Différence entre Cosmid et Phagemid

Différence entre Cosmid et Phagemid

Le différence clé Entre Cosmid et Phagemid est sur le type de séquences qu'il contient. Un cosmid contient un site cos et un plasmide. Par conséquent, il s'agit d'un vecteur hybride tandis qu'un phagémide est un plasmide qui contient une origine F1 de réplication du phage F1.

Les cosmides et les phagmides sont utilisés à des fins de clonage, en particulier pour cloner des fragments plus grands de l'ADN. Ceux-ci sont largement utilisés en particulier dans les gènes de clonage responsables de la production de diverses protéines. Les cosmides et les phagmides sont soit reproduits seuls sous forme de plasmides, soit emballés en particules virales puis répliqués.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce qu'un cosmide
3. Qu'est-ce qu'un phagcémide
4. Similitudes entre Cosmid et Phagemid
5. Comparaison côte à côte - Cosmid vs Phagemid sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce qu'un cosmide?

Un cosmide, appelé plasmide hybride, comprend des sites COS extraits de particules de phage lambda et un plasmide. Ces sites COS sont de longs fragments d'ADN avec 200 paires de bases. Par conséquent, ils ont des extrémités cohésives ou collantes qui permettent au plasmide de s'intégrer dans l'ADN viral. Par conséquent, les sites COS sont vitaux pour l'emballage de l'ADN.

Il y a trois sites COS;

  • Site COSN - impliqué dans la création du brin d'ADN par activité terminase
  • Site COSB - engagé dans la tenue de la terminase.
  • Site COSQ - impliqué dans la prévention de la dégradation de l'ADN par les DNASE.

Figure 01: Cosmid

De plus, les cosmids peuvent soit reproduire l'ADN simple brin ou l'ADN double brin en utilisant une origine de réplication appropriée. Les cosmides contiennent généralement des gènes de résistance aux antibiotiques comme marqueurs pour la sélection des transformants. Ainsi, l'utilisation d'un cosmide comme vecteur peut faciliter le clonage, et la digestion enzymatique de restriction du vecteur peut ensuite extraire ces fragments.

Qu'est-ce qu'un phagcémide (Phasmide)?

Phagémide, également appelé Phasmide, est aussi un type de vecteur hybride. Phagemid contient une origine spéciale de réplication appelée origine F1 de la réplication. L'origine F1 des extraits de réplication d'un phage F1.

Phagemid peut reproduire à la fois l'ADN simple brin et double brin. La réplication peut avoir lieu en tant que plasmide tout en subissant une réplication indépendante ou peut être emballée dans des particules de phage et enfin infecter l'hôte bactérien E coli. Lors de l'infection E coli cellules, le phage F1 nécessite la présence d'un pilus. Par conséquent, le sexe pili est important pendant in vitro Emballage des phagmides.

Quelles sont les similitudes entre Cosmid et Phagemid?

  • Cosmid et Phagemid sont tous deux des vecteurs de clonage utilisés dans la technologie d'ADN recombinant.
  • Cosmid et Phagemid peuvent reproduire l'ADN simple brin et double brin.
  • Les deux peuvent subir une réplication indépendante similaire aux plasmides.
  • Cosmid et Phagemid peuvent subir in vitro emballage et infecte les cellules bactériennes.
  • Cosmid et Phagemid nécessitent une origine de réplication appropriée pour le clonage.

Quelle est la différence entre Cosmid et Phagemid?

Cosmid vs Phagemid

Cosmid est un vecteur hybride qui contient un site cos et un plasmide. Le phagémide est un plasmide qui contient une origine F1 de réplication du phage F1.
 Présence de sites COS
Les sites COS sont présents dans Cosmid et sont nécessaires pour un emballage in vitro. Les sites COS sont absents en phagcémide.
 Présence de F1 Origine de la réplication
Dans Cosmid, l'origine de la réplication peut être présentée ou non. F1 Origine de la réplication est présente dans le phagcémide.
Présence de gènes résistants aux antibiotiques
Des gènes résistants aux antibiotiques sont présents dans les cosmides pour identifier les transformants à partir de non-transformants. Les gènes résistants aux antibiotiques sont absents dans les phagémides.
Exigence d'emballage in vitro
Nécessite un site cos. Nécessite un sexe pilus.

Résumé - Cosmid vs Phagcémide

Cosmid et Phagemid sont des vecteurs de clonage utilisés dans la technologie d'ADN recombinant. Les cosmides sont des vecteurs hybrides qui contiennent des extrémités collantes spéciales appelées sites COS. in vitro L'emballage nécessite ces sites COS. Tandis que les phagémides sont des plasmides qui contiennent une origine F1 de la réplication extraite du phage F1. Cosmid et Phagemid peuvent subir une réplication indépendante ou in vitro Emballage aux cellules bactériennes. Ce sont les différences importantes entre Cosmid et Phagemid.

Référence:

1.Qi, H, et al. «Vecteurs de phagcémides pour l'affichage des phages: propriétés, caractéristiques et construction.»Journal of Molecular Biology., U.S. Bibliothèque nationale de médecine, 30 mars. 2012. Disponible ici 
2.Collins, J et B Hohn. «Cosmides: un type de vecteur de clonage de gène plasmidique qui est emballé in vitro dans les têtes de bactériophage lambda.«Actes de l'Académie nationale des sciences des États-Unis d'Amérique, U.S. Bibliothèque nationale de médecine, sept. 1978. Disponible ici  

Image gracieuseté:

1.'Cosmid (anglais)' par Zlir'a (CC0) via Commons Wikimedia