Différence entre la protéomique ciblée et non ciblée

La principale différence entre la protéomique ciblée et non ciblée est que le La protéomique ciblée vise à mesurer l'abondance d'une protéine spécifique tandis que la protéomique non ciblée ne cible pas une protéine spécifique.

La protéomique est l'étude à grande échelle des protéines, de leurs structures et des fonctions. Il étudie l'ensemble du complément de protéines dans une cellule, un tissu ou un organisme dans des conditions spécifiques. Il existe deux types de protéomique en tant que protéomique ciblée et protéomique non ciblée.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que la protéomique ciblée
3. Qu'est-ce que la protéomique non ciblée
4. Similitudes entre la protéomique ciblée et non ciblée
5. Comparaison côte à côte - Protéomique ciblée vs non ciblée sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce que la protéomique ciblée?

Comme son nom l'indique, la protéomique ciblée cible une protéine spécifique ou un peptide dans un mélange complexe de protéines pour l'analyse. Ensuite, il analyse la présence et la quantité de cette protéine spécifique présélectionnée. Cette méthode est possible pour un seul échantillon ou sur plusieurs échantillons. Cette méthode convient même pour un groupe spécifique de protéines. Il en résulte des données plus précises, quantitatives et sensibles. De plus, la spectrométrie de masse associée à une protéomique ciblée produit des mesures fiables plus précises. Cette méthode utilise le spectromètre de masse triple quadrupol (QQQ) pour son analyse.

Figure 01: Protéomique

La protéomique ciblée est une méthode appropriée si vous souhaitez vérifier si une cible knockdown est réellement renversée ou lorsque vous souhaitez quantifier une protéine / peptide particulière dans le sérum sanguin, le liquide cérébral ou le lysat cellulaire, etc. Vous pouvez également l'utiliser si vous souhaitez vérifier si une protéine particulière est exprimée de manière différentielle entre les échantillons ou pendant une expérience dans le temps.

Qu'est-ce que la protéomique non ciblée?

La protéomique non ciblée, comme le nom le nom, ne cible pas une protéine ou un peptide spécifique pour son analyse. Discovery Proteomics est un autre nom pour la protéomique non ciblée. En fait, c'est une analyse plus «globale». Généralement, la réalisation de la protéomique non ciblée est de répondre à la question «quelles protéines ou protéines sont dans cet échantillon ou plusieurs échantillons?". Cette méthode n'est pas sensible comme protéomique ciblée. Mais il peut identifier et mesurer de nombreuses protéines, y compris de nouvelles protéines. La protéomique non ciblée peut produire des mesures quantitatives et qualitatives.

Quelles sont les similitudes entre la protéomique ciblée et non ciblée?

• La protéomique ciblée et non ciblée mesurent les protéines dans les échantillons.
• Ils sont importants dans l'analyse du protéome.
• Ces méthodes utilisent la spectrométrie de masse.

Quelle est la différence entre la protéomique ciblée et non ciblée?

Premièrement, la protéomique ciblée est la détermination de la présence et de la quantité d'une protéine ou d'un peptide particulier dans un mélange complexe de protéines. En revanche, la protéomique non ciblée est l'étude quantitative et qualitative des protéines présentes dans un échantillon ou des échantillons sans cibler une protéine particulière. La protéomique ciblée est réalisée avec des protéines présélectionnées ou ciblées tandis que la protéomique non ciblée est effectuée pour découvrir les types de protéines dans cet échantillon. De plus, la protéomique ciblée est plus sensible que la protéomique non ciblée.

Résumé - Cibler vs protéomique non ciblée

Pour résumer, la protéomique ciblée et non ciblée sont deux types d'études de protéines. Comme leurs noms le suggèrent, la protéomique ciblée cible une protéine spécifique tandis que la protéomique non ciblée ne cible pas une protéine spécifique. C'est la différence entre la protéomique ciblée et non ciblée.

Référence:

1. «Protéomique ciblée.”UC Davis Proteomics Core, disponible ici.
2. «Protéomique / introduction à la protéomique.»Théorie / modes de la musique - WikiBooks, livres ouverts pour un monde ouvert, disponible ici.

Image gracieuseté:

1.«Protéomics» par xxl7441 à l'anglais wikibooks - transféré à partir de EN.WikiBooks à Commons (Domaine public) via Commons Wikimedia