Différence entre la ligature de l'extrémité émoussée et collante
Différence clé - Ligne blunt vs extrémité collante
Les endonucléases de restriction sont des enzymes spécifiques qui coupent l'ADN double brin (ADNsb). Ils sont également connus sous le nom de ciseaux moléculaires en biologie moléculaire. Les enzymes de restriction sont capables de reconnaître des séquences courtes spécifiques de l'ADNsb appelé sites de reconnaissance et de cliver les liaisons phosphodiester et hydrogène pour ouvrir les doubles brins. À la suite du clivage par ces enzymes, les fragments d'ADN sont produits avec différents types de extrémités telles que les extrémités collantes et les extrémités émoussées. L'ADN ligase est une enzyme utilisée en biologie moléculaire pour rejoindre deux brins adjacents d'ADN en formant de nouvelles liaisons. L'étape est connue sous le nom de ligature et selon le type de ligature de l'ADN, ils peuvent être appelés ligature de fin émoussée et ligature finale collante. La principale différence entre la ligature de l'extrémité émoussée et collante est que La ligature de l'extrémité émoussée se produit entre les fragments d'ADN qui contiennent deux extrémités émoussées alors que La ligature de l'extrémité collante se produit entre 5 'et 3' surplombs. Par rapport à la ligature de l'extrémité émoussée, la ligature finale collante est plus efficace et stable.
CONTENU
1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que la ligature de la fin émoussée
3. Qu'est-ce que la ligature finale collante
4. Comparaison côte à côte - Blunt vs ligature finale collante
5. Résumé
Qu'est-ce qu'une ligature de fin émoussée?
Certaines endonucléases de restriction peuvent couper l'ADN aux bases opposées et produire des fragments d'ADN à extrémité émoussée. Ces enzymes sont connues sous le nom de coupeurs d'extrémité émoussés; Ils s'accrochent directement au milieu du site de restriction sans laisser de bases en surplomb à un seul brin. Les extrémités émoussées sont également connues sous le nom de extrémités non-terminantes car ils n'ont pas de bases de 3 »et 5 'sur les extrémités. Les deux brins se terminent des paires de bases dans les extrémités émoussées. Les enzymes de coupe à extrémité émoussée communes sont ECORV Haeiii, ALUI et SMAI.
La ligature de l'extrémité émoussée est impliquée entre deux extrémités émoussées. Ce n'est pas une ligature de bases saillants. Cette ligature est moins efficace que la ligature finale collante. Cependant, à certaines occasions, la ligature de bout émoussée devient plus avantageuse que la ligature finale, en particulier lors de la ligature des produits de PCR. Les produits de PCR sont toujours produits avec des extrémités émoussées. La ligature de fin émoussée ne nécessite pas de fins complémentaires dans l'ADN pour la ligature.
Figure 01: Production de fin émoussée par Eco RV Enzyme
Qu'est-ce qu'une ligature finale collante?
Certaines endonucléases de restriction sont capables de couper l'ADNdb, laissant un morceau en surplomb d'ADN simple brin à la fin. Ces extrémités sont appelées extrémités collantes ou en surplomb. La ligature des extrémités collantes se produit entre deux fragments d'ADN qui contiennent des surplombs correspondants car les extrémités collantes sont possédées avec des bases non appariées et nécessitent des bases complémentaires pour former des liaisons. Par conséquent, il est nécessaire d'utiliser la même enzyme de restriction pour les deux sources d'ADN pour produire les fragments de ligature correspondants.
La ligature de l'extrémité collante est plus efficace et est souvent très souhaitable dans les processus de clonage. Il existe plusieurs enzymes de restriction qui produisent des extrémités collantes. Ce sont Ecori, Bamhi, Hindiii, etc.
Figure 02: Production de fin collante par Eco Ri Enzyme
Quelle est la différence entre la ligature finale émoussée et collante?
Blunt vs ligature finale collante | |
| La ligature de l'extrémité émoussée se produit entre deux fragments d'ADN à l'extrémité émoussée. | La ligature d'extrémité collante se produit entre deux fragments d'ADN assortis avec des extrémités collantes. |
| Enzymes | |
| Les coupeurs à extrémité émoussés produisent des extrémités émoussées. | Les coupe-extrémité collants produisent des extrémités collantes ou cohésives. |
| Besoin de fins de correspondance | |
| Il ne nécessite pas de fragments correspondants ou de bases complémentaires. | Il nécessite des bases complémentaires aux extrémités pour former des paires de bases. |
| Efficacité | |
| Il est moins efficace que la ligature finale collante | C'est plus efficace que la ligature de bout émoussée. |
Résumé - Blunt vs ligature de fin collante
Les endonucléases de restriction sont capables de cliver l'ADNdb et de produire des fragments d'ADN avec des extrémités différentes. Ils reconnaissent des séquences spécifiques et restreignent l'ADN créant des extrémités collantes et émoussées. Les extrémités collantes ont des bases non appariées à la fin des fragments. Les extrémités émoussées sont créées en raison d'un décolleté droit et ils ont des paires de bases aux extrémités. La ligature d'extrémité collante nécessite deux pièces d'ADN simples complémentaires. La ligature de l'extrémité émoussée se produit entre deux fragments d'extrémité émoussés. C'est la différence entre la ligature émoussée et collante.
Les références:
1. Roberts, Richard J. «Comment les enzymes de restriction sont devenues les chevaux de travail de la biologie moléculaire." Actes de l'Académie nationale des sciences. National Acad Sciences, n.d. la toile. 12 avril. 2017
2. Adnan, Amna. Utilisations des enzymes de restriction en biotechnologie. N.p., n.d. la toile. 12 avril. 2017
Image gracieuseté:
1. «Site de restriction ECORV.RSH »par Ramin Herati - Créé avec Inkscape (Domaine public) via Commons Wikimedia
2. «Eco Ri enzymatique de restriction» par Tinastella - propre travail (domaine public) via Commons Wikimedia
