Différence entre l'amarrage moléculaire et la notation
Le différence clé entre l'amarrage moléculaire et la notation est que L'amarrage est une technique utilisée pour déterminer l'affinité de liaison entre deux molécules tandis que la notation est un processus d'évaluation d'une pose particulière en comptant le nombre d'interactions intermoléculaires favorables.
Les termes l'amarrage moléculaire et la notation sont utilisés dans le domaine de la modélisation moléculaire. La modélisation moléculaire est une technique utilisée pour déterminer les arrangements possibles de différentes molécules dans une substance donnée. Cette technique est importante pour créer de nouveaux composés stables.
CONTENU
1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que l'amarrage moléculaire
3. Qu'est-ce que la notation moléculaire
4. Comparaison côte à côte - amarrage moléculaire vs notation sous forme tabulaire
5. Résumé
Qu'est-ce que l'amarrage moléculaire?
L'amarrage moléculaire est une simulation de calcul d'un ligand candidat se liant à un récepteur. Cette méthode prédit l'orientation préférée d'une molécule à une autre molécule lorsqu'elle est liée les unes aux autres pour former un complexe stable. Les résultats obtenus à partir de cette technique peuvent être utilisés pour prédire la force de l'association ou de l'affinité de liaison entre deux molécules. Ici, la fonction de notation moléculaire est également importante.
Figure 01: Un schéma simple montrant le processus d'interactions moléculaires dans les systèmes biologiques
Généralement, cette technique considère les molécules biologiquement pertinentes telles que les protéines, les peptides, les acides nucléiques, les glucides et les lipides. Ces molécules sont très importantes et jouent un rôle important dans les mécanismes de transduction du signal dans notre corps. Par conséquent, l'orientation des deux molécules qui vont se lier pour ce processus de transduction du signal affecte le type de signal produit ici. Cela signifie; L'amarrage moléculaire est important pour déterminer à la fois la résistance et le type de signal produit pendant la transduction du signal dans les systèmes biologiques.
De plus, les techniques d'amarrage moléculaire sont importantes pour concevoir des médicaments basés sur la structure. Cela est dû à sa prévisibilité de la conformation de liaison de petites molécules telles que les ligands à un site de liaison approprié.
Qu'est-ce que la notation moléculaire?
La notation moléculaire est un type de fonction mathématique qui est utile pour évaluer la progression de l'amarrage moléculaire. Dans le domaine de la chimie informatique, des fonctions de notation sont utilisées pour prédire l'affinité de liaison entre deux molécules après le processus d'accueil. Par exemple, si nous avons une petite molécule d'un médicament de particules et qu'il existe une cible biologique comme une protéine, nous pouvons évaluer l'affinité du médicament vers le site de liaison. De plus, la notation moléculaire peut être utilisée pour prédire les interactions intermoléculaires entre deux protéines ou entre une protéine et des molécules d'ADN.
Figure 02: Fonction de notation en bref
L'application principale de la notation moléculaire est dans les processus de conception de médicament, par exemple, le dépistage virtuel, la conception de novo, l'optimisation du plomb, etc.
Quelle est la différence entre l'amarrage moléculaire et la notation?
L'amarrage moléculaire et la notation sont importants dans la modélisation moléculaire. La principale différence entre l'amarrage moléculaire et la notation est que l'amarrage est une technique utilisée pour déterminer l'affinité de liaison entre deux molécules tandis que la notation est un processus d'évaluation d'une pose particulière en comptant le nombre d'interactions intermoléculaires favorables.
L'infographie suivante résume la différence entre l'amarrage moléculaire et la notation.
Résumé - Anigment moléculaire vs score
L'amarrage moléculaire et la notation sont importants dans la modélisation moléculaire. La principale différence entre l'amarrage moléculaire et la notation est que l'amarrage est une technique utilisée pour déterminer l'affinité de liaison entre deux molécules tandis que la notation est un processus d'évaluation d'une pose particulière en comptant le nombre d'interactions intermoléculaires favorables.
Référence:
1. «Acosité (moléculaire).”Acosité (moléculaire) - Un aperçu | ScienceDirect Sujets, disponibles ici.
2. Dar, Ayaz Mahmood. «Acosité moléculaire: approches, types, applications et défis de base.«Omics International, Omics International, 27 mars. 2017, disponible ici.
Image gracieuseté:
1. «Acoster Représentation 2» par Scigenis - Propre travaux (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia
2. «ScoringFunction» par Poulamibarman à Anglais WikiBooks - transféré de EN.WikiBooks à Commons par Adrignola en utilisant CommonShelper (domaine public) via Commons Wikimedia
