Différence entre la synténie et la colinéarité

Le différence clé entre la syntension et la colinéarité est que Synteny est la colocalisation physique des loci génétiques sur le même chromosome chez les espèces, tandis que la cololisation physique est la colocalisation physique des loci génétiques sur le même chromosome dans différentes espèces en conservant le même ordre.

Synteny et Collinearity sont deux termes qui sont utilisés de manière interchangeable dans la génomique. Les deux termes décrivent les modèles de localisation des gènes sur les chromosomes chez différentes espèces. Ces arrangements de gènes connexes parmi les taxons sont des informations précieuses lors de la déduction d'ascendance partagée des gènes. Synteny fait référence à la colocalisation physique des loci génétiques sur le même chromosome chez les espèces. La colinéarité fait référence à la colocalisation physique des loci génétiques sur le même chromosome dans différentes espèces en conservant le même ordre. Par conséquent, c'est une forme de syntension.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que Synteny 
3. Qu'est-ce que la colinéarité
4. Similitudes entre Synteny et Collinarity
5. Comparaison côte à côte - Synteny vs colinéarité sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que Synteny?

Dans différentes espèces, il existe un ensemble de gènes situés sur le même chromosome. Et, cette colocalisation physique des gènes sur le même chromosome dans différentes espèces est connue sous le nom de syntension. De plus, ces gènes se trouvent très proches les uns des autres sur un seul chromosome. L'ordre des gènes peut ne pas être nécessairement le même. Mais, la localisation de gènes proches les unes des autres sur le même chromosome se déroule en syntension. Par conséquent, Synteny décrit principalement le modèle de distribution des gènes sur un chromosome. Ces modèles de colocalisation des gènes indiquent des relations entre différentes espèces et leur évolution. Cependant, la synténie peut être perturbée en raison de réarrangements chromosomiques tels que les translocations, l'inversion et la fusion chromosomique, etc. duplications, perte et recombinaison homologue inégale.

Figure 01: Synteny

On pense que tous les gènes liés sont synténiques. Cependant, tous les gènes synténiques ne sont pas nécessairement liés. Ils possèdent des séquences chromosomiques communes. Les humains ont de nombreux gènes synténiques avec d'autres mammifères. De plus, de nombreuses céréales ont des gènes synténiques.

Qu'est-ce que la colinéarité?

La colinéarité est une forme plus spécifique de syntension dans laquelle un ensemble de gènes est situé sur le même chromosome d'espèces différentes dans le même ordre que chez les espèces ancestrales. Par conséquent, s'il y a un écart par rapport à la colinéarité, ce sera un caractère phylogénétique plus fiable puisque la colinéarité explique l'ascendance partagée des gènes.

Figure 02: colinéarité

L'analyse de colinéarité multiseaux fournit des informations beaucoup plus fiables sur les espèces apparentées et leur phylogénie.

Quelles sont les similitudes entre Synteny et Collinarity?

• Dans la synténie et la colinéarité, un ensemble de loci dans deux espèces différentes est situé sur le même chromosome.
• Ces termes décrivent la colocalisation physique des loci génétiques sur le même chromosome.
• La colinéarité est une forme plus spécifique de syntension.
• Parfois, les deux termes sont utilisés de manière interchangeable en génomique.
• Si deux régions ont une colinéarité, elles sont évidemment syntennes.
• Ils sont utiles pour déduire la phylogénie.

Quelle est la différence entre Synteny et Collinearity?

Synteny et Collinearity sont deux termes qui sont utilisés de manière interchangeable dans la génomique. Synteny fait référence à la colocalisation physique d'un ensemble de gènes dans le même chromosome chez différentes espèces. La colinéarité est une forme de syntension dans laquelle l'ensemble des gènes est colocalisé dans le même ordre parmi les différentes espèces. Par conséquent, c'est la principale différence entre Synteny et Collinarity.

Résumé - Synteny vs colinéarité

Les termes syntension et colinéarité se réfèrent à un ensemble de gènes situés sur le même chromosome dans différentes espèces. En fait, ces gènes sont co-localisés dans le même chromosome chez différentes espèces. Synteny décrit la colocalisation physique des gènes définis sur le même chromosome chez différentes espèces, tandis que la colinéarité est une forme plus spécifique de synténie dans laquelle l'ensemble des gènes est colocalisé dans le même ordre. Ainsi, cela résume la différence entre la synténie et la colinéarité.

Référence:

1. «Synteny». En.Wikipédia.Org, 2020, disponible ici.
2. «Génomique et génomique comparative». Intégration marie.Net, 2020, disponible ici.

Image gracieuseté:

1. «Synteny de la souris humaine» par Sinha Au, Meller J. - BMC Bioinformatique. 2007 8 mars; 8: 82 [PMID: 17343765] (CC par 2.0) via sscommons wikimedia