Différence entre le gel d'empilement et le gel de séparation

Différence clé - Gel d'empilement vs séparation Gel
 

Les termes empilant du gel et du gel séparant sont utilisés pour expliquer la technique SDS-PAGE. L'électrophorèse sur gel du dodécyl sulfate-polyacrylamide SDS-PAGE ou sodique est une technique de laboratoire qui est utilisée pour séparer les molécules de protéines en fonction de leurs poids moléculaires. La théorie derrière la technique est que les protéines avec différents poids moléculaires montrent différents taux de migration; Les molécules de faible poids moléculaire migrent plus rapidement tandis que les molécules de poids moléculaire élevé migrent lentement. Le milieu de la migration est un gel. Il existe deux types de gels nommés en gel d'empilement et gel de séparation. Le différence clé Entre le gel d'empilement et le gel séparant est que Le pH du gel d'empilement est 6.8 tandis que le pH du gel de séparation est 8.8.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que le gel d'empilement
3. Qu'est-ce que le gel séparant
4. Relation entre le gel d'empilement et le gel séparant
5. Comparaison côte à côte - gel d'empilement vs gel séparant sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que le gel d'empilement?

Le gel d'empilement est un gel de polyacrylamide à faible concentration qui est placé sur le dessus du gel de résolution plus concentré (gel de séparation) dans la technique SDS-PAGE. Le gel d'empilement est utilisé pour améliorer la résolution de l'électrophorèse. La résolution augmente en raison de la différence entre les concentrations de gel d'empilement et le gel de résolution qui effet sur les protéines de l'échantillon. Étant donné que la concentration de polyacrylamide dans le gel d'empilement est faible, la taille des pores est plus élevée. Cela aide également à augmenter la séparation.

Le gel d'empilement est un gel de polyacrylamide lâche avec de gros pores d'environ 7% de polyacrylamide. Ces pores n'agissent pas comme une barrière considérable pour les grandes molécules de protéines. Par conséquent, ce gel affecte légèrement la mobilité de ces protéines. Cela fait la séparation en fonction de la mobilité et de la taille des protéines en les concentrant entre deux gels.

Figure 01: gel d'acrylamide SDS-PAGE

Le pH du gel d'empilement est 6.8. Son pH est acide que celui de la résolution du gel par 2 unités de pH. Ce pH implique une résistance ionique inférieure, d'où une résistance électrique plus élevée. Cela provoque la mobilité des protéines que les autres particules chargées présentes dans le gel.

Qu'est-ce que le gel séparant?

Le gel séparant ou le gel de résolution d'une SDS-PageTechnique est un gel de polyacrylamide hautement concentré qui est placé sur le haut du gel d'empilement à faible concentration. Le gel de séparation contient une quantité élevée de polyacrylamide (10%). Le pH de ce gel est maintenu comme pH = 8.8, qui est un niveau de pH plus élevé que celui du gel d'empilement.

Figure 02: un appareil électrophorèse sur gel

Lorsque les molécules de protéines atteignent le gel de séparation, la migration de ces molécules est ralentie car le gel de séparation est un gel à haute concentration avec une petite taille de pores qui peut agir comme une barrière considérable pour le mouvement des molécules protéiques. Ce ralentissement permet aux autres protéines de migrer lentement pour se rattraper, ce qui entraîne une bande étroite et concentrée entre les deux gels.

Quelle est la relation entre le gel d'empilement et le gel séparant?

• Le gel d'empilement et les types de gel de séparation sont utilisés dans le même appareil.

Quelle est la différence entre le gel d'empilement et le gel séparant?

Résumé - Gel d'empilement vs séparant Gel

Le gel d'empilement et le gel de séparation sont deux types de gels de polyacrylamide utilisés pour obtenir une meilleure séparation des molécules de protéines dans un échantillon donné. La différence entre le gel d'empilement et le gel de séparation est que le pH du gel d'empilement est 6.8 tandis que le pH du gel de séparation est 8.8.

Référence:

1.«Électrophorèse sur gel de polyacrylamide.”Électrophorèse sur gel de polyacrylamide (théorie): Molecular Biology Virtual Lab II: Biotechnology and Biomedical Engineering: Amrita Vishwa Vidyapeetham Virtual Lab. Disponible ici  
2.«Comment fonctionne SDS-PAGE.”Bitesize Bio, 16 février. 2018. Disponible ici
3.«Gel d'empilement SDS-PAGE - BICH 608 (Polymenis-Pettigrew)."Google Sites. Disponible ici 

Image gracieuseté:

1.«SDS-PAGE acrylamide gelby bensaccount à anglais wikipedia, (cc by 3.0) via Commons Wikimedia  
2.«Appareil d'électrophorèse sur gel» par Jeffrey M. Vinocur - propre travail, (cc-by 2.5) Via Commons Wikimedia