Différence entre l'amorce et le promoteur

Le différence clé entre l'amorce et le promoteur est que L'amorce est une séquence d'ADN courte synthétisée commercialement qui est utilisée dans la PCR pour l'amplification d'une séquence d'ADN cible tandis que le promoteur est une séquence d'ADN spécifique qui fournit un site de liaison initial sécurisé pour l'ARN polymérase et facteurs de transcription Afin d'initier la transcription.

L'amorce et le promoteur sont deux types de séquences d'ADN. L'amorce est un petit fragment d'ADN nécessaire à la réaction en chaîne par polymérase (PCR). Il a de courtes séquences nucléotidiques complémentaires à l'extrémité flanquante du brin d'ADN. Il existe deux types d'amorces, et ils fonctionnent comme points de départ pour la synthèse de nouveaux volets ADN. En revanche, un promoteur est une séquence d'ADN spécifique située en amont du site d'initiation de transcription d'un gène. Il interagit directement avec les composants du mécanisme de transcription tels que l'ARN polymérase et les facteurs de transcription afin de contrôler la transcription de l'ADN. Par conséquent, l'ARN polymérase et d'autres facteurs de transcription se lient à la séquence du promoteur et initient la transcription.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce qu'un apprêt 
3. Qu'est-ce qu'un promoteur
4. Similitudes entre l'amorce et le promoteur
5. Comparaison côte à côte - Promateur d'amorce vs sous forme tabulaire
6. Résumé

Qu'est-ce qu'un apprêt?

Les amorces sont des séquences d'ADN courtes conçues pour l'amplification des séquences d'ADN cibles. Structurellement, ils possèdent de courtes séquences nucléotidiques complémentaires des extrémités flanquantes des doubles volets d'ADN. Ils ont généralement environ 20 nucléotides longs. Pendant la PCR, Taq polymérase catalyse l'ajout de nucléotides dans la séquence nucléotidique préexistante. Par conséquent, les amorces servent de points de départ pour la synthèse de nouveaux volets. La polymérase Taq ne fonctionne que dans une direction de 5 'à 3'. Par conséquent, la synthèse de l'ADN se déroule également dans la même direction de 5 'à 3'. Étant donné que l'ADN est double brin, deux types d'amorces sont nécessaires en PCR. Ils sont connus comme l'amorce avant et l'amorce inverse, en fonction de la direction de l'allongement de l'amorce pendant la synthèse d'ADN.

Figure 01: Primers

L'amorce vers l'avant recuit avec le brin d'ADN antisens et initie la synthèse de + brin du gène en direction de 5 'à 3'. Il a une courte séquence nucléotidique qui est complémentaire à l'extrémité flanquante du brin antisens. L'amorce inverse recuit avec le brin de sens et initie la synthèse d'un volet complémentaire du brin de codage, qui est - un brin du gène dans la direction de 5'to 3 '. Ainsi, l'amorce inverse est conçue complémentaire à l'extrémité 3 'du brin de codage. Les amorces inversées et avancées sont importantes pour la production de millions à des milliards d'exemplaires de régions particulières d'ADN qui sont ciblées ou intéressées.

Qu'est-ce qu'un promoteur?

Le promoteur est une séquence d'ADN située en amont ou à l'extrémité 5 'du site d'initiation de la transcription d'un gène. Il fournit un site de liaison pour l'ARN polymérase et certains éléments régulateurs afin d'initier la transcription du gène. C'est une séquence régulative nécessaire pour allumer ou désactiver un gène. Il y a une séquence nucléotidique spécifique dans le promoteur. Il peut avoir 100-1000 paires de bases. Le promoteur montre la direction de la transcription. De plus, il indique le brin de sens qui doit être transcrit.

Figure 02: Promoteur d'un gène

Il existe trois types d'éléments de promoteur en tant que promoteur de base, promoteur proximal et promoteur distal. Le promoteur de base est la partie minimale du promoteur requis pour initier la transcription. Il est situé le plus proximal du codon de départ. Tata Box est une région conservée trouvée dans de nombreux promoteurs de noyau eucaryotes. On trouve 25 à 35 paires de bases en amont du site de début de transcription. Le promoteur proximal se trouve plus en amont avec le promoteur de base. Généralement, il est situé 250 paires de bases en amont jusqu'au codon de départ et contient des éléments réglementaires primaires. Le promoteur distal se trouve en amont du promoteur proximal, et il contient des éléments réglementaires supplémentaires. Les promoteurs bactériens ont deux éléments de séquence courte dans leurs promoteurs. Tataat est la séquence consensus située à -10 du promoteur bactérien tandis que le ttgaca est la séquence consensus à -35. Ils sont connus sous le nom d'élément -10 et d'élément -35.

Quelles sont les similitudes entre l'amorce et le promoteur?

• L'amorce et le promoteur sont deux types de séquences d'ADN.
• Ils se composent de séquences nucléotidiques.
• L'amorce et le promoteur sont importants pour l'expression des gènes.

Quelle est la différence entre l'amorce et le promoteur?

L'amorce est une séquence nucléotidique courte conçue pour l'amplification de l'ADN cible. En revanche, le promoteur est une séquence d'ADN régulatrice spécifique trouvée en amont du site d'initiation de transcription d'un gène. Donc, c'est la principale différence entre l'amorce et le promoteur. Les amorces sont d'environ 20 paires de bases pendant que le promoteur peut avoir des paires de bases de 100 à1000. Fonctionnellement, les amorces sont servies de séquences de démarrage pour la nouvelle synthèse du brin tandis que les promoteurs contrôlent la transcription des gènes en fournissant des sites de liaison pour l'ARN polymérase et d'autres facteurs de transcription.

De plus, un promoteur est défini comme la direction de la transcription et indique le brin de sens d'un gène. Structurellement, l'amorce est une séquence d'ADN simple brin et à brin tandis que le promoteur est une longue séquence d'ADN double brin.

L'info-graphique ci-dessous tabule plus de comparaisons liées à la différence entre l'amorce et le promoteur.

Résumé - Promorateur d'amorce vs

Les amorces sont des séquences nucléotidiques courtes complémentaires des extrémités flanquantes du double brin d'ADN cible. Deux types d'amorces sont utilisés en PCR. Ils servent de séquences de démarrage pour la synthèse de nouveaux volets. Les amorces sont conçues commercialement, et ce sont des séquences stables à la température. D'un autre côté, le promoteur est une séquence de régulation d'un gène situé en amont du site d'initiation de la transcription. Les promoteurs contrôlent la transcription des gènes. Ils fournissent des sites de liaison pour l'ARN polymérase et les facteurs de transcription pour initier la transcription. Ainsi, c'est le résumé de la différence entre l'amorce et le promoteur.

Référence:

1. "Addgene: Promoteurs". Addgene.Org, 2020, disponible ici.
2. «Primer (biologie moléculaire)». En.Wikipédia.Org, 2020, disponible ici.

Image gracieuseté:

1. «Primers Revcomp» par Zephyris - Propre travaux (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. «Gene Structure Eucaryote 2 Annoted» par Thomas Shafee - Shafee T, Lowe R (2017). «Structure des gènes eucaryotes et procaryotes». Wikijournal de médecine 4 (1). Doi: 10.15347 / WJM / 2017.002. ISSN 20024436 (CC par 4.0) via Commons Wikimedia