Quelle est la différence entre le CRRNA tracrRNA et GRNA

Le différence clé Entre le CRRNA tracrrA et l'ARNNA est que l'ARNr est l'un des deux types d'ARN de CRISPR, qui est complémentaire à la séquence d'ADN cible, tandis que le tracrrA est le deuxième type d'ARN de CRISPR, qui sert d'échafaudage de liaison pour la nuclease CAS et L'ARNm est l'une des deux principales composantes du système CRISPR-CAS9 de bactéries et d'archéa qui reconnaît l'ADN cible et guide les protéines CAS pour faire des ruptures de double brin dans l'ADN cible.

Crispr représente Répéties palindromiques courtes entrecoupées régulières en grappe. C'est l'un des systèmes immunitaires des bactéries et des archées. Les bactéries et les archées utilisent ce système pour se protéger des agents pathogènes viraux. C'est l'un des mécanismes les plus étonnants qui implique une modification génétique réussie. Ce mécanisme (CRISPR-CAS9) est utilisé comme nouvel outil d'édition de gène en biotechnologie. Il a apporté de nouvelles avancées à la biotechnologie, en particulier dans le domaine du génie génétique.

Il y a deux composantes principales du système CRISPR-CAS9. Ce sont des nucléases Guide de l'ARN (ARNm) et associées à CRISPR (CAS). L'ARN guide est une séquence d'ARN spécifique qui guide les protéines CAS pour cliver l'ADN cible. L'ARN guide se compose de deux types d'ARN. Ce sont l'ARN CRISPR (CRRNA) et le tracrrA. Les nucléases associées à CRISPR (CAS) sont des endonucléases non spécifiques qui font des ruptures de double brin dans l'ADN cible. En faisant des ruptures de double brin dans l'ADN cible, les bactéries et les archées dirigent leurs mécanismes de réparation endogènes pour inactiver l'ADN viral.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que le CRRNA  
3. Qu'est-ce que le tracrrna 
4. Qu'est-ce que GRNA
5. Similitudes - CRRNA tracrrA et GRNA
6. CRRNA vs tracrrA vs GRNA sous forme tabulaire
7. Résumé - CRRNA vs tracrrA vs GRNA

Qu'est-ce que le CRRNA?

L'ARN CRRNA ou CRISPR est l'un des deux types d'ARN guide. Structurellement, c'est une séquence nucléotidique 17-20. La caractéristique la plus précieuse du CRRNA est qu'elle est complémentaire à l'ADN cible. Par conséquent, le CRRNA correspond à la séquence d'ADN viral. La spécificité du système CRISPR-CAS 9 dépend du CRRNA. Dans les bactéries, le CRRNA existe fusionné à la séquence du tracrrA, qui est le deuxième type d'ARN CRISPR. La production d'ARRNA est déclenchée par la réexposition aux bactéries à un virus. Lorsqu'elle est exposée, la transcription du gène codant pour l'ARNr a lieu. Ensuite, le mécanisme de défense commence contre le virus.

Figure 01: Système CRISPR-CAS9

Qu'est-ce que le tracrrna?

Le CRRNA ou le tracrrA transformateur est la deuxième partie de l'ARN de Guidherna ou CRISPR. Il est prononcé comme l'ARN traceur.  Le tracrrA sert d'échafaudage de liaison pour la protéine Endonucléase CAS 9. En d'autres termes, TracrrNA fonctionne comme la poignée pour guider Cas9 vers l'ADN cible. Structurellement, le tracrrA a 42 nucléotides. Il existe combiné avec le CRRNA.

Qu'est-ce que GRNA?

Guide ARN ou ARNm est l'une des deux principales composantes du système immunitaire CRISPR-CAS9. Il s'agit d'une séquence d'ARN spécifique composée de deux éléments: CRRNA et tracrrA. L'ARNm reconnaît l'ADN cible et dirige les protéines CAS pour faire des ruptures de double brin dans l'ADN cible. Afin de le faire, l'ARNrs se compose d'une séquence complémentaire d'ADN cible tandis que le tracrrA guide les protéines CAS travaillant comme poignée.

Figure 02: GRNA

La conception de l'ARNt correct est une étape critique dans l'outil d'édition de gène CRISPR-CAS9. Par conséquent, le succès et l'efficacité d'édition du système CRISPR dépendent de la séquence correcte de l'ARNA. L'ARNA peut être exprimé dans les cellules à partir d'un plasmide transfecté. Lorsque des plasmides clonés sont introduits dans les cellules, les cellules hôtes génèrent de l'ARNg. L'ARNm le plus couramment généré comprend 100 paires de bases.

Quelles sont les similitudes entre le CRRNA tracrrA et GRNA?

• L'arRNA, le tracrrA et l'ARNn sont des séquences d'ARN trouvées dans les bactéries et les archées.
• Ils appartiennent tous au système CRISPR.
• L'ARNm est fabriqué à partir de CRRNA et de tracrrA.
• Ils sont impliqués dans la reconnaissance de l'ADN bactériophage et guidant les endonucléases vers l'ADN cible.
• Par conséquent, les trois types d'ARN sont impliqués dans la direction de la nucléase Cas9 pour faire des ruptures à double brin dans les matériaux génétiques étrangers envahisseurs.
• Le succès de l'expérience CRISPR dépend des trois types d'ARN.

Quelle est la différence entre le CRRNA tracrRNA et GRNA?

L'ARRNA fait partie de l'ARNg de CRISPR qui est complémentaire à l'ADN cible, tandis que le tracrrA est la deuxième partie de l'ARNm, qui sert d'échafaudage de liaison à la nucléase CAS. L'ARNm est la combinaison de l'ARNr et du tracrrA, et c'est l'une des deux composantes du système CRISPR-CAS9, qui reconnaît l'ADN cible et guide les nucléases pour faire des ruptures de double brin dans l'ADN cible. Donc, c'est la principale différence entre CRRNA tracrrA et GRNA.

Le tableau suivant résume la différence entre le CRRNA tracrrA et GRNA.

Résumé - CRRNA vs tracrrA vs GRNA

Le système CRISPR-CAS9 est un système immunitaire de bactéries et d'archéa. Ce système est utilisé comme outil d'édition de gène en biotechnologie. CRISPR se compose de deux types d'ARN, à savoir l'ARN CRISPR (CRRNA) et l'ARN CRISPR transactivant (tracrrA). Ils sont collectivement connus sous le nom de Guiderna ou GRNA. Cet ARN reconnaît les séquences cibles des agents pathogènes envahisseurs et guide les endonucléases pour faire des ruptures à double brin dans l'ADN cible. Une fois que les ruptures à double brin sont effectuées dans le matériel génétique étranger, le mécanisme de réparation endogène (fin non homologue; NHEJ) inactive l'ADN étranger en introduisant des mutations. Ainsi, cela résume la différence entre le CRRNA tracrRNA et l'ARNN.

Référence:

1. «Guide ARN.«Un aperçu | Sujets ScienceDirect.
2. Karvelis, Tautvydas, et al. «Guide du CRRNA et du tracrrnA, interférence d'ADN médiée par CAS9 à Streptococcus thermophilus.»Biologie de l'ARN, Landes Bioscience, mai 2013.

Image gracieuseté:

1. «Mode d'action CRISPR-CAS9» par Viktoriaanselm - Propre travaux (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia
2. «GRNA-CAS9» par Marius Walter - Fichier: GRNA-CAS9.PNG (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia