Quelle est la différence entre les rétrotransposons LTR et non LTR

Le différence clé entre les rétrotransposons LTR et non LTR est que les rétrotransposons LTR sont un type de rétrotransposons qui ont des répétitions terminales longues dans leur structure, tandis que les rétrotransposons non LTR sont un type de rétrotransposons qui n'ont pas de répétitions terminales longues dans leur structure dans leur structure.

Les rétrotransposons (des éléments ou transposons transposables de classe I via des intermédiaires d'ARN) sont un type de composant génétique qui peut se copier et se coller dans différents emplacements génomiques. Ils effectuent cela en convertissant l'ARN en ADN par un processus appelé transcription inverse en utilisant un intermédiaire de transposition d'ARN. Il existe deux principaux types de rétrotransposons que les rétrotransposons LTR et non LTR

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Que sont les rétrotransposons LTR
3. Que sont les rétrotransposons non LTR
4. Similitudes - rétrotransposons LTR et non LTR
5. LTR vs rétrotransposons non LTR sous forme tabulaire
6. Résumé - LTR vs rétrotransposons non LTR

Que sont les rétrotransposons LTR?

Les rétrotransposons LTR sont un type de rétrotransposons qui ont des répétitions terminales longues dans leur structure. De longues brins d'ADN répétitif peuvent être trouvés à chaque extrémité d'un rétrotransposon LTR. Ceux-ci sont connus comme des répétitions terminales longues (LTR). Chaque LTR mesure quelques centaines de paires de bases longues. Les rétrotransposons LTR mesurent généralement plus de 5 kilobases de long. De plus, entre les répétitions terminales longues, il existe des gènes qui peuvent être transcrits équivalents aux gènes de rétrovirus gag et pol. Ces gènes se chevauchent pour qu'ils codent pour une protéase qui traite normalement la transcription résultante en produits de gène fonctionnel.

Figure 01: rétrotransposons LTR

Gag Le gène des rétrotransposons fabrique un produit qui s'associe à d'autres transcrits de rétrotransposons pour former des particules de type virus. Pol Le gène fabrique des produits qui incluent des enzymes telles que la transcriptase inverse, l'intégrase et les domaines Ribonucléase H. L'enzyme de transcriptase inverse effectue la transcription inverse de l'ADN rétrotransposon. L'enzyme d'intégrase intègre l'ADN rétrotransposon dans l'ADN du génome eucaryote. Les domaines de la ribonucléase H sont utiles pour cliver les liaisons de phosphodiester entre les intermédiaires d'ARN. Les rétrotransposons LTR codent également les transcrits avec des sites de liaison ARNt afin qu'ils puissent subir une transcription inverse assez facilement. De plus, comme le rétrotransposon contient des informations sur le génome eucaryote, il peut insérer des copies de lui-même dans d'autres emplacements génomiques dans une cellule eucaryote.

Que sont les rétrotransposons non LTR?

Les rétrotransposons non LTR sont un type de rétrotransposons qui n'ont pas de répétitions terminales longues dans leur structure. Comme les rétrotransposons LTR, les rétrotransposons non LTR contiennent également des gènes pour la transcriptase inverse, la protéine de liaison à l'ARN, la nucléase et parfois les domaines de la ribonucléase H. Mais ils n'ont pas les répétitions terminales longues; Au lieu de cela, ils ont de courtes répétitions qui peuvent avoir un ordre inversé de bases les uns à côté les uns des autres. Les protéines de liaison à l'ARN se lient à l'intermédiaire de transposition de l'ARN, et les nucléases brisent les liaisons phosphodiester entre les nucléotides dans les acides nucléiques.

Figure 02: rétrotransposons LTR et non LTR

Bien qu'ils soient des rétrotransposons, ils ne peuvent pas effectuer une transcription inverse en utilisant un intermédiaire d'ARN de la même manière que les rétrotransposons LTR. En effet, les rétrotransposons non LTR ne contiennent pas de séquences qui se lient. Par conséquent, un rétrotransposon non-LTR transcrit en ARNm et traduit en protéines agit comme transcriptase inverse. La transcriptase inversée fait une copie d'ADN de l'ARN du rétrotransposon non LTR qui peut être intégrée dans le génome d'un nouveau site. De plus, les rétrotransposons non LTR se disent en deux types: les lignes (longs éléments nucléaires entrecoupés) et les sinus (éléments nucléaires entrecoupés) courts).

Quelles sont les similitudes entre les rétrotransposons LTR et non-LTR?

• Les rétrotransposons LTR et non LTR sont les deux principaux types de rétrotransposons.
• Les deux types contiennent des gènes pour des enzymes telles que la transcriptase inverse, la protéine de liaison à l'ARN, la nucléase et.
• Ils peuvent être trouvés dans le génome humain.
• Les deux types sont évolutifs importants.

Quelle est la différence entre les rétrotransposons LTR et non LTR?

Les rétrotransposons LTR ont des répétitions terminales longues dans leur structure, tandis que les rétrotransposons non LTR manquent de répétitions terminales longues dans leur structure. Ainsi, c'est la principale différence entre les rétrotransposons LTR et non-LTR. De plus, les rétrotransposons LTR ont de longues répétitions directes qui ne sont qu'une séquence de bases se répétant elles-mêmes. D'un autre côté, les rétrotransposons non LTR ont de courtes répétitions qui peuvent avoir un ordre inversé de bases les uns à côté les uns des autres.

L'infographie ci-dessous présente les différences entre les rétrotransposons LTR et non-LTR sous forme tabulaire pour une comparaison côte à côte.

Résumé - LTR vs rétrotransposons non LTR

Les rétrotransposons LTR et non LTR sont les deux principaux types de rétrotransposons. Les rétrotransposons LTR ont des répétitions terminales longues dans leur structure, tandis que les rétrotransposons non LTR n'ont pas de répétitions terminales longues dans leur structure. C'est donc la principale différence entre les rétrotransposons LTR et non-LTR.

Référence:

1. Havecker, Ericrica R, et al. «La diversité des rétrotransposons LTR - Biologie du génome.»Biomed Central, Biomed Central, 18 mai 2004.
2. Han, Jeffrey S. «Reprotransposons de répétition terminale non longue (non-LTR): mécanismes, développements récents et questions sans réponse - ADN mobile.»Biomed Central, Biomed Central, 12 mai 2010.

Image gracieuseté:

1. «LTR Retrotransposon» par Mariuswalter - Propre travaux (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia
2. «Composantes du génome humain» par Alglascock - Propre travaux (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia