Quelle est la différence entre Taq et Pfu Polymérase

Quelle est la différence entre Taq et Pfu Polymérase

Le différence clé Entre Taq et Pfu polymérase Est-ce que la Taq polymérase possède une activité de relecture d'exonucléase de 5'-3 'tandis que la PFU polymérase possède une activité de relecture d'exonucléase de 3'-5'.

L'ADN polymérase catalyse la synthèse de l'ADN pendant la réplication. L'ADN polymérase utilise un brin d'ADN de matrice pour synthétiser le brin d'ADN complémentaire. En plus de sa fonction de polymérase, il aide à la relecture de l'ADN et à la réparation des dommages via son activité d'exonucléase. Taq et PFU polymérase sont deux enzymes majeures de polymérase. La polymérase Taq appartient à la famille A, tandis que la polymérase PFU appartient à la famille B. Ils sont réplicatifs et réparent des polymérases et jouent un rôle important dans une réaction en chaîne par polymérase (PCR).

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que la polymérase Taq
3. Qu'est-ce que la polymérase PFU
4. Similitudes - Taq et Pfu polymérase
5. Taq vs PFU polymérase sous forme tabulaire
6. Résumé - Taq vs PFU polymérase

Qu'est-ce que la polymérase Taq?

La Taq polymérase est une ADN polymérase thermostable 1 qui porte son nom de sa découverte du micro-organisme eubactérien thermophile Thermus aquaticus. T. aquaticus est une bactérie qui vit dans des conditions extrêmement chaudes telles que les sources chaudes et les évents hydrothermaux. Taq La polymérase est identifiée comme une enzyme résistante aux températures élevées; Par conséquent, il est largement utilisé pendant PCR. La polymérase Taq a une structure similaire à E. coli polymérase A. Il se compose d'un domaine d'exonucléase fonctionnel de 5'-3 'à la fin du terminal d'acide aminé. Les deux domaines restants agissent en coordination par mouvement de domaine couplé.

Figure 01: Taq polymérase

La température optimale de la Taq polymérase pour son activité est de 75 à 80 ° C. L'enzyme a la capacité de reproduire un brin d'ADN de 1000 pb en moins de dix secondes à 72 ° C. À 75-80 ° C, l'enzyme atteint son taux de polymérisation optimal, qui est de 150 nucléotides par seconde par molécule enzymatique. L'utilisation de Taq La polymérase facilite une spécificité élevée des amorces et réduit la production de produits non spécifiques tels que les dimères d'amorce.

Qu'est-ce que la polymérase PFU?

La Pfu polymérase est une enzyme trouvée dans l'archéon hyper-thermophile Pyrococcus furiosus. Il aide à copier l'ADN de l'organisme pendant la division cellulaire. L'enzyme appartient à la famille B de l'ADN polymérase et se compose d'un domaine d'exonucléase de 3'-5 '. Semblable à la polymérase Taq, la polymérase PFU est également utilisée pour amplifier l'ADN en PCR.

Figure 02: Pfu polymérase

La polymérase PFU a des propriétés thermostables et de relecture élevées. L'enzyme possède une activité de relecture de 3'-5 '. Par conséquent, lorsque l'ADN s'assemble de l'extrémité de 5'-3 ', l'activité d'exonucléase de la polymérase PFU aidera à éliminer les nucléotides incompatibles de la direction de 3' - 5 '. En conséquence, les fragments de PCR générés par PFU la polymérase consiste en moins d'erreurs. PFU La polymérase présente également une fidélité de réplication significativement plus élevée. Cependant, PFU La polymérase est plus lente et nécessite environ une à deux minutes par cycle pour l'amplification à 72 ° C.

Quelles sont les similitudes entre Taq et Pfu Polymérase?

  • Taq et Pfu polymérase sont des enzymes polymérases.
  • De plus, ils sont utilisés comme enzymes en PCR.
  • Les polymérases TAQ et PFU sont des enzymes thermostables.
  • Ils sont isolés d'organismes procaryotes.
  • Les deux consistent en une activité de relecture d'exonucléase.

Quelle est la différence entre Taq et Pfu Polymérase?

La Taq polymérase possède une activité de relecture d'exonucléase de 5'-3 ', tandis que la PFU polymérase possède une activité de relecture d'exonucléase de 3'-5'. Ainsi, c'est la principale différence entre Taq et Pfu polymérase. Taq polymérase est nommée d'après la bactérie Thermus aquaticus, tandis que la polymérase Pfu est nommée d'après l'archaeon Pyrococcus furiosus. De plus, la Taq polymérase appartient au groupe ADN polymérase un temps que la polymérase PFU appartient au groupe ADN polymérase B.

L'infographie ci-dessous présente les différences entre le TAQ et la polymérase PFU sous forme tabulaire pour une comparaison côte à côte.

Résumé - Taq vs PFU polymérase

Taq et PFU polymérase sont deux enzymes majeures de polymérase. La Taq polymérase possède une activité de relecture d'exonucléase de 5'-3 ', tandis que la PFU polymérase possède une activité de relecture d'exonucléase de 3'-5'. C'est la principale différence entre Taq et Pfu Polymérase. La polymérase Taq appartient à la famille A, tandis que la polymérase PFU appartient à la famille B. Ainsi, cela résume la différence entre le TAQ et la polymérase PFU.

Référence:

1. Ishino, Sonoko et Yoshizumi Ishino. «L'ADN polymérases comme réactifs utiles pour la biotechnologie» - l'histoire de la recherche sur le développement dans le domaine.”Frontiers in Microbiology, Vol. 5.
2. «ADN polymérase PFU.«Un aperçu | Sujets ScienceDirect.

Image gracieuseté:

1. «PDB 1KTQ EBI» par Jawahar Swaminathan et le personnel MSD à l'Institut européen de bioinformatique - (domaine public) via Commons Wikimedia
2. «Ribbon complexe PFU polymérase PCNA 3A2F Bio R 500” par RCSB (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia