Western blot est une méthode qui permet la détection et la quantification des protéines spécifiques d'un échantillon de protéines. La fiabilité de la technique dépend de la sélection d'une membrane correcte pour l'absorption des protéines du gel. Il existe différents types de membranes microporeuses. Les membranes de nitrocellulose et de PVDF sont deux de ces membranes préférées par les chercheurs en raison de leurs attributs spéciaux sur les autres types de membranes. La sélection entre la nitrocellulose ou le PVDF est également un autre défi dans Western blot. La nitrocellulose et le PVDF ont une capacité d'absorption des protéines élevées. La principale différence entre la nitrocellulose et la membrane PVDF est que Les membranes de nitrocellulose n'ont pas la capacité de retirer les anticorps et de réutiliser la membrane pour la réprouvant des anticorps tandis que les membranes PVDF ont des capacités de décapage et de réutilisation.
CONTENU
1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que la nitrocellulose
3. Qu'est-ce que le PVDF
4. Comparaison côte à côte - nitrocellulose vs pvdf
5. Résumé
La nitrocellulose est un polymère fabriqué en traitant la cellulose avec de l'acide nitrique et est utilisé pour fabriquer des membranes microporeuses en biologie moléculaire, en particulier pour les techniques de buvard telles que le sud, le nord et l'ouest. La taille des pores des membranes de nitrocellulose varie de 3 à 20 µm. Les membranes microporeuses de nitrocellulose facilitent la détection de la réaction immunochimique se produisant à la surface de la membrane. Par conséquent, les membranes de nitrocellulose sont fréquemment utilisées pour l'immobilisation des protéines et la détection de protéines spécifiques dans Western blot. Les membranes de nitrocellulose peuvent également immobiliser les glycoprotéines et les acides nucléiques.
Les membranes de nitrocellulose sont préférées dans les tests d'écoulement latéraux en raison de plusieurs caractéristiques. Les membranes de nitrocellulose absorbent les protéines à une concentration élevée. Le solvant utilisé pour mouiller la membrane ne diminue pas l'absorption des protéines de la membrane de nitrocellulose. Les membranes de nitrocellulose peuvent être facilement coupées à la taille du gel souhaitée et des protéines de transfert du gel à la membrane par transfert électrique ou capillaire. La nitrocellulose permet un flux plus rapide de protéines à travers la membrane avec un potentiel de liaison élevé. La nitrocellulose montre une amélioration de la manipulation. Un autre attribut spécial de la membrane de nitrocellulose est qu'il peut être facilement collé avec des adhésifs non solutifs à l'eau sur divers supports en plastique.
Figure 01: membrane de nitrocellulose pour Western blot
Le difluorure de polyvinylidène (PVDF) est du fluoropolymère produit par la polymérisation du difluorure de vinylidène et a une capacité d'immobilisation élevée des protéines. Par conséquent, les membranes microporeuses fabriquées à partir de PVDF sont utilisées dans les techniques Western blot pour analyser des protéines spécifiques des mélanges de protéines. Les membranes PVDF peuvent également être utilisées pour l'analyse des acides aminés et le séquençage des protéines. La caractéristique la plus importante de la membrane PVDF sur la membrane de nitrocellulose est qu'il peut être facilement supprimé des anticorps et réutilisé pour les sondes d'anticorps ultérieures.
Les membranes PVDF sont plus épaisses que les membranes de nitrocellulose; Par conséquent, plus résistant aux dommages pendant la réutilisation. Les membranes PVDF sont très hydrophobes. Par conséquent, ils doivent être trempés dans du méthanol ou de l'isopropanol avant utilisation.
Nitrocellulose vs pvdf | |
La nitrocellulose est un polymère composé de cellulose. | Le PVDF est un fluoropolymère produit par la polymérisation du difluorure de vinylidène. |
Taille des pores membranaires | |
Les tailles de pores typiques sont 0.dix.2 ou 0.45 μ | Les tailles de pores typiques sont 0.dix.2 ou 0.45 μm |
Capacité de liaison aux protéines | |
La nitrocellulose a une capacité de liaison aux protéines de 80 à 100 μg / cm2. | Le PVDF a une capacité de liaison aux protéines de 170 à 200 μg / cm2. |
Sensibilité | |
Cela a une faible sensibilité par rapport au PVDF. | Cela a une sensibilité élevée. |
Détection de protéines exprimées faiblement | |
Étant donné que la sensibilité est faible dans les membranes de nitrocellulose, elle ne convient pas à la détection de protéines exprimées à faible. | Ceci est plus adapté à la détection de protéines exprimées faiblement en raison de sa sensibilité élevée. |
Bruit de fond | |
Cela a un bruit de fond inférieur | Cela a un bruit de fond plus élevé. |
Interactions avec les protéines | |
Les molécules de protéines se lient aux membranes de nitrocellulose par interaction hydrophobe. | Les protéines se lient aux membranes du PVDF par des interactions hydrophobes et dipolaires. |
Nature de la membrane | |
La nitrocellulose est fragile et fragile. Cependant, des versions de nitrocellulose sont disponibles, et elles sont résistantes. | Le PVDF est plus durable et a une résistance chimique plus élevée. |
Capacité à se déshabiller et à réutiliser | |
La nitrocellulose peut avoir du mal à se déshabiller et à réprouiller sans perdre le signal. | Le PVDF est idéal pour les applications de réprouvant et de séquençage. |
Pertinence | |
La nitrocellulose est idéale pour détecter les protéines de faible poids moléculaire. | Le PVDF est plus adapté pour détecter les protéines de poids moléculaire plus élevées. |
Autres utilisations | |
La nitrocellulose peut être utilisée pour l'analyse de l'acide nucléique et le buvard DOT / Slot. | Le PVDF peut être utilisé pour le séquençage des protéines et les systèmes de dosage de phase solide. |
Coût | |
C'est moins cher que les membranes PVDF. | C'est plus cher que les membranes de nitrocellulose. |
Besoin de pré-piotement | |
Les membranes de nitrocellulose ne nécessitent pas de présoakage avec du méthanol | Les membranes PVDF nécessitent un présoakage avec du méthanol. |
Les membranes de nitrocellulose ont été les premières membranes utilisées commercialement pour un test de flux latéral. Ils ont une grande capacité pour absorber les protéines. Par conséquent, les membranes de nitrocellulose sont utilisées dans Western blot. Le PVDF est un autre type de membrane utilisé dans Western blot et il a également une capacité d'absorption des protéines élevées. Les deux types sont utilisés dans Western blot pour l'analyse des protéines. Cependant, les membranes PVDF ont des attributs plus spéciaux, ce qui les rend plus appropriés que les membranes de nitrocellulose pour Western blot. Mais, les membranes de nitrocellulose conviennent plus pour détecter les protéines pondérées à faible moléculaire, les membranes PVDF sont plus adaptées pour détecter les protéines pondérées moléculaires élevées. C'est la différence entre la nitrocellulose et les membranes PVDF.
Image gracieuseté:
1.«Western blot transfert» de BensAccount à anglais wikipedia (CC par 3.0) via Commons Wikimedia
Référence:
1.Luque-Garcia, Jose L., Ge Zhou, Tung-Tien Sun et Thomas A. Neubert. «Utilisation de membranes de nitrocellulose pour la caractérisation des protéines par spectrométrie de masse de désorption / ionisation laser assistée par matrice." Chimie analytique. U.S. Bibliothèque nationale de médecine, 15 juillet 2006. la toile. 28 mars. 2017
2.«Marqueurs moléculaires et biotechnologie végétale." Livres Google. N.p., n.d. la toile. 28 mars. 2017
3.Lundi 8 avril 2013 Tweet. «La magie est dans la membrane: choisissez judicieusement pour les résultats de Western blot.»Biocompare. N.p., 08 avril. 2013. la toile. 28 mars. 2017