Quelle est la différence entre le chlorhydrate de guanidine thiocyanate et de guanidine

Quelle est la différence entre le chlorhydrate de guanidine thiocyanate et de guanidine

Le différence clé Entre la guanidine thiocyanate et le chlorhydrate de guanidine est que la guanidine thiocyanate est un dénaturant protéique plus fort qui est plus couramment utilisé dans l'isolement de l'ARN, tandis que le chlorhydrate de guanidine est un dénaturant protéique plus faible qui est moins couramment utilisé dans l'isolement de l'ARN.

La dénaturation est le processus dans lequel les protéines perdent leur structure quaternaire, leur structure tertiaire et leur structure secondaire qui est normalement présente dans leur état d'origine. Il peut être fait par l'application de certains stress ou composés externes tels qu'un acide ou une base forte, un sel inorganique concentré, un solvant organique (alcool, chloroforme), agitation, rayonnement ou chaleur. Le chlorhydrate de guanidine thiocyanate et guanidine est deux types différents de dénaturants protéiques.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que le thiocyanate de guanidine 
3. Qu'est-ce que le chlorhydrate de guanidine
4. Similitudes - chlorhydrate de guanidine thiocyanate et guanidine
5. Guanidine thiocyanate vs chlorhydrate de guanidine sous forme tabulaire
6. Résumé - Guanidine thiocyanate vs chlorhydrate de guanidine

Qu'est-ce que le thiocyanate de guanidine?

Guanidine thiocyanate (GTC) est un agent dénaturant des protéines plus fort qui est plus couramment utilisé dans l'isolement de l'ARN. Il est également connu sous le nom isothiocyanate de guanidinium (Gitc). Étant un agent chaotrope, c'est un composé chimique systématiquement utilisé comme dénaturant de protéine générale. Un agent chaotrope est une molécule d'une solution d'eau qui peut perturber le réseau de liaison hydrogène entre les molécules d'eau. Cela a un effet sur la stabilité de l'état natif d'autres molécules dans la solution, comme les macromolécules comme les protéines et les acides nucléiques en affaiblissant l'effet hydrophobe. Les agents chaotropes comme la guanidine thiocyanate réduisent la quantité d'ordre dans la structure des protéines formées par des molécules d'eau à la fois dans les coquilles en vrac et d'hydratation autour des acides aminés hydrophobes. Cela peut provoquer une dénaturation des protéines.

Le thiocyanate de guanidine peut être utilisé pour désactiver les virus tels que la grippe qui provoquent des maladies comme la grippe espagnole en 1918. Par conséquent, il peut être utilisé dans les configurations médicales ou hospitalières. De plus, le thiocyanate de guanidine est également utilisé pour lyser les cellules et les particules de virus dans les extractions d'ARN et d'ADN. Ici, la fonction du thiocyanate de guanidine est d'aider à l'action de lys et d'empêcher l'activité des enzymes RNase et des enzymes DNase en dénaturant. Ces enzymes endommageraient autrement l'extrait (ARN ou ADN).

Qu'est-ce que le chlorhydrate de guanidine?

Le chlorhydrate de guanidine (GDNHCL) est un dénaturant protéique plus faible qui est moins couramment utilisé dans l'isolement de l'ARN. Il est également connu sous le nom chlorure de guanidinium (GDMCL). C'est le sel de chlorhydrate de guanidine. Le chlorhydrate de guanidine est chaotrope et l'un des dénaturants utilisés dans les études physicochimiques du repliement des protéines.

Figure 01: chlorhydrate de guanidine

Le chlorhydrate de guanidine a également la capacité de diminuer l'activité enzymatique et d'augmenter la solubilité des molécules hydrophobes. Normalement, à des concentrations plus élevées de chlorhydrate de guanidine, les protéines perdent leur structure ordonnée. Les protéines ont tendance à devenir enroulées au hasard à cette concentration de chlorhydrate de guanidine. Dans les configurations médicales ou hospitalières, le chlorhydrate de guanidine est indiqué pour la réduction des symptômes de la faiblesse musculaire et de la fatigabilité facile associée à la maladie Eaton-Lambert Syndrome. De plus, les effets secondaires de l'utilisation du chlorhydrate de guanidine peuvent inclure le péristaltisme, la diarrhée et la suppression mortelle de la moelle osseuse.

Quelles sont les similitudes entre le chlorhydrate de guanidine thiocyanate et de guanidine?

  • Le chlorhydrate de guanidine thiocyanate et guanidine est deux types différents de dénaturants protéiques.
  • Les deux dénaturants ont de la guanidine dans leurs structures.
  • Ce sont des agents chaotropes.
  • Les deux dénaturants peuvent être utilisés pour l'isolement de l'ARN.
  • Ils sont tous deux utilisés dans les configurations médicales ou hospitalières.

Quelle est la différence entre le chlorhydrate de guanidine thiocyanate et de guanidine?

Le thiocyanate de guanidine est un agent dénaturant de protéines plus fort qui est plus couramment utilisé dans l'isolement de l'ARN, tandis que le chlorhydrate de guanidine est un dénaturant protéique plus faible qui est moins couramment utilisé dans l'isolement de l'ARN. Ainsi, c'est la principale différence entre le chlorhydrate de guanidine thiocyanate et de guanidine. De plus, la formule chimique du thiocyanate de guanidine est c2H6N4S, tandis que la formule chimique de la chlorhydrate de guanidine est ch5N3.HCL.

L'infographie ci-dessous présente les différences entre le chlorhydrate de guanidine thiocyanate et de guanidine sous forme tabulaire pour comparaison côte à côte.

Résumé - Guanidine thiocyanate vs chlorhydrate de guanidine

Le chlorhydrate de guanidine thiocyanate et guanidine est deux types différents de dénaturants protéiques. Les deux dénaturants sont des chaotropes. Le thiocyanate de guanidine est un agent dénaturant de protéines plus fort qui est plus couramment utilisé dans l'isolement de l'ARN, tandis que le chlorhydrate de guanidine est un dénaturant protéique plus faible qui est moins couramment utilisé dans l'isolement de l'ARN. Donc, cela résume la différence entre le chlorhydrate de guanidine thiocyanate et de guanidine.

Référence:

1. «Thiocyanate de guanidinium.«Un aperçu | Sujets ScienceDirect.
2 «chlorhydrate de guanidine.»Information du Centre national pour la biotechnologie. Base de données de composés PubChem, u.S. Bibliothèque nationale de médecine.

Image gracieuseté:

1. «Sprox» par Sgold626 - Propre travaux (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia