Différence entre le séquençage hiérarchique du fusil de chasse du génome

Le différence clé Entre le séquençage hiérarchique du fusil de chasse du génome est que Dans le séquençage hiérarchique des fusils de chasse, le génome est divisé en fragments plus grands avant le séquençage tandis que, dans le séquençage du fusil de chasse du génome entier, le génome entier est divisé en petits fragments pour le séquençage.

Le séquençage est une technique importante dans les processus moléculaires, en particulier dans l'identification précise des espèces. En fait, c'est la technique d'identification de l'ordre précis des nucléotides dans un gène ou un génome. Il existe de nombreuses techniques de séquençage. Certains d'entre eux incluent la méthode Maxam Gilbert, la méthode Sanger et la méthode Sanger automatisée.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que le séquençage de fusil de chasse hiérarchique
3. Qu'est-ce que le séquençage de fusil de chasse du génome entier
4. Similitudes entre le séquençage de fusil de chasse hiérarchique et de génome entier
5. Comparaison côte à côte - séquençage hiérarchique vs fusil de chasse du génome entier sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que le séquençage de fusil de chasse hiérarchique?

Le séquençage de fusil de chasse hiérarchique est une méthode de séquençage. Il est également appelé «séquençage descendant». De plus, cette méthode se compose de deux étapes: la première étape est l'amplification du génome, et la deuxième étape est la fragmentation du génome. Dans cette méthode, le génome est d'abord cisaillé en gros fragments. Il est suivi par le clonage de ces grands fragments en divers hôtes utilisant des vecteurs ou des chromosomes artificiels. Ensuite, ces vecteurs recombinants sont disposés en bibliothèque. Pendant le séquençage du fusil de chasse, les clones de vecteur recombinant subissent un séquençage individuellement. Les fragments dans les clones subissent une digestion de restriction pour réduire davantage la taille du génome, subissant ainsi un séquençage.

Figure 01: séquençage hiérarchique du fusil de chasse

Pendant le séquençage hiérarchique des fusils de chasse, les gros morceaux de fragments doivent être organisés dans l'ordre, avant le séquençage du fusil de chasse. Il se déroule à l'aide des marqueurs moléculaires qui sont incorporés pendant le processus de clonage.

Le séquençage de fusil de chasse hiérarchique crée une carte de gène à basse résolution. Mais il crée une carte de séquence ordonnée. Ainsi, il faut une durée plus longue que le séquençage direct. L'ensemble du processus retarde en raison de la création d'une bibliothèque vectorielle recombinante. Est-ce aussi une technique à forte intensité de main-d'œuvre. Cependant, à l'heure actuelle, la technique est automatisée pour soulager le travail.

Qu'est-ce que le séquençage de fusil de chasse du génome entier?

Le séquençage du fusil de chasse du génome entier est un processus de séquençage à étape unique. Dans ce processus, le cisaillement du génome entier se déroule en premier. Après cela, chacun de ces petits fragments subit un séquençage au hasard. À la fin du séquençage, l'analyse des séquences a lieu. Pendant l'analyse des séquences, les séquences qui se chevauchent sont supprimées et l'analyse n'est pas un processus ordonné. Par conséquent, l'assemblage des séquences est un processus moins efficace par rapport au séquençage hiérarchique des fusils de chasse. Cependant, le processus du séquençage du fusil de chasse du génome entier est plus rapide, et l'analyse de l'ensemble du génome peut avoir lieu dans un seul cas.

Quelles sont les similitudes entre le séquençage de fusil de chasse hiérarchique et entier du génome?

• Le séquençage de fusil de chasse hiérarchique et du génome entier est deux approches de séquençage.
• Les deux subissent un séquençage Sanger ou des méthodes automatisées de séquençage Sanger.
• Ils sont impliqués dans le séquençage des fragments d'ADN et d'ARN.
• De plus, les deux méthodes sont importantes dans les diagnostics moléculaires et les fins de recherche.
• À l'heure actuelle, les deux techniques sont automatisées ou informatisées.
• Les deux techniques reposent sur la fragmentation du génome.

Quelle est la différence entre le séquençage de fusil de chasse hiérarchique et entier du génome?

Le séquençage de fusil de chasse hiérarchique génère des fragments de plus grande taille par rapport au séquençage de fusil de chasse du génome entier, qui fonctionne avec de petits fragments de séquences. C'est donc la principale différence entre le séquençage de fusil de chasse du génome hiérarchique et entier. En outre, le séquençage hiérarchique du fusil de chasse se compose de deux étapes majeures, tandis que le séquençage du fusil de chasse du génome entier repose sur une étape majeure.

De plus, une autre différence entre le séquençage hiérarchique et le séquençage du fusil de chasse du génome entier est que la résolution est plus élevée dans le séquençage du fusil de chasse du génome entier par rapport au séquençage hiérarchique des fusils de chasse.

L'infographie ci-dessous résume la différence entre le séquençage de fusil de chasse du génome hiérarchique et entier.

Résumé - séquençage hiérarchique vs fusil de chasse du génome entier

Le séquençage de fusil de chasse hiérarchique et entier du génome est deux techniques pour séquencer les grands génomes. La séquence hiérarchique du fusil de chasse est un processus de séquençage en deux étapes où le génome est divisé en fragments plus grands. En revanche, le séquençage du fusil de chasse du génome entier est un séquençage à étape unique où le génome est brisé en petits fragments et directement séquencé. Ainsi, c'est la principale différence entre le séquençage de fusil de chasse du génome hiérarchique et entier. De plus, les aspects techniques peuvent varier selon les deux techniques.

Référence:

1. Waterston, Robert H, et al. «Sur le séquençage du génome humain.»Actes de l'Académie nationale des sciences des États-Unis d'Amérique, l'Académie nationale des sciences, 19 mars. 2002, disponible ici.
2. Copain, shital. «Séquençage du génome.”LinkedIn Slideshare, 4 novembre. 2014, disponible ici.

Image gracieuseté:

1. «Séquençage de fusil de chasse entièrement génome contre séquençage hiérarchique de fusil de chasse» par Commins, J., Toft, c., Tarifs, m. UN. - «Méthodes de biologie informatique et leur application à la génomique comparative des bactéries symbiotiques endocellulaires d'insectes.»Biol. Procédures en ligne (2009). Consulté via springerimages (CC By-SA 2.5) Via Commons Wikimedia