Différence entre l'exome et le transcriptome

Différence clé - Exome vs transcriptome
 

Un gène contient des régions de codage et non codantes. Les séquences de codage sont appelées exons et les séquences non codantes sont appelées introns.  La séquence nucléotidique des exons d'un gène représente le code génétique du gène pour synthétiser la protéine spécifique. Par conséquent, les exons restent dans la molécule d'ARNm. La région d'exon totale du génome est connue sous le nom d'exome, et c'est une partie importante du génome. Le code génétique des gènes est converti en code génétique de la molécule d'ARNm, qui est nécessaire pour la production de protéines. L'ensemble des molécules d'ARNm transcrites dans une cellule ou une population cellulaire à la fois est connue comme un transcriptome. La principale différence entre l'exome et le transcriptome est que L'exome représente les séquences des régions d'exon du génome alors que Le transcriptome représente l'ARNm total d'une cellule ou d'un tissu à un moment donné.

CONTENU
1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que l'exome
3. Qu'est-ce que le transcriptome
4. Comparaison côte à côte - Exome vs transcriptome
5. Résumé

Qu'est-ce que l'exome?

Les gènes sont composés d'exons, d'introns et de séquences régulatrices. Les exons sont les régions gènes qui sont transcrites dans la séquence d'ARNm pendant la transcription. Les introns et autres régions non codantes sont supprimées pendant la transcription. La séquence nucléotidique des exons détermine le code génétique du gène qui synthétise la protéine spécifique codes. Seuls les exons restent dans l'ARNm d'une protéine. La collection d'exons dans le génome est connue comme l'exome d'un organisme. Il représente une partie du génome qui est exprimée dans les gènes. Chez l'homme, l'exome compte 1% du génome. C'est la partie codant pour les protéines du génome humain.

Figure 01: Exome

Qu'est-ce que le transcriptome?

Le transcriptome est la collecte de tous les transcrits (ARN) codant et non codants (ARN) dans un tissu donné. Le transcriptome représente la collection de molécules d'ARNm total exprimées par les gènes dans une cellule ou un tissu. Le transcriptome d'une cellule peut être varié avec le transcriptome d'un autre type de cellule. Le transcriptome est également dynamique - il change avec le temps en réponse à des stimuli internes et externes. Même dans le même tissu ou dans le même type de cellule, le transcriptome peut changer après quelques minutes.

Le transcriptome diffère de l'exome d'un organisme. Le transcriptome ne comprend que les séquences d'exome exprimées. Bien que l'exome d'une cellule reste la même, le transcriptome diffère entre les cellules car l'expression des gènes n'est pas la même pour toutes les cellules ou tissus. Seuls les gènes essentiels sont exprimés dans différentes cellules et tissus. L'expression du gène est un processus spécifique de type tissulaire ou de cellule. Il est réglementé par divers facteurs, y compris les facteurs environnementaux. Par conséquent, le transcriptome peut varier avec les conditions environnementales externes.

Le transcriptome est utilisé comme précurseur pour les études de protéomique. Toutes les protéines sont dérivées de séquences d'ARNm. Les modifications de translation peuvent entraîner les changements de protéines. Cependant, le transcriptome fournit des informations de base importantes pour les études protéomiques.

Figure 02: Transcriptome des cellules souches embryonnaires

Quelle est la différence entre l'exome et le transcriptome?

Résumé - Exome vs transcriptome

Les exons sont les séquences codantes des gènes et déterminent les séquences d'ARNm des protéines. La collection de ces séquences de codage (exons) est connue comme l'exome d'un organisme. Les gènes sont transcrits dans des molécules d'ARNm avant de fabriquer des protéines. Les molécules totales d'ARNm d'une cellule ou d'un tissu à tout moment sont connues sous le nom de transcriptome. Le transcriptome représente les gènes qui sont activement exprimés en ARNm à un moment donné. Le transcriptome est spécifique aux cellules et aux tissus et affecte les conditions environnementales. C'est la différence entre l'exome et le transcriptome.

Les références:
1.Sarah et al, «Capture ciblée et séquençage massivement parallèle de douze exomes humains." Nature. U.S. Bibliothèque nationale de médecine, 10 septembre. 2009. la toile. 01 avril. 2017
2.Mutz et al. «Analyse du transcriptome utilisant le séquençage de nouvelle génération.”Elsevier: Locator de l'article. N.p., Sept. 2012. la toile. 01 avril. 2017

Image gracieuseté:
1.«Le transcriptome des cellules pluripotentes» par grskovic, m. et Ramalho-Santos, M., Le transcriptome pluripotent (10 octobre 2008), STEMBOOK, ED. La communauté de recherche sur les cellules souches, STEMBOOK, DOI / 10.3824 / STEMbook.1.24.1, http: // www.carnet de sol.org. - [1] Directstembook Figure 2 Le transcriptome des cellules pluripotentes.Grskovic, m. et Ramalho-Santos, M., Le transcriptome pluripotent (10 octobre 2008), STEMBOOK, ED. La communauté de recherche sur les cellules souches, STEMBOOK, DOI / 10.3824 / STEMbook.1.24.1, (cc par 3.0) via Commons Wikimedia