Différence entre vnttr et str

Différence entre vnttr et str

Différence clé - vnttr vs str
 

Les études ADN ont une immense utilité pour comprendre et déterminer les relations phylogénétiques, diagnostiquer les maladies génétiques et cartographier les génomes de l'organisme. Plusieurs techniques associées à l'analyse d'ADN sont utilisées pour l'identification d'un gène particulier ou d'une séquence d'ADN dans un pool d'ADN inconnu. Ils sont connus sous le nom de marqueurs génétiques. Des marqueurs génétiques sont utilisés en biologie moléculaire pour identifier la variation génétique entre les individus et les espèces. Nombre variable Répéter en tandem (VNTR) et la répétition en tandem courte (STR) sont deux types de marqueurs génétiques qui montrent le polymorphisme chez les individus. Les deux types sont l'ADN répétitif non codants qui sont des répétitions en tandem. Ils sont disposés de manière frontale en chromosomes. VNTR est une section du génome où la séquence nucléotidique courte est répétée plusieurs fois. STR est une autre section de l'ADN dans le génome qui est organisée comme des unités répétitives constituées de deux à treize nucléotides en cent fois. La principale différence entre VNTR et STR est le nombre de nucléotides dans une séquence répétitive. Les unités répétitives de VNTR se compose de 10 à 100 nucléotides tandis que l'unité répétée de STR se compose de 2 à 13 nucléotides. VNTR et STR sont largement utilisés dans les études médico-légales.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que vnttr 
3. Qu'est-ce que Str
4. Similitudes entre VNTR et STR
5. Comparaison côte à côte - vnttr vs str sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que vnttr?

Une répétition en tandem est une courte séquence d'ADN qui est répétée de la mode tête à queue à un locus chromosomique spécifique. Il n'y a pas d'autre séquence ou nucléotide dans la répétition en tandem. Il existe plusieurs types de répétitions en tandem dans le génome. VNTR est un type de répétition en tandem parmi eux qui a des unités répétitives composées de 10 à 100 nucléotides. VNTR est un type de miniisatellite. Ces répétitions en tandem peuvent être trouvées dans de nombreux chromosomes. Ils sont entrecoupés dans le génome humain et sont situés principalement dans les régions subléomériques des chromosomes.

 Les VNTR montrent un polymorphisme répété en tandem chez les individus. La longueur du VNTR dans un emplacement particulier du chromosome est très variable entre les individus en raison de la variation du nombre d'unités répétitives organisées dans cette section d'ADN. Par conséquent, le VNTR peut être utilisé comme un outil puissant dans l'identification des individus et l'analyse VNTR est utilisée dans de nombreux domaines, notamment la génétique, la recherche en biologie, la criminalistique et l'impression de doigts d'ADN. Les VNTR ont été les premiers marqueurs génétiques utilisés pour quantifier la greffe de greffe de moelle osseuse.  Les VNTR étaient également les premiers marqueurs polymorphes utilisés dans le profilage de l'ADN en médecine légale.

Figure 01: Variation des VNTR chez six individus

L'analyse VNTR est effectuée via le polymorphisme de longueur de fragment de restriction suivi de l'hybridation sud. Par conséquent, il a besoin relativement d'un gros échantillon d'ADN. L'interprétation du profil VNTR est également problématique. En raison de ces limites, l'utilisation du VNTR dans la génétique médico-légale a été limitée et elle est remplacée par l'analyse STR.

Qu'est-ce que Str?

STR est une section d'ADN hautement répétitive qui se compose de deux à treize unités répétitives nucléotidiques organisées de manière tandem. Str est similaire à Vntr. Mais il varie du VNTR du nombre de nucléotides dans une séquence répétitive et du nombre de répétitions. Str est un type de microsatellite.

Analyse STR impliquée dans la mesure du nombre exact d'unités répétitives. Les STR sont très variables parmi les individus, similaires aux VNT. Les profils STR diffèrent d'une personne à l'autre. Par conséquent, l'analyse STR est utilisée en biologie moléculaire pour comparer des loci spécifiques sur l'ADN à partir de deux échantillons ou plus. Les STR sont donc considérés comme de puissants marqueurs génétiques en biologie moléculaire. Il fournit un excellent outil d'identification des individus en raison de leur haut degré de polymorphisme et de longueur relativement courte.

À l'heure actuelle, les STR sont l'outil de polymorphisme génétique analysé le plus couramment utilisé dans la génétique médico-légale. La plupart des cas de critère impliquent une analyse polymorphe STR. STR LOCI est réparti dans tout le génome. Il existe des milliers de STR situés dans des chromosomes qui peuvent être utilisés dans l'analyse médico-légale. L'analyse STR n'implique pas le polymorphisme de la longueur de restriction comme l'analyse VNTR. L'analyse STR ne coupe pas l'ADN avec des enzymes de restriction. Des sondes spécifiques sont utilisées pour fixer les régions souhaitées sur l'ADN et en utilisant la technique de PCR, les longueurs du STR sont déterminées.

Figure 02: Variation STR entre les échantillons

Quelles sont les similitudes entre VNTR et STR?

  • VNTR et STR sont l'ADN non codants.
  • Les deux sont des répétitions en tandem.
  • Les deux montrent le polymorphisme chez les individus en raison de la différence de durée de la section ADN.
  • Les deux sont utilisés comme puissants marqueurs génétiques dans l'impression de doigt d'ADN et dans les études médico-légales.

Quelle est la différence entre VNTR et STR?

Vnttr vs str

VNTR est un ADN répétitif non codant qui a une séquence nucléotidique courte répétée en tandem. STR est une section d'ADN hautement répétitive qui se compose de deux à treize unités répétitives nucléotidiques organisées de manière tandem.
Taille
Les VNTR sont plus grands que les STR. Les STR sont plus petits que les VNTR.
Nombre de nucléotides dans la séquence répétée
L'unité répétitive de VNTR se compose de 10 à 100 nucléotides. L'unité répétitive de STR se compose de 2 à 13 nucléotides.

Résumé - vnttr vs str

VNTR et STR sont deux puissants marqueurs génétiques utilisés en biologie moléculaire, en particulier dans le domaine de la génétique médico-légale. VNTR est un type de miniisatellite et STR est un microsatellite. VNTR et STR sont ADN non codants et hautement répétitifs. Ce sont des répétitions en tandem. La structure générale de VNTR et STR est la même. Cependant, le nombre de nucléotides dans la séquence répétitive et la longueur sont différentes. VNTR a des séquences répétitives de 10 à 100 nucléotides. Str a des séquences répétitives constituées de 2 à 13 nucléotides. C'est la différence entre VNTR et STR.

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Les références:

1. «La science de la génétique médico-légale.»CRG - Conseil pour la génétique responsable. N.p., n.d. la toile. Disponible ici. 10 juillet 2017.
2. «Analyse STR." Wikipédia. Fondation Wikimedia, 22 mars. 2017. la toile. Disponible ici. 10 juillet 2017.

Image gracieuseté:

1. «D1S80Demo» par Palewhalegail à l'anglais Wikipedia (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia