Différence entre l'électrophorèse de gel 1D et 2D

Le différence clé Entre l'électrophorèse de gel 1D et 2D est les propriétés utilisées pour la séparation des protéines sur l'électrophorèse sur gel. L'électrophorèse sur gel 1D sépare uniquement les protéines basées sur le poids moléculaire tandis que l'électrophorèse sur gel 2D sépare les protéines basées sur son point iso-électrique et son poids moléculaire.

La séparation des protéines par électrophorèse sur gel est une technique importante pour caractériser les protéines. Les protéines ont des propriétés variables; Par conséquent, la séparation est plus complexe par rapport à la séparation de l'ADN par électrophorèse sur gel d'agarose.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que l'électrophorèse de gel 1D
3. Qu'est-ce que l'électrophorèse sur gel 2D
4. Similitudes entre l'électrophorèse sur gel 1D et 2D
5. Comparaison côte à côte - électrophorèse de gel 1D vs 2D sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que l'électrophorèse de gel 1D?

L'électrophorèse sur gel 1D, également connue sous le nom d'électrophorèse sur gel d'une dimension, est une méthode de séparation des protéines basée sur le poids moléculaire. La séparation des protéines a principalement lieu en utilisant l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide. Sur la base du concept d'électrophorèse sur gel, les molécules se séparent sur leur propriété de poids moléculaire et de charge.

Par conséquent, pour donner une charge uniforme aux protéines, un traitement de dodécyl sulfate de sodium (SDS) est effectué avant l'électrophorèse sur gel. SDS dénatur les protéines et fournit une charge négative uniforme sur la protéine; Lorsque l'application du champ électrique a lieu, les protéines migrent vers le terminal positif en fonction de leur poids moléculaire. Ainsi, en séparation, une seule propriété est considérée. C'est pourquoi cette méthode est appelée électrophorèse sur gel 1D.

Figure 01: électrophorèse sur gel 1D

Lors de l'électrophorèse sur gel 1D, les protéines sont séparées en fonction de leur poids moléculaire. À cet égard, les molécules de poids inférieur migrent plus rapidement dans le gel par rapport aux protéines de poids moléculaire élevé. Ainsi, les protéines de poids élevé restent proches des puits.

Qu'est-ce que l'électrophorèse sur gel 2D?

L'électrophorèse sur gel 2D ou l'électrophorèse sur gel bidimensionnelle sépare les protéines en fonction de deux propriétés. Les deux propriétés sont le point iso-électrique de la protéine et du poids moléculaire. Cette méthode de séparation des protéines augmente la résolution de la séparation des protéines. Le point iso-électrique de la protéine dépend du pH auquel la protéine est neutre.

Figure 02: électrophorèse sur gel 2D

Ainsi, dans l'électrophorèse sur gel 2D, la protéine peut fonctionner sur un gradient de pH fixe dans la première dimension. Dans la deuxième dimension, les protéines sont séparées en utilisant une électrophorèse sur gel de polyacrylamide vertical ou horizontal. Ainsi, les protéines se séparent en fonction de leur poids moléculaire dans la deuxième dimension.

Par ailleurs, cette méthode d'électrophorèse sur gel augmente la résolution de la séparation des protéines. Par conséquent, les protéines séparées sont plus pures. Cependant, le coût de la technique est beaucoup plus élevé qu'une électrophorèse sur gel de dimension.

Quelles sont les similitudes entre l'électrophorèse de gel 1D et 2D?

• Les deux techniques séparent les protéines.
• Par conséquent, ils sont importants pour caractériser les protéines.

Quelle est la différence entre l'électrophorèse de gel 1D et 2D?

La principale différence entre l'électrophorèse sur gel 1D et 2D est que l'électrophorèse sur gel 1D sépare les protéines basées uniquement sur le poids moléculaire tandis que l'électrophorèse sur gel 2D sépare les protéines basées sur le point iso-électrique et le poids moléculaire. En raison de cette différence fondamentale entre l'électrophorèse de gel 1D et 2D, la résolution de la séparation des protéines et le coût des deux techniques varient également. L'électrophorèse sur gel 2D montre une haute résolution que l'électrophorèse sur gel 1D. Cependant, l'électrophorèse sur gel 2D est plus coûteuse que l'électrophorèse sur gel 1D.

L'infographie ci-dessous résume la différence entre l'électrophorèse de gel 1D et 2D.

Résumé - électrophorèse de gel 1D vs 2D

La séparation des protéines repose sur de nombreux facteurs. L'électrophorèse sur gel 1D sépare les protéines basées uniquement sur le poids moléculaire. Cependant, l'électrophorèse sur gel bidimensionnelle ou 2D augmente la résolution de la séparation des protéines. De plus, l'électrophorèse sur gel 2D sépare les protéines basées sur le point iso-électrique et le poids moléculaire. Par conséquent, ces données sont importantes pour le traitement en aval des protéines et dans le domaine de la protéomique. Ainsi, c'est le résumé de la différence entre l'électrophorèse de gel 1D et 2D.

Référence:

1. Galeva, Nadezhda et Michailaltermann. «Comparaison de l'électrophorèse sur gel unidimensionnelle et bidimensionnelle comme outil de séparation pour l'analyse protéomique des microsomes hépatiques de rat: cytochromes P450 et autres protéines membranaires.”Protéomics, u.S. Bibliothèque nationale de médecine, juin 2002, disponible ici.

Image gracieuseté:

1. «Électrophorèse - Remplissant des puits de gel 1D avec mélange de protéines» par Jean-Etienne Poirrier - remplissant les puits de gel 1D avec mélange de protéines (CC BY-SA 2.0) via Commons Wikimedia
2. «Électrophorèse 2D» par Institut national de la santé - Centre de recherche sur le cancer Nanobiology Program, National Institute of Health (Domain public) via Commons Wikimedia