Quelle est la différence entre l'électrophorèse sur gel d'agarose et de polyacrylamide

Quelle est la différence entre l'électrophorèse sur gel d'agarose et de polyacrylamide

Le différence clé Entre l'agarose et l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide Est-ce que l'électrophorèse sur gel d'agarose utilise des gels d'agarose versés horizontalement pour séparer les fragments relativement plus grands d'ADN, tandis que l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide utilise des gels de polyacrylamide versés verticalement pour séparer les fragments d'acide nucléique plus courts.

L'électrophorèse est un type de technique qui utilise un champ électrique appliqué à travers une matrice de gel pour séparer les biomolécules comme l'ADN, l'ARN et les protéines. Cette séparation des biomolécules telles que l'ADN, l'ARN et les protéines par électrophorèse est basée sur la charge et la taille. Les échantillons sont chargés dans les puits du gel. Plus tard, le champ électrique est appliqué à travers le gel. Le champ provoque des molécules chargées négativement à se déplacer vers l'électrode positive. La matrice de gel agit comme un tamis moléculaire à travers lequel les plus petites molécules passent ou se déplacent rapidement tandis que les plus grandes molécules se déplacent lentement. Cela permet la séparation des molécules en fonction de la charge et de la taille. Par conséquent, l'électrophorèse sur gel d'agarose et de polyacrylamide est deux types de techniques d'électrophorèse sur gel qui aident principalement à séparer les molécules en fonction de leur taille et de leur charge.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que l'électrophorèse sur gel d'agarose
3. Qu'est-ce que l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide
4. Similitudes - électrophorèse sur gel d'agarose et de polyacrylamide
5. Agarose vs électrophorèse sur gel de polyacrylamide sous forme tabulaire
6. Résumé - Agarose vs électrophorèse sur gel de polyacrylamide

Qu'est-ce que l'électrophorèse sur gel d'agarose?

L'électrophorèse sur gel d'agarose est une technique qui utilise des gels d'agarose pour séparer les biomolécules telles que l'ADN et l'ARN. C'est une technique utilisée pour séparer les acides nucléiques principalement par taille. Le composé principal appelé agarose utilisé dans cette technique est un polysaccharide. Il vient des algues. L'agarose peut être dissoute dans un tampon d'ébullition, puis peut être versée dans un plateau qui est maintenu horizontalement. Dans le plateau, il se solidifie lorsqu'il se refroidit pour former une dalle. Les gels d'agarose sont versés avec un peigne en place pour faire des puits dans lesquels des acides nucléiques tels que l'ADN ou l'ARN sont chargés une fois que le gel s'est solidifié.

Figure 01: électrophorèse sur gel d'agarose

Le gel est plus tard immergé dans un tampon approprié, et un courant est appliqué à travers le gel. L'ADN a une charge négative uniforme qui est indépendante de la composition de séquence de la molécule. Par conséquent, les molécules d'ADN migreront de la cathode (-) vers l'anode (+). Le taux de migration dépend directement de la taille de la molécule. Les plus grandes macromolécules ont le plus de mal à naviguer dans le gel. D'un autre côté, les plus petites macromolécules se glissent rapidement à travers le gel et assez facilement.

Qu'est-ce que l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide?

L'électrophorèse sur gel de polyacrylamide (page) est une technique qui utilise des gels de polyacrylamide pour séparer les biomolécules. Il s'agit d'une technique qui est largement utilisée pour séparer les macromolécules biologiques, généralement des protéines et des acides nucléiques, selon leur mobilité électrophorétique. L'hydratation de l'acrylonitrile entraîne la formation de molécules d'acrylamide par nitrile hydratase. L'acrylamide est soluble dans l'eau et lors de l'ajout d'initiateurs radicaux libres, l'acrylamide polymérise, entraînant la formation de gel de polyacrylamide. Normalement, des concentrations accrues d'acrylamide entraînent une diminution de la taille des pores dans le gel. Les gels de polyacrylamide sont versés verticalement, contrairement aux gels d'agarose.

Figure 02: électrophorèse sur gel de polyacrylamide

Dans l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide, les molécules peuvent fonctionner dans leur état d'origine, préservant la structure d'ordre supérieur des molécules. Cette méthode est appelée page native. Alternativement, un dénaturant chimique peut également être ajouté pour éliminer la structure d'ordre supérieur et transformer la molécule en une molécule non structurée dont la mobilité ne dépend que de sa longueur. Ce type est appelé SDS-PAGE.

Quelles sont les similitudes entre l'agarose et l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide?

  • L'agarose et l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide sont deux types de techniques d'électrophorèse sur gel.
  • En fait, ce sont des techniques biologiques moléculaires.
  • Les deux techniques sont utilisées pour détecter les macromolécules biologiques comme l'ADN et les protéines.
  • Ces techniques sont réalisées par des techniciens ou des chercheurs qualifiés.
  • Dans les deux techniques, la séparation des macromolécules est basée sur la charge et la taille.
  • Les deux techniques permettent la séparation des acides nucléiques comme l'ADN et l'ARN.

Quelle est la différence entre l'électrophorèse sur gel d'agarose et de polyacrylamide?

L'électrophorèse sur gel d'agarose est une technique qui utilise des gels d'agarose versés horizontalement pour séparer les biomolécules, tandis que l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide est une technique qui utilise des gels de polyacrylamide versés verticalement pour séparer les biomolécules. C'est la principale différence entre l'électrophorèse sur gel d'agarose et de polyacrylamide. En outre, une électrophorèse sur gel d'agarose est utilisée pour la séparation de l'ADN et de l'ARN, tandis que l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide est utilisée pour la séparation des acides nucléiques tels que l'ADN, l'ARN ou les protéines.

Le tableau suivant résume la différence entre l'électrophorèse sur gel d'agarose et de polyacrylamide.

Résumé - Agarose vs électrophorèse sur gel de polyacrylamide

L'agarose et l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide sont deux types de techniques d'électrophorèse sur gel utilisées dans les laboratoires de biologie moléculaire. L'électrophorèse sur gel d'agarose utilise un gel d'agarose pour séparer les biomolécules. L'agarose n'est généralement pas toxique pour les humains, tandis que le polyacrylamide est toxique pour l'homme. De plus, l'électrophorèse sur gel d'agarose montre une faible résolution tandis que l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide montre une résolution plus. L'électrophorèse sur gel de polyacrylamide utilise un gel de polyacrylamide pour séparer les biomolécules. Cela résume la différence entre l'agarose et l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide

 Référence:

1. «Électrophorèse sur gel d'agarose.«Un aperçu | Sujets ScienceDirect.
2. «Électrophorèse sur gel de polyacrylamide.«Un aperçu | Sujets ScienceDirect.

Image gracieuseté:

1. «Électrophorèse sur gel d'agarose» par PlaxColab (CC par 2.0) via Flickr
2. «Électrophorèse sur gel de polyacrylamide des protéines» par Jean-Etienne Minh-Duy Poirrier de Bruxelles, Belgique - Protéines dans une électrophorèse sur gel 1D (CC By-SA 2.0) via Commons Wikimedia