases conçues. CRISPR se compose de deux types d'ARN associant aux protéines CAS. Ainsi, c'est le résumé de la différence entre ZFN Talen et Crispr.

Référence:

1. Gaj, Thomas, et al. «Les méthodes de ZFN, Talen et CRISPR / CAS pour l'ingénierie du génome.«Tendances en biotechnologie, u.S. Bibliothèque nationale de médecine, juillet 2013.
2. Khan, Sikandar Hayat. «Technologies d'édition du génome: concept, avantages et inconvénients de diverses techniques d'édition du génome et préoccupations bioéthiques pour l'application clinique.”Thérapie moléculaire - acides nucléiques, presse cellulaire, 3 avril. 2019.

Image gracieuseté:

1. «Nucléases d'ingénierie» par Farzad Jamshidi - PowerPoint (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. «Aperçu des talens» par OgletReerd - Propre travaux (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia
3. «CRISPR» par James Atmos - Propre travaux (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia