Différence entre la marche du chromosome et le saut
Différence clé - Marche du chromosome vs saut
La marche des chromosomes et le saut de chromosomes sont deux outils techniques utilisés en biologie moléculaire pour localiser les gènes sur les chromosomes et la cartographie physique des génomes. La marche des chromosomes est une technique utilisée pour cloner un gène cible dans une bibliothèque génomique par isolement répété et clonage des clones adjacents de la bibliothèque génomique. Le saut chromosomique est une version spéciale de la marche chromosomique qui surmonte les points d'arrêt de la marche chromosomique. La marche chromosomique ne peut que séquencer et cartographier de petites longueurs de chromosomes tandis que le saut chromosomique permet le séquençage de grandes parties de chromosomes. C'est la principale différence entre la marche chromosomique et le saut chromosomique.
CONTENU
1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que la marche du chromosome
3. Qu'est-ce que le chromosome saute
4. Comparaison côte à côte - Marche du chromosome vs saut
5. Résumé
Qu'est-ce que la marche du chromosome?
La marche des chromosomes est un outil qui explore les régions de séquence inconnus des chromosomes en utilisant des fragments de restriction qui se chevauchent. Dans la marche du chromosome, une partie d'un gène connu est utilisée comme sonde et a continué à caractériser toute la longueur du chromosome à cartographier ou séquencé. Cela va du marqueur à la longueur cible. Dans la marche des chromosomes, les extrémités de chaque fragment qui se chevauchent sont utilisées pour l'hybridation afin d'identifier la séquence suivante.
Les sondes sont préparées à partir des morceaux d'extrémité d'ADN cloné et ils sont sous-clonés. Ensuite, ils sont utilisés pour trouver le prochain fragment qui se chevauche. Toutes ces séquences qui se chevauchent sont utilisées pour construire la carte génétique du chromosome et localiser les gènes cibles. Il s'agit d'une méthode d'analyse de longues étirements d'ADN par de petits fragments qui se chevauchent de la bibliothèque génomique reconnutrée.
Technique de marche du chromosome - étapes
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Isolement d'un fragment d'ADN qui contient le gène ou le marqueur connu près du gène cible
- Préparation de la carte de restriction du fragment sélectionné et sous-cloner la région finale du fragment à utiliser comme sonde
- Hybridation de la sonde avec le prochain fragment qui se chevauche
- Préparation de la carte de restriction du fragment 1 et sous-clonage de la région finale du fragment 1 à utiliser comme sonde pour l'identification du prochain fragment qui se chevauche.
- Hybridation de la sonde avec le prochain fragment de chevauchement 2
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Préparation de la carte de restriction du fragment 2 et sous-clonage de la région finale du fragment 2 pour servir de sonde pour l'identification du prochain fragment qui se chevauche
Au-dessus, les étapes doivent être poursuivies jusqu'à ce que le gène cible ou jusqu'à 3 'extrémité de la longueur totale de la séquence.
Figure 01: technique de marche du chromosome
La marche des chromosomes est un aspect important de la cytogénétique pour trouver des SNP de nombreux organismes et analyser les maladies génétiquement transmises et trouver des mutations de gènes pertinents.
Qu'est-ce que le chromosome saute?
Le saut chromosomique est une technique utilisée en biologie moléculaire pour la cartographie physique des génomes des organismes. Cette technique a été introduite pour surmonter une barrière de la marche chromosomique qui est apparue lors de la recherche des régions d'ADN répétitives pendant le processus de clonage. Par conséquent, la technique de saut chromosomique peut être considérée comme une version spéciale de la marche chromosomique. Il s'agit d'une méthode rapide par rapport à la marche chromosomique et permet de contourner les séquences d'ADN répétitives qui ne sont pas sujettes à être clonées pendant la marche chromosomique. Le saut chromosomique rétrécit l'écart entre le gène cible et les marqueurs connus disponibles pour la cartographie du génome.
L'outil de saut chromosomique commence par la coupe d'un ADN spécifique avec des endonucléases de restriction spéciales et la ligature des fragments en boucles circularisées. Ensuite, une amorce conçue à partir d'une séquence connue est utilisée pour séquencer les boucles circularisées. Cette amorce permet le saut et le séquençage d'une manière alternative. Par conséquent, il peut contourner les séquences d'ADN répétitives et traverser rapidement le chromosome pour la recherche du gène cible.
La découverte du gène code pour la maladie de la fibrose kystique a été effectuée en utilisant l'outil de saut chromosomique. Combinés ensemble, le saut et la marche chromosomiques peuvent améliorer le processus de cartographie du génome.
Figure 02: saut de chromosome
Quelle est la différence entre la marche du chromosome et le saut?
Marche du chromosome vs saut | |
| Le chromosome est un outil utilisé en biologie moléculaire pour la cartographie du génome et la localisation de gènes spécifiques. | Le saut de chromosomes est un outil utilisé pour la cartographie physique des génomes et la découverte rapide de gènes cibles dans les chromosomes. |
| Longues comparatives du séquençage | |
| Seuls les petits fragments peuvent être clonés par la marche chromosomique. | Des longueurs plus grandes des chromosomes peuvent être cartographiées par le saut chromosomique. |
| Clonage de l'ADN répétitif dans les chromosomes | |
| La technique de marche des chromosomes a du mal à se promener dans les séquences d'ADN répétitives trouvées dans les chromosomes. | Il permet de contourner les séquences d'ADN répétitives. Par conséquent, il n'y a aucune difficulté lorsqu'il les trouve pendant le séquençage. |
| Facteurs affectant les processus | |
| Le succès du processus dépend de la taille du génome et de la distance qui doit être «marchée» d'une position génomique connue vers le gène souhaité. | Le succès ne dépend pas de la taille du génome de la distance du marqueur à la cible. |
| Effets de l'ADN non cloné | |
| La marche chromosomique peut être arrêtée par des fragments d'ADN non cloné. | La note la plus basse que Piccolos peut jouer est D4. |
| Besoin d'une séquence connue | |
| Le processus commence par un gène connu près de la cible. | Le processus nécessite un fragment connu pour la conception d'amorces. |
Résumé - Marche du chromosome vs saut
La marche chromosomique est fréquemment appliquée lorsqu'il est connu qu'un gène particulier est situé près d'un gène précédemment cloné dans un chromosome et il est possible de l'identifier avec une isolement répété de clones génomiques adjacents de la bibliothèque génomique. Cependant, lorsque des régions d'ADN répétitives sont trouvées pendant la technique de marche chromosomique, le processus ne peut pas être poursuivi. Par conséquent, la technique se brise de ce point. Le saut chromosomique est un outil biologique moléculaire qui surmonte cette limitation pour la cartographie des génomes. Il contourne ces régions d'ADN répétitives difficiles à cloner et aide à la cartographie physique des génomes. C'est la principale différence entre la marche du chromosome et le saut.
Les références:
1. Nakaseko, Yukinobu, Yasuhisa Adachi, Shin-ichi Funahashi, Osami Niwa et Mitsuhiro Yanagida. «La marche des chromosomes montre une séquence répétitive très homologue présente dans toutes les régions centromères de la levure de fission."Le journal EMBO. U.S. Bibliothèque nationale de médecine, mai 1986. la toile. 22 mars. 2017
2. Taheri, Ali. «Marche et sauter des chromosomes.”Avancées en génie génétique. Omics International, 30 octobre. 2013. la toile. 22 mars. 2017
