Quelle est la différence entre Shine Dalgarno et Kozak Sequence
Le différence clé Entre Shine Dalgarno et Kozak Sequence Est-ce que la séquence Shine Dalgarno est un site de liaison ribosomale dans l'ARN messager bactérien et archéal, tandis que la séquence de kozak est un site d'initiation de traduction des protéines dans la plupart des ARN messager eucaryotes.
SHINE Dalgarno et Kozak Sequence sont deux séquences consensuelles qui sont très importantes pour l'initiation de la traduction. En biologie moléculaire, la traduction est le processus par lequel les ribosomes du cytoplasme synthétisent les protéines après le processus de transcription. En traduction, un ARNm (ARN messager) est décodé dans un ribosome pour produire une chaîne d'acides aminés spécifique à l'extérieur du noyau. En règle générale, un ribosome induit le processus de décodage en facilitant la liaison des séquences complémentaires de l'anticodon d'ARNt aux codons d'ARNm. La traduction se déroule en trois étapes: initiation, allongement et résiliation.
CONTENU
1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que la séquence Shine Dalgarno
3. Qu'est-ce que la séquence Kozak
4. Similitudes - Séquence Shine Dalgarno et Kozak
5. Shine Dalgarno vs Kozak Séquence sous forme tabulaire
6. Résumé - Shine Dalgarno vs Kozak Séquence
Qu'est-ce que la séquence Shine Dalgarno?
La séquence de Dalgarno Shine est un site de liaison ribosomale dans l'ARN messager bactérien et archéen. Il est généralement situé autour de 8 bases en amont du codon de départ août. Cette séquence d'ARN aide à recruter des ribosomes à l'ARN messager en alignant le ribosome avec un codon de démarrage d'ARNm. Ainsi, il initie la synthèse des protéines. Une fois après le recrutement, l'ARNt peut ajouter des acides aminés en séquence comme dicté par les codons d'ARNm. Cette séquence spéciale est courante dans les bactéries mais plus rare dans les archées. De plus, il est également présent dans les transcriptions chloroplastes et mitochondriales. Shine Dalgarno Sequence a été proposée pour la première fois par les scientifiques australiens John Shine et Lynn Dalgarno. La séquence consensus de six bases est Aggagg. Par exemple, dans Escherichia coli La séquence est Aggaggu.
Figure 01: Séquence Shine Dalgarno
La sélection du site d'initiation (AUG) dépend de l'interaction entre la sous-unité des années 30 du modèle de ribosome et d'ARNm. La région riche en pyrimidine sur la composante 16SRNA de la sous-unité des années 30 se lie à la région riche en purines connue sous le nom de séquence de Shine Dalgarno en amont du codon d'initiation d'AUG dans l'ARNm. De plus, lors de la formation du complexe d'initiation, ces séquences nucléotidiques complémentaires se marient pour former une structure d'ARN double brin. Cela facilite la liaison de l'ARNm à un ribosome de telle manière que le codon d'initiation est placé sur le site p du ribosome.
Qu'est-ce que la séquence Kozak?
La séquence de Kozak est un site d'initiation de traduction des protéines dans la plupart des ARNm eucaryotes. Cette séquence est également appelée la séquence consensus de Kozak. La séquence de Kozak est la séquence optimale pour l'initiation de la traduction chez les eucaryotes. Cette séquence fait partie intégrante de la régulation des protéines. Il est également très important pour la santé cellulaire globale. Il aide à corriger la traduction des protéines des messages génétiques en médiant l'assemblage des ribosomes et l'initiation de la traduction.
Figure 02: Séquence de Kozak
Cette séquence a été nommée d'après le scientifique qui l'a découverte, Marilyn Kozak. Elle l'a découvert à travers une analyse détaillée des séquences génomiques d'ADN. La séquence de Kozak est de 5 '(GCC) GCCRCCAUGG-3'. Les lettres des cas supérieures indiquent des bases conservées, tandis que les lettres de cas inférieur indiquent des bases variables communes. R indique une purine (adénine ou guanine) qui est toujours positionnée à cet endroit.
Quelles sont les similitudes entre Shine Dalgarno et Kozak Sequence?
- SHINE Dalgarno et Kozak Sequence sont deux séquences consensuelles qui sont très importantes dans l'initiation de la traduction.
- Les deux sont des séquences d'ARN.
- La plus petite sous-unité du ribosome se lie aux deux séquences.
- Les deux séquences médiatisent l'assemblage ribosome et l'initiation de la traduction.
- Ce sont des aspects intégraux de la régulation des protéines et de la santé cellulaire globale.
Quelle est la différence entre Shine Dalgarno et Kozak Sequence?
La séquence de Dalgarno Shine est un site de liaison ribosomal trouvé dans l'ARN messager bactérien et archéal, tandis que la séquence de kozak est un site d'initiation de traduction des protéines trouvés dans la plupart des ARN messager eucaryotes. Donc, c'est la principale différence entre Shine Dalgarno et Kozak Sequence. De plus, la séquence de Dalgarno Shine est de 5'Aggaggu3 'tandis que la séquence de Kozak est de 5' (gcc) gccrccaugg-3 '.
L'infographie suivante répertorie les différences entre la séquence Shine Dalgarno et Kozak sous forme tabulaire pour une comparaison côte à côte.
Résumé - Shine Dalgarno vs Kozak Séquence
Les séquences Shine Dalgarno et Kozak sont deux séquences d'ARN consensuelles qui sont très importantes pour l'assemblage des ribosomes et l'initiation de la traduction. La séquence de Dalgarno Shine est un site de liaison ribosomale dans l'ARN messager bactérien et archéal, tandis que la séquence de kozak est un site d'initiation de traduction des protéines dans la plupart des ARN messager eucaryotes. Ainsi, cela résume la différence entre la séquence Shine Dalgarno et Kozak.
Référence:
1. «Séquence Shine-Dalgarno.«Un aperçu | Sujets ScienceDirect.
2. «Séquence consensus de Kozak.«Un aperçu | Sujets ScienceDirect.
Image gracieuseté:
1. «Shine-Dalgarno Sequence-es» par Shakestone. Versión en Español de Alejandro Porto - Fichier: Séquence Shine-Dalgarno.png (cc by-sa 3.0) via Commons Wikimedia
2. «Règlement de la traduction par 5 'leader de transcription CIS-Elements» par APFEL412 - PROPRE WORK (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia
