Différence entre NGS et WGS

Le différence clé Entre NGS et WGS est que le séquençage de nouvelle génération (NGS) est une technologie de séquençage de deuxième génération massivement parallèle qui est un débit élevé, un faible coût et un rapide, tandis que le séquençage du génome entier (WGS) est une méthode complète pour analyser l'ensemble de l'ADN génomique d'une cellule en un seul moment en utilisant des techniques de séquençage telles que le séquençage Sanger, l'approche de fusil de chasse ou le séquençage NGS à haut débit.

Au cours des dernières décennies, la compréhension du génome des humains et d'autres animaux a augmenté massivement en raison de la découverte de techniques de séquençage rapides et d'outils de bioinformatique. Les techniques de séquençage conventionnelles telles que le séquençage Sanger avaient leurs limites, qui prévoyaient le développement de nouvelles méthodes de séquençage rapides telles que le séquençage de nouvelle génération (NGS) et le séquençage des nanopore. La technique du séquençage du génome entier (WGS) est une approche récente qui est déjà utilisée dans de nombreux projets de recherche génomique, tels que 100 000 projet génomique par Genomic England, Royaume-Uni. Ainsi, NGS et WGS sont deux méthodes de séquençage qui s'intègrent actuellement dans de nombreux projets génomiques.

CONTENU

1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que NGS 
3. Qu'est-ce que WGS
4. Similitudes - NGS et WGS
5. Ngs vs wgs sous forme tabulaire
6. Résumé - NGS vs WGS

Qu'est-ce que NGS?

Ngs (séquençage de nouvelle génération) est une technologie de séquençage de deuxième génération massivement parallèle qui est un débit élevé, un faible coût et. Il n'y a pas de définition précise pour le séquençage de nouvelle génération. Mais nous pouvons clairement le distinguer des techniques de séquençage capillaires conventionnelles. Le séquençage de nouvelle génération permet le séquençage d'une molécule d'ADN avec une taille totale supérieure à 1 million de paires de bases en une seule expérience. Il offre une vitesse sans précédent et des options de débit élevé, comme permettre le séquençage de l'ADN de plusieurs individus en même temps. Ceci est réalisé en miniaturisant le volume de réactions de séquençage individuelles. De plus, cela limite également la taille des instruments et minimise le coût des réactifs par réaction.

Figure 01: plates-formes NGS

NGS est une méthode de séquençage à lecture à lecture courte qui a déjà révolutionné le domaine de la recherche biologique. En outre, NGS est appliqué dans divers domaines comme le séquençage du génome de novo, le séquençage du génome entier, l'analyse du transcriptome, le séquençage de l'ARN et de micro-ARN, une redimension ciblée et un séquençage d'exome entier.

Qu'est-ce que WGS?

WGS (séquençage du génome entier) est une méthode complète pour analyser l'ensemble de l'ADN génomique d'une cellule en un seul moment en utilisant des techniques de séquençage telles que le séquençage Sanger, l'approche du fusil de chasse ou le séquençage NGS à haut débit. Il est également connu sous le nom de séquençage du génome complet ou de séquençage complet du génome. Le séquençage du génome entier implique le séquençage de tout l'ADN chromosomique d'un organisme ainsi que l'ADN dans les mitochondries, et pour les plantes, l'ADN dans le chloroplaste en un seul moment. WGS permet aux scientifiques de lire la séquence exacte de toutes les lettres qui composent l'ensemble complet d'ADN. WGS utilisant la plate-forme NGS devrait révolutionner la configuration clinique.

Figure 02: séquençage de fusil de chasse HIERARCHICAL WGS VS

Le séquençage du génome entier a été introduit dans les soins cliniques en 2014. En outre, l'application du WGS implique le séquençage des gènes au niveau du SNP pour identifier les variantes fonctionnelles dans les études d'association, l'intervention thérapeutique en médecine personnalisée, la biologie évolutive, l'analyse génomique comparative, les mutations et réarrangements, les études de variantes rares et la prévision de la sensibilité aux maladies et du médicament réponse.

Quelles sont les similitudes entre NGS et WGS?

• NGS et WGS sont deux techniques de séquençage.
• Les deux techniques séquentie l'ADN ou l'ARN.
• Ces techniques sont nouvelles et fiables.
• Ils sont tous deux utilisés pour diagnostiquer les maladies et la découverte de médicaments.

Quelle est la différence entre NGS et WGS?

NGS est une technologie de séquençage de deuxième génération massivement parallèle qui est un débit élevé, un faible coût et un speedy, tandis que WGS est une méthode complète d'analyse de l'ensemble de l'ADN génomique d'une cellule en un seul moment en utilisant des techniques de séquençage telles que le séquençage Sanger, le tir Approche ou séquençage NGS à haut débit. C'est donc la principale différence entre NGS et WGS. De plus, NGS ne se compose que de méthodes de séquençage de deuxième génération tandis que le WGS se compose de méthodes de séquençage de première, deuxième et troisième générations.

Le tableau suivant présente les différences entre et NGS et WGS sous forme tabulaire pour une comparaison côte à côte.

Résumé - NGS vs WGS

Au cours des dernières décennies, différentes techniques de séquençage ont été régulièrement appliquées dans la recherche moléculaire contemporaine. Et même ce sont des outils très puissants pour de nombreuses applications cliniques. Les NGS et les WGS sont deux méthodes de séquençage qui s'intègrent actuellement dans de nombreux projets génomiques.   NGS est une technologie de séquençage de deuxième génération qui est un débit élevé, un faible coût et. D'un autre côté, WGS est une méthode d'analyse de l'ADN génomique entier ou de l'ADN génomique complet d'une cellule en un seul moment en utilisant des techniques de séquençage telles que le séquençage de Sanger, l'approche du fusil de chasse ou le séquençage NGS à haut débit NGS. C'est donc le résumé de la différence entre NGS et WGS.

Référence:

1. Behjati, Sam et Patrick S Tarpey. «Qu'est-ce que le séquençage de prochaine génération?" Archives de maladies infantiles. Édition d'éducation et de pratique, BMJ Publishing Group.
2. «Séquençage du génome entier.«Un aperçu | Sujets ScienceDirect.

Image gracieuseté:

1. «Sequençage de 2e génération» de Chandra Shekhar Pareek, Rafal Smoczynski et Andrzej Tretyn - Journal of Applied Genetics - Volume 52 - Numéro 4 (CC By-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. «Séquençage de fusil de chasse entièrement génome contre séquençage hiérarchique de fusil de chasse» par Commins, J., Toft, c., Tarifs, m. UN. - «Méthodes de biologie informatique et leur application à la génomique comparative des bactéries symbiotiques endocellulaires d'insectes» Biol. Procédures en ligne (2009). Accessible via springerimages. (CC BY-SA 2.5) Via Commons Wikimedia