Quelle est la différence entre l'endonucléase de restriction de type 1 2 et 3

Le différence clé Entre l'endonucléase de restriction de type 1 2 et 3 est que le site de clivage de l'endonucléase de restriction de type 1 est aléatoire et est éloigné du site de reconnaissance, tandis que le site de clivage de l'endonucléase de restriction de type 2 est sur le site de reconnaissance et que le site de clivage de l'endonucléase de restriction de type 3 est de 20-30 paires de base en aval du site de reconnaissance.

Enzyme d'endonucléase ou de restriction de restriction est une enzyme qui aide à cliver l'ADN en fragments sur ou à proximité de sites de reconnaissance spécifiques dans les molécules appelées sites de restriction. Ils tombent dans la classe des enzymes plus larges du groupe d'endonucléase. Les endonucléases de restriction sont généralement classées en cinq types en fonction de leurs structures, le site de reconnaissance spécifique auquel ils ont coupé leur substrat d'ADN, et sur la base de si les sites de reconnaissance et de clivage sont séparés les uns des autres ou non. Afin de couper ou de cliver l'ADN, toutes les enzymes de restriction produisent deux incisions, une fois à travers chaque squelette de sucre-phosphate de l'ADN Double Helix. Des enzymes de restriction sont présentes dans les bactéries et les archées pour fournir des mécanismes de défense contre les invasions des virus.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que l'endonucléase de restriction de type 1
3. Qu'est-ce que l'endonucléase de restriction de type 2
4. Qu'est-ce que l'endonucléase de restriction de type 3
5. Similitudes - Endonucléase de restriction de type 1 2 et 3
6. Type 1 vs 2 vs 3 Endonucléase de restriction sous forme tabulaire
7. Résumé - Type 1 vs 2 vs 3 Restriction Endonucléase

Qu'est-ce que l'endonucléase de restriction de type 1?

L'endonucléase de restriction de type 1 est un complexe enzymatique avec des activités de restriction et de méthylase. Il est identifié dans deux souches différentes de E. coli. Enzymes de restriction de type 1 coupées sur un site qui diffère et est une distance aléatoire loin du site de reconnaissance. Le clivage de ces sites aléatoires suit un processus de translocation de l'ADN. Ces enzymes sont multifonctionnelles et ont la capacité des activités de digestion et de modification des restrictions en fonction de l'état de méthylation de l'ADN ciblé. Les co-facteurs S-adénosyl méthionine (ADomet), l'adénosine triphosphate hydrolysée (ATP) et les ions magnésium (mg ²⁺) sont essentiels pour leur pleine activité.

Les enzymes de restriction de type 1 sont composées de trois sous-unités appelées HSDR, HSDM et HSD. HSDR est requis pour la digestion des restrictions. HSDM est requis pour que l'ajout de groupes méthyle héberge l'ADN. Ce processus est connu sous le nom d'activité de méthyltransférase. HSDS est requis pour la reconnaissance de sites de liaison à l'ADN spécifiques. Il est également important dans la digestion des restrictions ainsi que dans l'activité de la méthyltransférase.

Qu'est-ce que l'endonucléase de restriction de type 2?

L'endonucléase de restriction de type 2 est un type d'enzyme de restriction qui aide à cliver l'ADN à des positions spécifiques, soit à l'intérieur ou à proximité du site de reconnaissance de restriction. Ils forment des homodimères avec des sites de reconnaissance qui sont indivis et palindromiques, avec quatre à huit nucléotides de longueur. Les enzymes de restriction de type 2 ne nécessitent pas d'ATP ou d'adomet pour leur activité, mais mg²⁺ est requis en tant que cofacteur. Ces enzymes aident au clivage des liaisons phosphodiester de l'ADN double hélice. Ils s'accrochent au centre des deux brins afin de produire une extrémité émoussée ou de s'adapter à une position décalée, laissant les surplombs appelés extrémités collantes.

Les endonucléases de restriction de type 2 sont l'enzyme de restriction la plus couramment disponible car elles produisent des fragments discrets par digestion par restriction en coupant spécifiquement au site ou proche du site de reconnaissance. Les endonucléases de restriction de type 2 appartiennent à une grande famille; Par conséquent, ils sont divisés en sous-familles en fonction de l'écart par rapport aux caractéristiques typiques de ces enzymes. Ces sous-catégories incluent le type 2B, 2E, 2F, 2G, 2S et 2T.

Qu'est-ce que l'endonucléase de restriction de type 3?

