Le différence clé entre les sondes d'ADN et d'ARN est que Les sondes d'ADN sont des fragments d'ADN qui sont complémentaires aux séquences nucléotidiques cibles tandis que les sondes d'ARN sont des étirements d'ARN simple brin qui sont des séquences d'acide nucléique complémentaires de séquences cibles.
Une sonde est une courte séquence de l'ADN ou de l'ARN synthétisé artificiellement qui pourrait être étiquetée radioactive ou avec des molécules non radioactives. Il peut avoir une longueur de 100 à 1000 bases. Les sondes sont utiles pour détecter les séquences nucléotidiques cibles qui sont complémentaires à la séquence de la sonde. Une fois ajoutés, les sondes sont hybrides avec les séquences complémentaires ou les séquences cibles et la rendre visible pour identifier les séquences cibles car elle transporte la radioactivité. Les sondes sont des outils moléculaires importants dans de nombreuses zones microbiennes et moléculaires telles que la détection de maladies génétiques, en virologie, en pathologie légale, dans les tests de paternité, dans l'empreinte digitale de l'ADN, le RFLP, la cytogénétique moléculaire, in situ hybridation, etc.
1. Aperçu et différence clé
2. Que sont les sondes ADN
3. Que sont les sondes d'ARN
4. Similitudes entre l'ADN et les sondes d'ARN
5. Comparaison côte à côte - sondes d'ADN vs ARN sous forme tabulaire
6. Résumé
Les sondes d'ADN sont des étirements simples d'ADN. Ils peuvent être utilisés pour détecter la présence de séquences complémentaires d'acide nucléique (séquences cibles) par hybridation. Une fois une sonde d'ADN hybride avec sa séquence complémentaire, elle forme un hybride double brin. Afin de les détecter, les sondes d'ADN sont généralement marquées avec des radio-isotopes, de la biotine, des épitopes ou des fluorophores. Les sondes d'ADN marquées avec de la biotine peuvent être détectées avec une phosphatase alcaline marquée par la streptavidine par un certain nombre de méthodes enzymatiques et chimiques.
Figure 01: sonde d'ADN
La séquence nucléotidique de la sonde d'ADN est connue. Ce sont des séquences courtes d'une longueur de 100 à 1000 paires de bases. De longues sondes ADN peuvent être générées par la technologie d'ADN recombinant. Ils peuvent également être générés par PCR et clonage. Dans les laboratoires de microbiologie clinique, les sondes d'ADN sont facilement disponibles pour le diagnostic rapide des maladies infectieuses.
Les sondes d'ARN sont des étirements simples d'ARN. Ce sont des séquences complémentaires aux séquences cibles de l'échantillon. Ils sont généralement synthétisés avec les ARN polymérases de bactériophages SP6, T7 ou T3 par in vitro transcription de l'ADN. De longues sondes d'ARN peuvent être générées par in vitro transcription à partir d'ADN plasmidique linéarisé. Généralement, les sondes d'ARN se lient fortement et plus étroites à leurs séquences complémentaires que les sondes d'ADN. Semblable aux sondes d'ADN, les sondes d'ARN peuvent également être étiquetées pendant leur transcription.
La sonde d'ADN est une courte étendue d'ADN qui est complémentaire à la séquence cible. D'un autre côté, la sonde d'ARN est un court étirement simple brin d'ARN complémentaire à la séquence cible. Ainsi, c'est la principale différence entre les sondes d'ADN et d'ARN. De plus, les sondes d'ADN contiennent A, T, C et G tandis que les sondes d'ARN contiennent A, U, C et G.
De plus, une autre différence entre les sondes d'ADN et d'ARN est leur stabilité thermodynamique. Les sondes d'ARN présentent une plus grande stabilité thermodynamique par rapport aux sondes d'ADN.
Ci-dessous les tabules infographiques les différences importantes entre les sondes d'ADN et d'ARN.
Une sonde est un petit fragment d'ADN ou d'ARN utilisé pour détecter la présence d'une séquence spécifique dans l'échantillon d'ADN ou d'ARN par hybridation moléculaire. Les sondes d'ADN sont de courtes fragments d'ADN simple brin tandis que les sondes d'ARN sont de courtes séquences d'ARN simple brin. Ce sont des séquences connues. La stabilité thermodynamique est plus élevée dans les sondes d'ARN que les sondes d'ADN. Les sondes d'ARN se lient étroitement à leurs séquences complémentaires que les sondes d'ADN se lient. Ainsi, cela résume la différence entre l'ADN et les sondes d'ARN.
1. «Sonde ARN.”Sonde d'ARN - un aperçu | ScienceDirect Sujets, disponibles ici.
1. «LightCycler sondes» (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia