Les ribonucléases sont des nucléases qui dégradent spécifiquement l'ARN en unités plus petites. Ils peuvent être divisés en deux catégories; endoribonucléases et exoribonucléases. L'endoribonucléase est une endonucléase qui peut dégrader l'ARN simple brin ou double brin. Il clive les liaisons de phosphodiester dans une chaîne de polynucléotide d'ARN. Les exemples sont la RNase A, la RNase III, la RNase T1, la RNase P et la RNase H. L'exoribonucléase est une exonucléase qui a dégradé l'ARN en éliminant les nucléotides terminaux de 5'end ou 3'end de la molécule d'ARN. Les exemples sont la RNase R, la RNase II, la RNase D et le Ph. Le différence clé entre la RNase A et la RNase H est que le La RNase A est une ribonucléase pancréatique qui dégrade spécifiquement l'ARN simple brin en composants plus petits tandis que la RNase H est une enzyme non spécifique qui clive l'ARN dans l'hybride d'ARN-ADN en unités plus petites via le mécanisme hydrolytique.
1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que la RNase A
3. Qu'est-ce que la RNase H
4. Similitudes entre la RNase A et la RNase H
5. Comparaison côte à côte - rnase A vs rnase h sous forme tabulaire
6. Résumé
La RNase A est une ribonucléase pancréatique qui clive spécifiquement les résidus de cytosine et d'uracile non appariés à 3 'extrémité de l'ARN simple brin. La RNase H fonctionne à une concentration de sel plus élevée (0.Concentration de NaCl 3M ou supérieure). La réaction hydrolytique est de deux étapes. Il forme un produit phosphorylé de 3 'via 2', 3 'Cyclique monophosphate intermédiaire. Bien qu'il soit spécifique à l'ARN simple brin à une concentration plus élevée en sel, il peut également dégrader l'ARN et l'ARN double brin dans l'hybride d'ARN-ADN à une concentration de NaCl plus faible (inférieure à 0.NaCl 3M).
Bruce Merrifield a d'abord synthétisé cette enzyme. La RNase A est une enzyme très populaire dans la recherche moléculaire. La RNase A pancréatique bovine est un exemple de RNase A. Et c'est l'une des enzymes les plus robustes utilisées en laboratoire. Cette enzyme n'a pas besoin d'un cofacteur pour son activité. C'est une enzyme hautement thermostable. La RNase A est la première enzyme et la troisième protéine à laquelle une séquence d'acides aminés correcte a été détectée. Cette enzyme est très petite avec 124 acides aminés et masse moléculaire de 12600da. Et il a quatre résidus d'histidine (ses 12 et ses 119 qui impliquent une réaction catalytique).
Figure 01: la RNase A
La RNase A peut être isolée en faisant bouillir un échantillon brut. Lorsque vous bouillonne, toutes les autres enzymes dégradent la RNase A. La RNase A est une enzyme incroyablement stable. Cette enzyme inhibe avec les complexes de la protéine inhibiteur de la ribonucléase, des métaux lourds et du vanadate d'uridine.
La RNase H est une enzyme de ribonucléase non spécifique qui peut dégrader l'ARN dans l'hybride d'ARN-ADN via la réaction hydrolytique. La RNase H clive la liaison O-P de l'ARN dans un hybride d'ARN-ADN. En fin de compte, il produit des produits terminés de 3'OH et 5 'phosphate. Dans la réplication de l'ADN, il joue un rôle central en éliminant l'amorce d'ARN après la formation de nouveaux volets d'ADN. En laboratoire, il dégrade spécifiquement l'ARN dans l'ARN-ADN hybride mais pas l'ADN et l'ARN non hybride. Et cette enzyme est généralement utilisée pour détruire le modèle d'ARN après que le premier brin d'ADN complémentaire se soit formé pendant la synthèse d'ADNc.
Figure 02: RNase H
La RNase H utilise également dans les tests de protection des nucléases. Il peut également être incorporé à l'élimination de la queue de poly A de l'ARNm. La RNase H a la capacité de détruire l'ARN non codant à l'intérieur et à l'extérieur de la cellule. Les ions métalliques sont nécessaires comme cofacteurs pour cette activité protéique. Un chélateur (EDTA) peut être utilisé pour inhiber l'enzyme RNase H.
Rnase a vs rnase h | |
La RNase A est une ribonucléase pancréatique qui cligne spécifiquement l'extrémité 3 'de la cytosine non appariée et des résidus d'uracile d'ARN simple brin à une concentration de sel plus élevée. | La RNase H est une enzyme de ribonucléase non spécifique qui peut dégrader l'ARN dans l'hybride d'ARN-ADN via la réaction hydrolytique. |
Nature du clivage de l'ARN | |
La RNase A clive spécifiquement l'ARN simple brin à une concentration plus élevée de sel. | La RNase H clive l'ARN dans l'ARN-ADN hybride. |
Besoin de co-facteurs pour l'activité | |
La RNase A n'a pas besoin de cofacteurs pour son activité. | La RNase H a besoin d'ions métalliques comme cofacteurs pour son activité. |
Inhibiteurs de l'activité des protéines | |
Les complexes de la protéine inhibiteur de la ribonucléase, des métaux lourds et du vanadate d'uridine inhibent l'activité de la RNase A. | Un chélateur (EDTA) inhibe l'activité de la RNase H. |
Élimination de l'amorce d'ARN dans la réplication de l'ADN | |
La RNase A n'est pas utilisée pour l'élimination de l'amorce d'ARN dans la réplication de l'ADN. | La RNase H est utilisée pour l'élimination de l'amorce d'ARN dans la réplication de l'ADN |
Élimination de la matrice d'ADN dans la synthèse complémentaire d'ADN (C-ADN) | |
La RNase A n'est pas utilisée pour la suppression de la matrice d'ARN pendant la synthèse complémentaire d'ADN (A-ADN). | La RNase H est utilisée pour l'élimination des modèles d'ARN pendant la synthèse complémentaire d'ADN (C-ADN). |
Élimination de la poly-tail dans l'ARNm hybridé en oligo (DT) | |
La RNase A n'est pas utilisée pour éliminer la «queue poly-a» dans l'ARNm hybride en oligo (dt). | La RNase H est utilisée pour éliminer la «queue poly-a» dans l'ARNm hybride en oligo (dt) |
Les ribonucléases sont des enzymes de nucléase qui ont la capacité de cliver l'ARN en unités plus petites. Ce sont deux types; endoribonucléases et exoribonucléases. L'endoribonucléase est une endonucléase qui a la capacité de dégrader l'ARN simple brin ou double brin. Et il clive la liaison phosphodiester dans une chaîne de polynucléotide ARN. La RNase A et la RNase H sont deux endoribonucléases. La RNase A est une ribonucléase pancréatique qui clive spécifiquement des résidus de cytosine et d'uracile non appariés à 3 'extrémité de l'ARN simple brin à une concentration de sel plus élevée. La RNase H est une enzyme de ribonucléase non spécifique qui peut dégrader l'ARN dans l'hybride d'ARN-ADN via la réaction hydrolytique. C'est la différence entre la RNase A et la RNase H.
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1.Karuturi, auteur Amrutha. «17 Besoin de connaître les faits sur la rnase A.»Blog AG, 22 février. 2017. Disponible ici
2.«Ribonucléase.»Wikipedia, Wikimedia Foundation, 5 janvier. 2018. Disponible ici
1.'Rnase a'By Aucun auteur lisible par machine fourni. Vossman a assumé (sur la base des réclamations du droit d'auteur)., (CC BY-SA 2.5) Via Commons Wikimedia
2.'Rnase h fix' par aucun auteur lisible par machine fourni. Vossman a assumé (sur la base des réclamations du droit d'auteur)., (CC BY-SA 2.5) Via Commons Wikimedia