L'endonucléase de restriction de type 3 est un type d'enzyme de restriction qui reconnaît deux séquences non palindromiques distinctes qui sont orientées inversement. Ils clivent généralement l'ADN d'environ 20 à 30 paires de bases en aval du site de reconnaissance. Ces enzymes se composent de plus d'une sous-unité. Ils ont également besoin de l'ATP et de l'adomet pour leur activité. Les enzymes de restriction de type 3 sont essentielles dans les mécanismes de modification de la restriction de l'ADN procaryote. Ces enzymes aident à protéger l'organisme contre l'invasion de l'ADN étranger.

Les enzymes de type 3 sont des protéines hétéro-oligomères et multifonctionnelles composées de deux sous-unités. Ils sont Res et Mod. La sous-unité RES est importante dans la digestion des restrictions; Cependant, il n'a aucune activité enzymatique en soi. La sous-unité MOD aide à la reconnaissance des séquences d'ADN spécifiques au système et est une méthyltransférase de modification. Les enzymes de restriction de type 3 reconnaissent également les séquences d'ADN asymétriques longues 5 à 6. Ces enzymes méthylent un seul brin de l'ADN et sont suffisantes pour se protéger contre la digestion des restrictions.

Quelles sont les similitudes entre l'endonucléase de restriction de type 1 2 et 3?

• Les endonucléases de restriction de type 1, de type 2 et de type 3 sont trois enzymes de restriction.
• Ils sont responsables du clivage de l'ADN sur des sites spécifiques appelés sites de reconnaissance de restriction dans la molécule.
• Ils appartiennent à une classe plus large d'endonucléase.
• Ils font deux incisions, une fois dans chacune des deux stériles de sucre-phosphate de la double hélice d'ADN.
• Ils sont présents dans les bactéries et les archées.
• De plus, ils aident à se protéger contre les virus envahisseurs.
• Les trois enzymes ont la capacité à la fois pour la digestion des restrictions et l'activité de la méthyltransférase.
• Les enzymes de restriction ont coupé l'ADN étranger par digestion de restriction.
• La méthyltransférase est l'enzyme de modification présente dans les trois enzymes.

Quelle est la différence entre l'endonucléase de restriction de type 1 2 et 3?

Le site de clivage de l'endonucléase de restriction de type 1 est aléatoire et loin du site de reconnaissance, tandis que dans l'endonucléase de restriction de type 2, il se trouve sur le site de reconnaissance. Alors que, dans l'endonucléase de restriction de type 3, le site de clivage est de 20 à 30 paires de bases en aval du site de reconnaissance. Ainsi, c'est la principale différence entre l'endonucléase de restriction de type 1 2 et 3. De plus, l'endonucléase de restriction de type 1 se compose de trois sous-unités et est considérée comme une enzyme bifonctionnelle avec des activités de restriction et de méthylase. L'endonucléase de restriction de type 2 se compose de deux sous-unités et a des activités de restriction et de méthylase distinctes. Et, l'endonucléase de restriction de type 3 se compose de plus d'une sous-unité, généralement deux, et est également une enzyme bifonctionnelle avec des activités de restriction et de méthylase.

L'infographie ci-dessous présente les différences entre l'endonucléase de restriction de type 1 2 et 3 sous forme tabulaire pour comparaison côte à côte.

Résumé - Type 1 vs 2 vs 3 Restriction Endonucléase

L'endonucléase de restriction aide à cliver l'ADN en fragments sur ou à proximité de sites de reconnaissance spécifiques dans les molécules. L'endonucléase de restriction de type 1, de type 2 et de type 3 est trois enzymes de restriction. Le site de clivage de l'endonucléase de restriction de type 1 est aléatoire et loin du site de reconnaissance. Le site de clivage de l'endonucléase de restriction de type 2 est sur le site de reconnaissance, tandis que le site de clivage de l'endonucléase de restriction de type 3 est de 20 à 30 paires de bases en aval du site de reconnaissance. Ainsi, cela résume la différence entre l'endonucléase de restriction de type 1 2 et 3.

Référence:

1. Loenen, W. UN., et al. «Les enzymes de restriction de type I et leurs proches.”Nucleic Acids Research, Vol. 42, non. 1, 2013, pp. 20-44.
2. Rao, Desirazu n., et al. «Enzymes de modification des restrictions de type III: une perspective historique.”Nucleic Acids Research, Vol. 42, non. 1, 2013, pp. 45-55.
3. «Endonucléases de restriction.«Un aperçu | Sujets ScienceDirect.

Image gracieuseté:

1. «Étapes du clonage moléculaire» par Alexpicardal97 - Propre travaux (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia
2. «Site de restriction hindiii et vecteur de fins collantes» par Helixitta - Propre travaux (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia
3. «Polymorphisme de longueur de fragment de restriction» par Lolyas39 - Propre travaux (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia